(2S,3R,4R,5S)-2-hydroxymethyl-3,4,5-piperidinetriol | 16647-80-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 哌啶类
• 英文名称: (2S,3R,4R,5S)-2-hydroxymethyl-3,4,5-piperidinetriol
• 英文别名: 1-deoxy-L-idonojirimycin；(2S,3R,4R,5S)-2-(hydroxymethyl)piperidine-3,4,5-triol
• CAS: 16647-80-6
• 化学式: C₆H₁₃NO₄
• 分子量: 163.174
• InChiKey: LXBIFEVIBLOUGU-UNTFVMJOSA-N

物化性质

• 熔点：
  137 °C
• 沸点：
  361.1±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.456±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.3
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  93
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S,3R,4R,5S)-2-hydroxymethyl-3,4,5-piperidinetriol 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N-(5-(3,3,4,4,5,5,6,6,6-nonafluorohexylaminocatbonyl)pentyl)-1,5-dideoxy-1,5-imino-L-iditol
  参考文献：
  名称：

  含氟亚氨基醛醇：糖苷酶抑制剂和药理学伴侣的新家族

  摘要：

  含氟辅助物：制备了一系列具有不寻常的 N 取代基的亚氨基醛醇，其中包含高度氟化的结构部分。这些化合物表现出与糖苷酶的有吸引力的相互作用，可以作为新药理学伴侣的线索。

  DOI：

  10.1002/cbic.201000192
• 作为产物：
  描述：

  (3aS,8aS,9R,9aR)-9-(t-butyldimethylsilyloxy)-2,2-dimethyltetrahydro-3aH-[1,3]dioxolo[4,5-d]oxazolo[3,4-a]pyridin-6(4H)-one 在 盐酸 、 水 、 lithium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 (2S,3R,4R,5S)-2-hydroxymethyl-3,4,5-piperidinetriol
  参考文献：
  名称：

  的手性氮丙啶-1- deoxyazasugars不对称合成†

  摘要：

  对映体纯的1-脱氧天竺葵的一般和容易的合成是通过常见的合成中间体哌啶环稠合的立体选择性二羟基化而实现的 恶唑烷-2-酮源于可商购的起始底物手性氮丙啶-2-羧酸的手性化合物，收率高。

  DOI：

  10.1039/c0ob00730g

文献信息

• [EN] PIPERIDINETRIOL DERIVATIVES AS INHIBITORS OF GLYCOSYLCERAMIDE SYNTHASE<br/>[FR] UTILISATION DE DERIVES DU PIPERIDINETRIOL EN TANT QU'INHIBITEURS DE LA GLYCOSYLCERAMIDE SYNTHASE
  申请人：OXFORD GLYCOSCIENCES UK LTD

  公开号：WO2004007453A1

  公开（公告）日：2004-01-22

  Compounds of formula (I): wherein R represents various substituent groups, are useful as inhibitors of glucosylceramide synthase.

  式（I）的化合物：其中R代表各种取代基团，可用作葡萄糖酰胺合成酶的抑制剂。
• Stereoselective Electrophilic Cyclizations of δ-Aminoalkenes Derived from Carbohydrates; Synthesis of Polyhydroxypiperidines
  作者：Helmut M. Hügel、Andrew B. Hughes、Khadijeh Khalil

  DOI：10.1071/c98087

  日期：——

  Electrophilic cyclizations of a carbohydrate-derived δ-aminoalkene were studied. Iodocyclizations proceeded with moderate steric control to afford the D-gluco-configured piperidine as the major product. More extensive studies with mercuric salts resulted in the definition of new reaction conditions for aminomercuration that give higher, reversed stereoselection. The aminomercurations were also amenable to the use of a range of mercuric salts. These aminomercurations may be under chelation control with substrate allylic benzyloxy substituents. The configurations of the piperidine products were confirmed by elaboration of one bromomercurial to a known aminoalditol by oxydemercuration and hydrogenolysis.

  研究了源自碳水化合物的 δ-氨基烯的亲电环化反应。 进行了研究。碘环化反应在适度的立体控制下进行，主要产物为 D-葡萄糖构型的哌啶。 D-葡萄糖构型的哌啶作为主要产物。更广泛的 通过对汞盐进行更广泛的研究，确定了新的 氨酰胺化的新反应条件，这种条件可产生更高的反向 立体选择性。氨酰胺化反应还可以使用一系列汞盐。 一系列汞盐。这些氨基巯基可能在螯合控制下 控制。哌啶产物的构型 通过将一个溴巯基化合物氧化成已知的氨基甲醇，确认了哌啶产物的构型。 通过氧解巯基和氢解作用，将一种溴巯基化合物与已知的氨基甲醇结合，从而证实了哌啶产物的构型。
• Synthesis and Evaluation of Hybrid Structures Composed of Two Glucosylceramide Synthase Inhibitors
  作者：Richard J. B. H. N. van den Berg、Erwin R. van Rijssel、Maria Joao Ferraz、Judith Houben、Anneke Strijland、Wilma E. Donker-Koopman、Tom Wennekes、Kimberly M. Bonger、Amar B. T. Ghisaidoobe、Sascha Hoogendoorn、Gijsbert A. van der Marel、Jeroen D. C. Codée、Herman S. Overkleeft、Johannes M. F. G. Aerts

