[EN] PROCESS FOR PREPARING PHOSPHOROTHIOATE OLIGONUCLEOTIDES<br/>[FR] PROCEDE POUR PREPARER DES OLIGONUCLEOTIDES DE PHOSPHOROTHIOATE
申请人:ISIS PHARMACEUTICALS, INC.
公开号:WO1994019363A1
公开(公告)日:1994-09-01
(EN) A process for preparing phosphorothioate oligonucleotides utilizes S-(alkaryl or aryl) phosphorothioate compounds as intermediates suitable for use in the solution phase. A dinucleotide is prepared from a nucleoside intermediate that has been phosphitylated with an S-(alkaryl or aryl) alkyl phosphorothioate diester salt. The alkyl ester group is removed and the resulting nucleotide diester is reacted with a further nucleoside having a free 5'-hydroxyl group. Nucleotide units are linked together to yield compounds of structure (I), where X is H, a first blocking group, a nucleoside, a nucleotide or an oligonucleotide; Y is H, a second and blocking group, a nucleoside, a nucleotide or an oligonucleotide; R is an alkaryl or aryl group; n is an integer greater than 0; and Bx is a heterocyclic base. Deblocking of the S-alkaryl or S-aryl moiety yields a phosphorothioate oligonucleotide.(FR) Un procédé pour préparer des oligonucléotides de phosphorothioate utilise des composés S-(alcaryle ou aryle) phosphorothioate comme intermédiaires convenant à une utilisation dans une phase de solution. On prépare un dinucléotide à partir d'un intermédiaire denucléoside qui a été phosphitylé avec un sel du diester de S-(alcaryl ou aryl) alkyle phosphorothioate. On élimine le groupe alkyle ester et on fait réagir le diester nucléotidique résultant avec un autre nucléoside ayant un groupe 5'-hydroxyle libre. Les unités de nucléotide sont liées ensemble pour former des composés de la structure (I) dans laquelle X représente H, un premier groupe de blocage, un nucléoside, un nucléotide ou un oligonucléotide; Y représente H, un second groupe de blocage, un nucléoside, un nucléotide ou un oligonucléotide; R représente un groupe alcaryl ou aryle; n représente un nombre entier supérieur à 0; et Bx représente une base hétérocyclique. Le déblocage du groupe S-alcaryle ou S-aryle produit un oligonucléotide de phosphorothioate.
Intra- and intermolecular nucleophilic phosphorous - sulfur bond cleavage. The reaction of fluoride ion with O-aryl-O, S-dialkylphosphorothioates, & the degradation of phosphorothioate linkage in di-ribonucleotides by the vicinal 2′-hydroxyl group.
作者:Christian Sund、Jyoti Chattopadhyaya
DOI:10.1016/s0040-4020(01)89215-2
日期:1989.1
adenylyl (3′→5′)-5′-thiouridines 12 and 13 were partially deprotected to 37 and 38, having a phosphorothioate linkage with a bridging sulfur [ribonucleoside-3′-O-PO2-S-5′-ribonucleoside] in order to examine the stability of this internucleotidyl linkage vicinal to a 2′ -hydroxyl function. The 2′-O-protected adenylyl(3′→5′)-5′- thiouridines 37 and 38 were found to be as stable as thymidylyl(3′→5′)-5′-thiothymiifine
O-芳基-O,S-dialkylphosphorothioates,如全保护腺苷酰基(3'→5') - 5'-硫代尿苷11,O-芳基- O-乙基-5'- thiouridyl硫代磷酸酯24,在治疗与过量在四氢呋喃-吡啶-水中(8:1:1 v / v / v)中对正四丁基氟化铵进行切割,使磷-硫键断裂,得到相应的O-烷基磷一氟酸酯20(74%)和30(75%)。此轻便,alkylphosphoromonofluoridates的新的制备已被发现是已经举例说明通过的O-芳基-O的转化一般的反应,S-dialkylphosphorothioates 26,27,28和29到相应的phosphorofluoridates 30(79%),(31+ 32(一起85%),33(63%)和34(90%),将完全保护的腺苷基(3'→5')-5'-硫尿苷12和13部分脱保护为37和38,具有硫代磷酸酯与桥连硫[核糖核苷-3'-O-PO