5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-(2-cyanoethoxymethyl)uridine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-(2-cyanoethoxymethyl)uridine
• 英文别名: 3-[[(2R,3S,4R,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxymethoxy]propanenitrile
• 化学式: C₃₄H₃₅N₃O₉
• 分子量: 629.667
• InChiKey: CHTUYJKJQWWPMY-PYTKSMOKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  149
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 吡啶 、 二丁基二氯化锡 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-(2-cyanoethoxymethyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  具有2'-O-（2-氰基乙氧基甲基）保护基的RNA合成新方法。

  摘要：

  已开发出一种新的合成方法，该方法以2-氰基乙氧基甲基（CEM）为2'-羟基保护基的RNA低聚物的合成。这种新方法可以合成寡核糖核苷酸，其效率和最终纯度可与DNA合成获得的效率和最终纯度相媲美。[结构：见文字]

  DOI：

  10.1021/ol051151f

文献信息

• A New RNA Synthetic Method with a 2‘-<i>O</i>-(2-Cyanoethoxymethyl) Protecting Group
  作者：Tadaaki Ohgi、Yutaka Masutomi、Kouichi Ishiyama、Hidetoshi Kitagawa、Yoshinobu Shiba、Junichi Yano

  DOI：10.1021/ol051151f

  日期：2005.8.1

  A novel method for the synthesis of RNA oligomers with 2-cyanoethoxymethyl (CEM) as the 2'-hydroxyl protecting group has been developed. The new method allows the synthesis of oligoribonucleotides with an efficiency and final purity comparable to that obtained in DNA synthesis. [structure: see text]

  已开发出一种新的合成方法，该方法以2-氰基乙氧基甲基（CEM）为2'-羟基保护基的RNA低聚物的合成。这种新方法可以合成寡核糖核苷酸，其效率和最终纯度可与DNA合成获得的效率和最终纯度相媲美。[结构：见文字]