  DOI：10.1002/cmdc.201500407

  日期：2015.12

  in glucosylceramide metabolism—glucosylceramide synthase (GCS), acid glucosylceramidase (GBA1), or neutral glucosylceramidase (GBA2)—is therefore an attractive research objective. In this study we took two established GCS inhibitors, one based on deoxynojirimycin and the other a ceramide analogue, and merged characteristic features to obtain hybrid compounds. The resulting 39‐compound library does

  葡萄糖基神经酰胺的代谢和涉及的酶已在药物化学中引起了极大的兴趣，因为源自葡萄糖基神经酰胺的糖脂水平的异常是导致一系列人类疾病（包括溶酶体贮积病，2型糖尿病和神经退行性疾病）的原因。因此，对参与糖基神经酰胺代谢的一种糖加工酶（糖基神经酰胺合酶（GCS），酸性糖基神经酰胺酶（GBA1）或中性糖基神经酰胺酶（GBA2））的选择性调节是一个有吸引力的研究目标。在这项研究中，我们采用了两种已建立的GCS抑制剂，一种基于脱氧野oji霉素，另一种基于神经酰胺类似物，并合并了特征性特征以获得杂化化合物。所得的39个化合物文库不包含新的GCS抑制剂。但是，有效的（200 nm）鉴定出对GBA2几乎没有活性的GBA1抑制剂，因此可以作为选择性GBA1调节剂作为进一步生物医学开发的先导。
• A Fluorescence Polarization Activity-Based Protein Profiling Assay in the Discovery of Potent, Selective Inhibitors for Human Nonlysosomal Glucosylceramidase
  作者：Daniël Lahav、Bing Liu、Richard J. B. H. N. van den Berg、Adrianus M. C. H. van den Nieuwendijk、Tom Wennekes、Amar T. Ghisaidoobe、Imogen Breen、Maria J. Ferraz、Chi-Lin Kuo、Liang Wu、Paul P. Geurink、Huib Ovaa、Gijsbert A. van der Marel、Mario van der Stelt、Rolf G. Boot、Gideon J. Davies、Johannes M. F. G. Aerts、Herman S. Overkleeft

  DOI：10.1021/jacs.7b07352

  日期：2017.10.11

  assessed on GBA2 selectivity offset against the other glucosylceramide metabolizing enzymes, glucosylceramide synthase (GCS), lysosomal glucosylceramidase (GBA), and the cytosolic retaining β-glucosidase, GBA3. Our work, yielding potent and selective GBA2 inhibitors, also provides a roadmap for the development of high-throughput assays for identifying retaining glycosidase inhibitors by FluoPol-ABPP

  人非溶酶体葡萄糖基神经酰胺酶（GBA2）是控制糖脂水平的几种酶之一，其活性与几种人类疾病状态相关。迫切需要设计或发现选择性的GBA2抑制剂作为化学工具和潜在的治疗剂。在这里，我们描述了基于荧光偏振活性的蛋白质谱分析（FluoPol-ABPP）测定法的发展，该测定法可从350多种亚氨基糖文库中快速鉴定GBA2抑制剂。基于FluoPol-ABPP筛选的线索生成聚焦库，并针对与其他葡糖神经酰胺代谢酶，葡糖神经酰胺合酶（GCS），溶酶体葡糖神经酰胺酶（GBA）和胞质保留β-葡糖苷酶GBA3的GBA2选择性偏移进行评估。我们的工作产生了有效的和选择性的GBA2抑制剂，
• Diastereoselective Synthesis of Piperidine Imino Sugars Using Aldol Additions of Metalated Bislactim Ethers to Threose and Erythrose Acetonides
  作者：María Ruiz、Tania M. Ruanova、Olga Blanco、Fátima Núñez、Cristina Pato、Vicente Ojea

  DOI：10.1021/jo702601z

  日期：2008.3.1

  anti-selectivity for the mismatched ones may originate from (1) the intervention of solvated aggregates of tin(II) azaenolate and lithium chloride as the reactive species and (2) favored chair-like transition structures with a Cornforth-like conformation for the aldehyde moiety. DFT calculations indicate that aldol additions to erythrose acetonides proceed by an initial deprotonation, followed by coordination

  描述了从手性甘氨酸当量和4-碳构件合成1-脱氧-天冬酰胺的一般策略。非对映选择性醛醇缩合的金属化双lactimin醚添加到匹配和不匹配的赤藓糖或苏糖酸丙酮化物和分子内氮-烷基化（通过还原胺化或亲核取代）被用作关键步骤。研究了赤藓糖或苏糖醛丙酮化物中氮杂烯酸酯的金属抗衡离子和γ-烷氧基保护基的性质和醛醇加成的收率和不对称诱导的关系。借助密度泛函理论（DFT）计算已经合理化了氮杂锡（II）锡与羟醛加成的立体化学结果。按照理论计算与模型甘油丙酮化，高反式，顺式，反-selectivitity的配对和适度低反式，反，反错配的选择性可能源于（1）干预作为活性物质的氮杂锡（II）和氯化锂（II）的溶剂化团聚体；（2）醛基具有类似于Cornforth构象的椅子样过渡结构。DFT计算表明，向赤藓糖醇丙酮中添加羟醛的过程是先进行去质子化，然后将烷氧基衍生物与氮杂锡（II）配位，并通过周环过渡结构最终重组中间