GTP

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: GTP
• 英文别名: [[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-4,5-dihydro-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
• 化学式: C₁₀H₁₈N₅O₁₄P₃
• 分子量: 525.199
• InChiKey: OGENLJHOFZEXIL-QYQYRGHWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.74
• 重原子数：
  32.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  292.59
• 氢给体数：
  8.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  GTP 、 mannose-1-phosphate 在 1,4-dithio-D,L-threitol 、 pyrophosphorylase 、 Trypanosoma brucei guanidine diphosphomannose pyrophosphorylase 、 magnesium chloride 、 4-羟乙基哌嗪乙磺酸 作用下， 反应 0.5h， 生成 GDP-Man
  参考文献：
  名称：

  GDP-mannose pyrophosphorylase is essential in the bloodstream form of Trypanosoma brucei

  摘要：

  在布氏锥虫的基因组中发现了一种推定的 GDP-Man PP（胍二磷酸甘露糖焦磷酸化酶）基因（TbGDP-Man PP），随后对其进行了克隆、测序和重组表达，结果表明它是一种具有催化活性的二聚体。动力学分析表明，每毫克蛋白质的最大催化活性为 0.34 μmol/min，GTP 和 1-磷酸甘露糖的 Km 值分别为 67 μM 和 12 μM。进一步的动力学研究表明，GDP-Man 是一种有效的产物反馈抑制剂。对细胞膜 TbGDP-Man PP 的 RNAi（RNA 干扰）表明，mRNA 水平降低到野生型水平的约 20%，导致细胞在 3-4 天后死亡。RNAi诱导的寄生虫形成GDP-Man的能力大大降低，最终导致其合成必要的GPI（糖基磷脂酰肌醇）锚的能力降低。RNAi诱导的寄生虫的主要细胞表面糖蛋白（变体表面糖蛋白）的N-糖基化也出现异常，在Asn428处失去了高甘露糖Man9GlcNAc2 N-糖基化，而在Asn263处形成了复杂的N-糖基。

  DOI：

  10.1042/bj20090896

文献信息

• GDP-mannose pyrophosphorylase is essential in the bloodstream form of <i>Trypanosoma brucei</i>
  作者：Helen Denton、Stewart Fyffe、Terry K. Smith

  DOI：10.1042/bj20090896

  日期：2010.2.1

  A putative GDP-Man PP (guanidine diphosphomannose pyrophosphorylase) gene from Trypanosoma brucei (TbGDP-Man PP) was identified in the genome and subsequently cloned, sequenced and recombinantly expressed, and shown to be a catalytically active dimer. Kinetic analysis revealed a Vmax of 0.34 μmol/min per mg of protein and Km values of 67 μM and 12 μM for GTP and mannose 1-phosphate respectively. Further kinetic studies showed GDP-Man was a potent product feedback inhibitor. RNAi (RNA interference) of the cytosolic TbGDP-Man PP showed that mRNA levels were reduced to ~20% of wild-type levels, causing the cells to die after 3–4 days, demonstrating that TbGDP-Man PP is essential in the bloodstream form of T. brucei and thus a potential drug target. The RNAi-induced parasites have a greatly reduced capability to form GDP-Man, leading ultimately to a reduction in their ability to synthesize their essential GPI (glycosylphosphatidylinositol) anchors. The RNAi-induced parasites also showed aberrant N-glycosylation of their major cell-surface glycoprotein, variant surface glycoprotein, with loss of the high-mannose Man9GlcNAc2 N-glycosylation at Asn428 and formation of complex N-glycans at Asn263.

  在布氏锥虫的基因组中发现了一种推定的 GDP-Man PP（胍二磷酸甘露糖焦磷酸化酶）基因（TbGDP-Man PP），随后对其进行了克隆、测序和重组表达，结果表明它是一种具有催化活性的二聚体。动力学分析表明，每毫克蛋白质的最大催化活性为 0.34 μmol/min，GTP 和 1-磷酸甘露糖的 Km 值分别为 67 μM 和 12 μM。进一步的动力学研究表明，GDP-Man 是一种有效的产物反馈抑制剂。对细胞膜 TbGDP-Man PP 的 RNAi（RNA 干扰）表明，mRNA 水平降低到野生型水平的约 20%，导致细胞在 3-4 天后死亡。RNAi诱导的寄生虫形成GDP-Man的能力大大降低，最终导致其合成必要的GPI（糖基磷脂酰肌醇）锚的能力降低。RNAi诱导的寄生虫的主要细胞表面糖蛋白（变体表面糖蛋白）的N-糖基化也出现异常，在Asn428处失去了高甘露糖Man9GlcNAc2 N-糖基化，而在Asn263处形成了复杂的N-糖基。