6-[2-[7-(1-Butyl-3,3-dimethyl-5-nitroindol-2-ylidene)hepta-1,3,5-trienyl]-1,3-benzothiazol-3-ium-3-yl]hexanoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并噻唑类
• 英文名称: 6-[2-[7-(1-Butyl-3,3-dimethyl-5-nitroindol-2-ylidene)hepta-1,3,5-trienyl]-1,3-benzothiazol-3-ium-3-yl]hexanoic acid
• 英文别名: 6-[2-[7-(1-butyl-3,3-dimethyl-5-nitroindol-2-ylidene)hepta-1,3,5-trienyl]-1,3-benzothiazol-3-ium-3-yl]hexanoic acid
• 化学式: C34H40N3O4S+
• 分子量: 586.8
• InChiKey: ZIKUEISWUCGWSZ-UHFFFAOYSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

文献信息

• ENERGY TRANSFER ASSAY METHOD AND REAGENT
  申请人：Amersham Pharmacia Biotech UK Ltd.

  公开号：EP1086179A1

  公开（公告）日：2001-03-28
• [EN] ENERGY TRANSFER ASSAY METHOD AND REAGENT<br/>[FR] PROCEDE ET REACTIF DE TEST DE TRANSFERT D'ENERGIE
  申请人：AMERSHAM BIOSCIENCES CORP

  公开号：WO1999064519A1

  公开（公告）日：1999-12-16

  (EN) Disclosed is a non-fluorescent cyanine dye that may be used as an acceptor in fluorescence energy transfer assays involving the detection of binding and/or cleavage events in reactions involving biological molecules, and assay methods utilising such dyes. The non-fluorescent cyanine dye is a compound of formula (I), wherein the linker group Q contains at least one double bond and forms a conjugated system with the rings containing X and Y; groups R3, R4, R5 and R6 are attached to the rings containing X and Y, or optionally, are attached to atoms of the Z1 and Z2 ring structures; Z1 and Z2 each represent a bond or the atoms necessary to complete one or two fused aromatic rings each ring having five or six atoms, selected from carbon atoms and, optionally, no more than two oxygen, nitrogen and sulphur atoms; at least one of groups R1, R2, R3, R4, R5, R6 and R7 is a target bonding group; any remaining groups R3, R4, R5, R6 and R7 groups are independently selected from the group consisting of hydrogen, C1-C4 alkyl, OR9, COOR9, nitro, amino, acylamino, quaternary ammonium, phosphate, sulphonate and sulphate, where R9 is selected from H and C1-C4 alkyl; any remaining R1 and R2 are selected from C1-C10 alkyl which may be unsubstituted or substituted with phenyl, the phenyl being optionally substituted by up to two substituents selected from carboxyl, sulphonate and nitro groups; characterised in that at least one of the groups R1, R2, R3, R4, R5, R6 and R7 comprises a substituent which reduces the fluorescence emission of said dye such that it is essentially non-fluorescent.(FR) L'invention concerne un colorant de cyanine non fluorescent qui peut être utilisé comme accepteur dans des tests de transfert d'énergie par fluorescence comportant une détection d'événements de liaison et/ou de coupure dans des réactions impliquant des molécules biologiques; et des procédés de test utilisant ces colorants. Le colorant de cyanine non fluorescent est un composé représenté par la formule (I), dans laquelle le groupe lieur Q contient au moins une liaison double et forme un système conjugué avec les systèmes cycliques contenant X et Y; les groupes R3, R4, R5 et R6 sont liés aux systèmes cycliques contenant X et Y, ou sont éventuellement liés aux atomes des structures cycliques Z1 et Z2; Z1 et Z2 représentent chacun une liaison ou les atomes nécessaires pour compléter un ou deux noyaux aromatiques condensés, chaque noyau étant doté de cinq ou six atomes sélectionnés entre des atomes de carbone et, éventuellement, au plus deux atomes d'oxygène, d'azote ou de soufre; au moins un des groupes R1, R2, R3, R4, R5, R6 et R7 est un groupe de liaison cible; tous les groupes restants R3, R4, R5, R6 et R7 sont sélectionnés indépendamment dans le groupe constitué par un hydrogène, un alkyle en C1-C4, OR9, COOR9, un nitro, un amino, un acylamino, un ammonium quaternaire, un phosphate, un sulfonate et un sulfate, R9 étant sélectionné entre H et un alkyle en C1-C4; chaque groupe restant R1 et R2 est un alkyle en C1-C10 pouvant être non substitué ou substitué par un phényle, le phényle étant éventuellement substitué par deux substituants au plus sélectionnés dans le groupe comprenant des groupes carboxyle, sulfonate et nitro; la formule est caractérisée par le fait qu'au moins un des groupes R1, R2, R3, R4, R5, R6 et R7 comporte un substituant qui réduit l'émission de fluorescence dudit colorant, de sorte qu'elle est essentiellement non fluorescente.