N-(9-[2-([2-(tert-butylamino)-2-oxoethyl](2-[2-(2-( 3-[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy]-3-oxopropxy)ethoxy)ethoxy]ethyl)carbamoyl)phenyl]-6-(diethylamino)-3H-xanthen-3-ylidene)-N-ethyl-ethanaminium chloride | 1356146-31-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: N-(9-[2-([2-(tert-butylamino)-2-oxoethyl](2-[2-(2-( 3-[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy]-3-oxopropxy)ethoxy)ethoxy]ethyl)carbamoyl)phenyl]-6-(diethylamino)-3H-xanthen-3-ylidene)-N-ethyl-ethanaminium chloride
• 英文别名: [9-[2-[[2-(Tert-butylamino)-2-oxoethyl]-[2-[2-[2-[3-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-3-oxopropoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]carbamoyl]phenyl]-6-(diethylamino)xanthen-3-ylidene]-diethylazanium;chloride
• CAS: 1356146-31-0
• 化学式: C₄₇H₆₂N₅O₁₀*Cl
• 分子量: 892.49
• InChiKey: RBFZFXANKZHWNV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.27
• 重原子数：
  63
• 可旋转键数：
  24
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.49
• 拓扑面积：
  156
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  罗丹明B 在 4-二甲氨基吡啶 、 磷酸 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 N-(9-[2-([2-(tert-butylamino)-2-oxoethyl](2-[2-(2-( 3-[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy]-3-oxopropxy)ethoxy)ethoxy]ethyl)carbamoyl)phenyl]-6-(diethylamino)-3H-xanthen-3-ylidene)-N-ethyl-ethanaminium chloride
  参考文献：
  名称：

  Fast and efficient MCR-based synthesis of clickable rhodamine tags for protein profiling

  摘要：

  蛋白质分析探针是研究蛋白质组组成的重要工具，因此对了解高等生物体内各种复杂的生物过程做出了巨大贡献。为此，应用荧光标记的活性或亲和性探针是非常理想的。特别是在活体检测低含量目标蛋白时，荧光标记的分析探针具有很高的价值，否则很难通过标准印迹技术进行分析。本文介绍了一种基于 Ugi-4 组分反应（Ugi-4-CR）的一次性合成活化荧光标签（即叠氮、炔基或 NHS）的方法。由于形成了类胨结构，产物的荧光特性对 pH 值不敏感。此外，还将以标记模型蛋白质 BSA 为例，讨论这些探针的适用性。

  DOI：

  10.1039/c1ob06581e