Pob-SAM

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: Pob-SAM
• 英文别名: 4-propargyloxy-but-2-enyl-SAM；[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl]-[(E)-4-prop-2-ynoxybut-2-enyl]sulfanium
• 化学式: C₂₁H₂₉N₆O₆S
• 分子量: 493.564
• InChiKey: VMWOHRPNIMEBDG-RHPFDQTPSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.2
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  193
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Pob-SAM 、 在 mammalian catechol-O-methyltransferase 、 magnesium chloride 、 维生素 C 、 酪氨酸酶 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 1.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  选择性修饰结构多样肽和蛋白质中酪氨酸残基的酶级联反应

  摘要：

  生物正交化学能够在存在许多反应性官能团和其他细胞实体的情况下选择性地修饰复杂生物分子中的特定部分。这种选择性在生物学中已变得不可或缺，使生物分子能够被衍生、缀合、标记或固定用于成像、生化分析或治疗应用。接受辅因子 S-腺苷甲硫氨酸类似物的甲基转移酶 (MTase) 已广泛用于烷基多样化和生物正交标记。然而，MTases 通常具有严格的底物特异性。在这里，我们介绍了一种更灵活的方法，用于选择性衍生复杂生物分子中的酚类部分。我们的方法依赖于真菌酪氨酸酶和哺乳动物儿茶酚-O-甲基转移酶 (COMT) 的串联酶促反应，这可以影响酚基的顺序羟基化，从而产生随后被 O-烷基化的中间儿茶酚部分。当用于这种组合时，烷氧基化对肽和蛋白质中的酪氨酸残基具有高度选择性，但对肽序列的变化具有显着的耐受性。酪氨酸酶-COMT 被证明可以对多种底物提供高度通用和区域选择性的修饰，包括肽抗肿瘤剂、激素、环肽抗生素和模型

  DOI：

  10.1021/jacs.5b10928
• 作为产物：
  描述：

  (E)-1-bromo-4-(prop-2-yn-1-yloxy)but-2-ene 、 S-(5'-腺苷)-L-高半胱氨酸 在 silver perchlorate 作用下， 以 甲酸 、 溶剂黄146 为溶剂， 生成 Pob-SAM
  参考文献：
  名称：

  选择性修饰结构多样肽和蛋白质中酪氨酸残基的酶级联反应

  摘要：

  生物正交化学能够在存在许多反应性官能团和其他细胞实体的情况下选择性地修饰复杂生物分子中的特定部分。这种选择性在生物学中已变得不可或缺，使生物分子能够被衍生、缀合、标记或固定用于成像、生化分析或治疗应用。接受辅因子 S-腺苷甲硫氨酸类似物的甲基转移酶 (MTase) 已广泛用于烷基多样化和生物正交标记。然而，MTases 通常具有严格的底物特异性。在这里，我们介绍了一种更灵活的方法，用于选择性衍生复杂生物分子中的酚类部分。我们的方法依赖于真菌酪氨酸酶和哺乳动物儿茶酚-O-甲基转移酶 (COMT) 的串联酶促反应，这可以影响酚基的顺序羟基化，从而产生随后被 O-烷基化的中间儿茶酚部分。当用于这种组合时，烷氧基化对肽和蛋白质中的酪氨酸残基具有高度选择性，但对肽序列的变化具有显着的耐受性。酪氨酸酶-COMT 被证明可以对多种底物提供高度通用和区域选择性的修饰，包括肽抗肿瘤剂、激素、环肽抗生素和模型

  DOI：

  10.1021/jacs.5b10928

文献信息

• Labeling Substrates of Protein Arginine Methyltransferase with Engineered Enzymes and Matched <i>S</i>-Adenosyl-<scp>l</scp>-methionine Analogues
  作者：Rui Wang、Weihong Zheng、Haiqiang Yu、Haiteng Deng、Minkui Luo

  DOI：10.1021/ja2006719

  日期：2011.5.25

  Elucidating physiological and pathogenic functions of protein methyltransferases (PMTs) relies on knowing their substrate profiles. S-adenosyl-L-methionine (SAM) is the sole methyl-donor cofactor of PMTs. Recently, SAM analogues have emerged as novel small-molecule tools to efficiently label PMT substrates. Here we reported the development of a clickable SAM analogue cofactor, 4-propargyloxy-but-2-enyl SAM, and its implementation to label substrates of human protein arginine methyltransferase 1 (PRMT1). In the system, the SAM analogue cofactor, coupled with matched PRMT1 mutants rather than native PRMT1, was shown to label PRMT1 substrates. The transferable 4-propargyloxy-but-2-enyl moiety of the SAM analogue further allowed corresponding modified substrates to be characterized through a subsequent click chemical ligation with an azido-based probe. The SAM analogue, in combination with a rational protein-engineering approach, thus shows potential to label and identify PMT targets in the context of a complex cellular mixture.