Principal Component Analysis of Dynamical Features in the Peroxidase−Oxidase Reaction
作者:Ewa S. Kirkor、Alexander Scheeline、Marcus J. B. Hauser
DOI:10.1021/ac990957o
日期:2000.4.1
contribution of NADH to the PO oscillator variance, as did increased NADH influx. A simulated absorption time series, computed from a mass-action model of the chemistry, was analyzed by PCA as well. The comparison of simulation with experiment indicates that the chemical model renders the time series for HRP oxidation forms with fidelity, but incompletely represents NADH chemistry and other salient processes
使用主成分分析(PCA)研究了由于过氧化物酶-氧化酶(PO)反应中的振荡引起的固有差异。底物是氧气和还原烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)。辣根过氧化物酶(HRP)催化该反应。改变辅因子亚甲蓝(MB)的浓度,并使2,4-二氯苯酚保持恒定。NADH流入的增加用于将反应动力学从周期性改变为混乱。将反应空间抽象为最重要的,相互独立的吸收和动力学基础向量对(主要成分)。通常,从周期性时间序列中提取两个重要的主成分,并从混沌数据中提取三个。PCA模型占实验方差的70-97%。总方差的最大部分是在表现出周期性动态且小于25 nM MB的实验中占的。越来越多的MB诱导了NADH对PO振荡器方差的增加,这与增加的NADH流入一样。由化学物质的质量作用模型计算得出的模拟吸收时间序列,也由PCA分析。模拟与实验的比较表明,该化学模型使HRP氧化形式的时间序列具有保真度,但不完全代表NADH化学和观察到的动力学的