N-cyclohexyl-2-(thiophen-3-yl)imidazo[1,2-a]pyrazin-3-amine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并吡嗪类
• 英文名称: N-cyclohexyl-2-(thiophen-3-yl)imidazo[1,2-a]pyrazin-3-amine
• 英文别名: N-cyclohexyl-2-thiophen-3-ylimidazo[1,2-a]pyrazin-3-amine
• 化学式: C₁₆H₁₈N₄S
• 分子量: 298.412
• InChiKey: LGFWGESPQNMPFN-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.2
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  70.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3-噻吩甲醛 、 氨基吡嗪 、 异氰环已烷 在 scandium tris(trifluoromethanesulfonate) 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.5h， 以85.6%的产率得到N-cyclohexyl-2-(thiophen-3-yl)imidazo[1,2-a]pyrazin-3-amine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and Biological Evaluation of Imadazo[1,2-a]pyrazines as Anticancer and Antiviral Agents through Inhibition of CDK9 and Human Coronavirus

  摘要：

  本研究合成了新型咪唑并[1,2-a]吡嗪衍生物，并将其作为 CDK9 抑制剂进行了评估。CDK9 检测结果表明，咪唑并[1,2-a]吡嗪 3c 的第 2 位为吡啶-4-基、第 3 位为苄基的衍生物具有最强的 CDK9 抑制活性，IC50 为 0.16 µM。研究还考察了新化合物对乳腺癌（MCF7）、结直肠癌（HCT116）和慢性骨髓性白血病（K652）细胞系的抗增殖作用。MTT 检测数据表明，抑制剂的细胞毒性作用与其对 CDK9 的抑制活性相关。化合物 3c 的细胞毒性效果最强，三个细胞株的平均 IC50 值为 6.66 µM。对 3c 的药物相似性进行了硅学预测，结果表明 3c 具有合理的生理化学和药代动力学特性。在针对人类冠状病毒 229E 的抗病毒试验中对所选衍生物进行了评估。结果表明，咪唑并[1,2-a]吡嗪 3b 的第 2 位为吡啶-4-基、第 3 位为环己基的衍生物具有最强的抗冠状病毒活性，IC50 为 56.96 µM，选择性指数为 7.14。靶标预测结果表明，3b 对蛋白酶具有很高的亲和力。对 3b 与 COVID-19 主要蛋白酶进行了对接研究，结果显示其具有良好的结合亲和力，这证实了体外检测数据。

  DOI：

  10.3390/ph15070859

文献信息

• Synthesis and Biological Evaluation of Imadazo[1,2-a]pyrazines as Anticancer and Antiviral Agents through Inhibition of CDK9 and Human Coronavirus
  作者：Aisha A. Alsfouk、Hanan M. Alshibl、Bshra A. Alsfouk、Najla A. Altwaijry、Ebtehal S. Al-Abdullah

  DOI：10.3390/ph15070859

  日期：——

  In this work, novel imadazo[1,2-a]pyrazine derivatives were synthesized and evaluated as CDK9 inhibitors. The results of CDK9 assay showed that the derivatives with pyridin-4-yl in position 2 and benzyl in position 3 of imadazo[1,2-a]pyrazine 3c displayed the most potent CDK9 inhibitory activity with IC50 of 0.16 µM. The anti-proliferative effect of the new compounds was examined against breast cancer (MCF7), colorectal cancer (HCT116), and chronic myelogenous leukaemia (K652) cell lines. The data of MTT assay showed that the cytotoxic effect of the inhibitors is correlated to their inhibitory activity against CDK9. Compound 3c exhibited the most potent cytotoxicity effect with average IC50s of three cell lines of 6.66 µM. The drug likeness properties of 3c were predicated in silico and demonstrated that 3c have reasonable physiochemical and pharmacokinetic properties. Selected derivatives were assessed in antiviral assay against human coronavirus 229E. The results of this assay showed that the derivative with pyridin-4-yl in position 2 and cyclohexyl in position 3 of imadazo[1,2-a]pyrazine 3b exhibited the most potent anti-coronaviral activity with IC50 of 56.96 µM and selectivity index of 7.14. The target predication result revealed that 3b showed high affinity to protease enzyme. Docking studies of 3b with COVID-19 main protease was conducted and showed good binding affinity, which confirmed the in vitro assay data.

  本研究合成了新型咪唑并[1,2-a]吡嗪衍生物，并将其作为 CDK9 抑制剂进行了评估。CDK9 检测结果表明，咪唑并[1,2-a]吡嗪 3c 的第 2 位为吡啶-4-基、第 3 位为苄基的衍生物具有最强的 CDK9 抑制活性，IC50 为 0.16 µM。研究还考察了新化合物对乳腺癌（MCF7）、结直肠癌（HCT116）和慢性骨髓性白血病（K652）细胞系的抗增殖作用。MTT 检测数据表明，抑制剂的细胞毒性作用与其对 CDK9 的抑制活性相关。化合物 3c 的细胞毒性效果最强，三个细胞株的平均 IC50 值为 6.66 µM。对 3c 的药物相似性进行了硅学预测，结果表明 3c 具有合理的生理化学和药代动力学特性。在针对人类冠状病毒 229E 的抗病毒试验中对所选衍生物进行了评估。结果表明，咪唑并[1,2-a]吡嗪 3b 的第 2 位为吡啶-4-基、第 3 位为环己基的衍生物具有最强的抗冠状病毒活性，IC50 为 56.96 µM，选择性指数为 7.14。靶标预测结果表明，3b 对蛋白酶具有很高的亲和力。对 3b 与 COVID-19 主要蛋白酶进行了对接研究，结果显示其具有良好的结合亲和力，这证实了体外检测数据。