5-O-(二甲氧基三苯甲游基)-2-o-甲基-5-甲基尿苷 | 115173-73-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 中文名称: 5-O-(二甲氧基三苯甲游基)-2-o-甲基-5-甲基尿苷
• 英文名称: 2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methoxymethyluridine
• 英文别名: 2'-deoxy-5'-dimethoxytrityl-5-(methoxymethyl)uridine；1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-(methoxymethyl)pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 115173-73-4
• 化学式: C₃₂H₃₄N₂O₈
• 分子量: 574.631
• InChiKey: QFNSUHLNARJMEY-ZGIBFIJWSA-N

物化性质

• 密度：
  1.271±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3,5-双-O-乙酰胸苷 、 5-O-(二甲氧基三苯甲游基)-2-o-甲基-5-甲基尿苷 生成 5-甲氧基甲基-2-脱氧尿苷
  参考文献：
  名称：

  TAKEDA, TADAYUKI;IKEDA, KAZUYOSHI;MIZUNO, YOSHIHISA;UEDA, TOHRU, CHEM. AND PHARM. BULL., 35,(1987) N 9, 3558-3567

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  3,5-双-O-乙酰胸苷 在 溴 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 四氯化碳 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 5-O-(二甲氧基三苯甲游基)-2-o-甲基-5-甲基尿苷
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and properties of deoxyoligonucleotides containing putrescinylthymine (nucleosides and nucleotides. LXXVI).

  摘要：

  腐胺胸苷是通过从 2'-脱氧-5-甲酰尿苷衍生物和 N-邻苯二甲酰胺腐胺形成的希夫碱的还原反应制备的，随后进行去保护处理。合成了以下含有腐胺胸苷（TP）的脱氧寡核苷酸；含有两个到四个 TP 殘基的十二聚胸苷酸、自互补的十聚核苷酸（AAGAATTCTT）和十二聚核苷酸（AGATAGCTATCT），其中 T 残基部分被 TP 替代，以及相关的寡聚物。含有 TP 的寡核苷酸对核酸酶 S1 消化具抵抗性，并且是毒液磷酸二酯酶的劣质底物。尽管预计腐胺和磷酸残基之间存在静电结合，含有 TP 的寡聚物双链结构的热稳定性（Tm）并没有增强，而是相当依赖序列。

  DOI：

  10.1248/cpb.35.3558

文献信息

• O-Glycoside Orientation Is an Essential Aspect of Base J Recognition by the Kinetoplastid DNA-Binding Protein JBP1
  作者：Rajesh K. Grover、Stephanie J. K. Pond、Qizhi Cui、Prem Subramaniam、David A. Case、David P. Millar、Paul Wentworth

  DOI：10.1002/anie.200604635

  日期：2007.4.13