5'-O-dimethoxytrityl-(2'S)-2'-deoxy-2'-C-methyl-N³-(4-t-butylbenzoyl) uridine | 402518-11-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-dimethoxytrityl-(2'S)-2'-deoxy-2'-C-methyl-N³-(4-t-butylbenzoyl) uridine
• 英文别名: 1-[(2R,3S,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxy-3-methyloxolan-2-yl]-3-(4-tert-butylbenzoyl)pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 402518-11-0
• 化学式: C₄₂H₄₄N₂O₈
• 分子量: 704.82
• InChiKey: OJGLGGHDWJDYCE-UJXUVYKOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7
• 重原子数：
  52
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 5'-O-dimethoxytrityl-(2'S)-2'-deoxy-2'-C-methyl-N³-(4-t-butylbenzoyl) uridine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 以80%的产率得到5'-O-dimethoxytrityl-(2'S)-2'-deoxy-2'-C-methyl-N³-(4-t-butylbenzoyl) uridine-3'-O-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidite)
  参考文献：
  名称：

  合成与性能（2'小号） -和（2' - [R）-2'-脱氧-2'- Ç甲基寡核苷酸

  摘要：

  的合成（2'小号） -和（2' - [R）-2'-脱氧-2'- Ç甲基Ñ 3 - （4-吨-butylbenzoyl）尿苷，（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç -methyluridine和（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç甲基ñ 4异丁酰基胞苷积木在这里描述。提出了在所有位置但3'-端均携带这些单体的寡核苷酸的制备方法，并评估了这些新片段与互补DNA和RNA序列之间的结合亲和力。（2′R）取代的寡核苷酸既不与互补的DNA序列又不与RNA序列杂交。然而，含有（2 'S）修饰的寡核苷酸的杂交体的解链曲线的一阶导数表示解链转变。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)00745-1
• 作为产物：
  描述：

  对叔丁基苯甲酰氯 在 四丁基氟化铵 、 四丁基溴化铵 、 sodium carbonate 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 0.08h， 生成 5'-O-dimethoxytrityl-(2'S)-2'-deoxy-2'-C-methyl-N³-(4-t-butylbenzoyl) uridine
  参考文献：
  名称：

  合成与性能（2'小号） -和（2' - [R）-2'-脱氧-2'- Ç甲基寡核苷酸

  摘要：

  的合成（2'小号） -和（2' - [R）-2'-脱氧-2'- Ç甲基Ñ 3 - （4-吨-butylbenzoyl）尿苷，（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç -methyluridine和（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç甲基ñ 4异丁酰基胞苷积木在这里描述。提出了在所有位置但3'-端均携带这些单体的寡核苷酸的制备方法，并评估了这些新片段与互补DNA和RNA序列之间的结合亲和力。（2′R）取代的寡核苷酸既不与互补的DNA序列又不与RNA序列杂交。然而，含有（2 'S）修饰的寡核苷酸的杂交体的解链曲线的一阶导数表示解链转变。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)00745-1

文献信息

• Synthesis and properties of (2′S)- and (2′R)-2′-deoxy-2′-C-methyl oligonucleotides
  作者：Daniel O Cicero、Mariana Gallo、Philippe J Neuner、Adolfo M Iribarren

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)00745-1

  日期：2001.9

  The synthesis of (2′S)- and (2′R)-2′-deoxy-2′-C-methyl-N3-(4-t-butylbenzoyl) uridine, (2′S)-2′-deoxy-2′-C-methyluridine and (2′S)-2′-deoxy-2′-C-methyl-N4-isobutyryl cytidine building blocks are here described. The preparation of oligonucleotides carrying these monomers in all positions but 3′-end is presented and the binding affinity between these new fragments and the complementary DNA and RNA sequences

  的合成（2'小号） -和（2' - [R）-2'-脱氧-2'- Ç甲基Ñ 3 - （4-吨-butylbenzoyl）尿苷，（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç -methyluridine和（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç甲基ñ 4异丁酰基胞苷积木在这里描述。提出了在所有位置但3'-端均携带这些单体的寡核苷酸的制备方法，并评估了这些新片段与互补DNA和RNA序列之间的结合亲和力。（2′R）取代的寡核苷酸既不与互补的DNA序列又不与RNA序列杂交。然而，含有（2 'S）修饰的寡核苷酸的杂交体的解链曲线的一阶导数表示解链转变。