1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-[2-(1,10-phenanthrolin-3-yl)ethynyl]pyrimidine-2,4-dione | 445310-88-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-[2-(1,10-phenanthrolin-3-yl)ethynyl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 445310-88-3
• 化学式: C₄₄H₃₆N₄O₇
• 分子量: 732.792
• InChiKey: KVPMKASUKXWSGA-LCKTVPPXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.8
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  132
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 、 1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-[2-(1,10-phenanthrolin-3-yl)ethynyl]pyrimidine-2,4-dione 在 四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.0h， 以45%的产率得到3-dimethoxytrityl-5-[(1,10-phenanthrolin-3-yl)ethynyl]-2'-deoxyuridine phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Fluorescent 1,10-Phenanthroline-Containing Oligonucleotides Distinguish between Perfect and Mismatched Base Pairing

  摘要：

  [GRAPHICS]A fluorescent deoxyuridine analogue is sensitive to the polarity of its environment and exhibits a distinct emission profile in single- vs double-stranded oligonucleotides. Emission-monitored denaturation curves of internally modified dU(phen) duplexes are characteristic of the base opposite dU(phen) and distinguish between perfect and mismatched complementary oligonucleotides.

  DOI：

  10.1021/ol026043x
• 作为产物：
  描述：

  4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 1,1'-双(二苯膦基)二茂铁二氯化钯(II)二氯甲烷复合物 4-二甲氨基吡啶 、 copper(l) iodide 、 三乙胺 作用下， 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-[2-(1,10-phenanthrolin-3-yl)ethynyl]pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  Fluorescent 1,10-Phenanthroline-Containing Oligonucleotides Distinguish between Perfect and Mismatched Base Pairing

  摘要：

  [GRAPHICS]A fluorescent deoxyuridine analogue is sensitive to the polarity of its environment and exhibits a distinct emission profile in single- vs double-stranded oligonucleotides. Emission-monitored denaturation curves of internally modified dU(phen) duplexes are characteristic of the base opposite dU(phen) and distinguish between perfect and mismatched complementary oligonucleotides.

  DOI：

  10.1021/ol026043x