3'-O-,5'-O-(1,1',3,3'-tetraisopropyldisiloxan-1,3-diyl)-N6-(3,6-dioxa-8-N'-biotinylaminooctyl)adenosine | 1017598-35-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 英文名称: 3'-O-,5'-O-(1,1',3,3'-tetraisopropyldisiloxan-1,3-diyl)-N6-(3,6-dioxa-8-N'-biotinylaminooctyl)adenosine
• CAS: 1017598-35-4
• 化学式: C₃₈H₆₆N₈O₉SSi₂
• 分子量: 867.227
• InChiKey: CROATRRDKHQLFL-JUTSVYJISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.33
• 重原子数：
  58.0
• 可旋转键数：
  20.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  201.47
• 氢给体数：
  5.0
• 氢受体数：
  15.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-,5'-O-(1,1',3,3'-tetraisopropyldisiloxan-1,3-diyl)-N6-(3,6-dioxa-8-N'-biotinylaminooctyl)adenosine 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以76%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of guanosine 5′-conjugates and their use as initiator molecules for transcription priming

  摘要：

  我们合成了两种与生物素化腺苷部分相连的鸟苷衍生物，采用了两种不同的策略，一种是在固相上进行合成步骤，另一种则完全在溶液中进行。合成的衍生物在转录引物实验中被证明可以作为引发分子使用。引入效率被确定为大约2%。尽管这个值相对较低，但在选择实验中使用其中任何一种分子似乎都是合理的。基本上，可以生成序列复杂度为10^15到10^16的RNA文库。用我们的引发分子标记这样的文库仍然可以产生10^13到10^14个标记/功能化序列，从而提供足够的序列空间用于选择。

  DOI：

  10.1039/b716151d
• 作为产物：
  描述：

  、 D-生物素 在 2-succinimido-1,1,3,3-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以0.9 g的产率得到3'-O-,5'-O-(1,1',3,3'-tetraisopropyldisiloxan-1,3-diyl)-N6-(3,6-dioxa-8-N'-biotinylaminooctyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of guanosine 5′-conjugates and their use as initiator molecules for transcription priming

  摘要：

  我们合成了两种与生物素化腺苷部分相连的鸟苷衍生物，采用了两种不同的策略，一种是在固相上进行合成步骤，另一种则完全在溶液中进行。合成的衍生物在转录引物实验中被证明可以作为引发分子使用。引入效率被确定为大约2%。尽管这个值相对较低，但在选择实验中使用其中任何一种分子似乎都是合理的。基本上，可以生成序列复杂度为10^15到10^16的RNA文库。用我们的引发分子标记这样的文库仍然可以产生10^13到10^14个标记/功能化序列，从而提供足够的序列空间用于选择。

  DOI：

  10.1039/b716151d