3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[2,4-dioxo-5-[2-(9-oxofluoren-2-yl)ethynyl]pyrimidin-1-yl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile | 1352715-64-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[2,4-dioxo-5-[2-(9-oxofluoren-2-yl)ethynyl]pyrimidin-1-yl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 1352715-64-0
• 化学式: C₅₄H₅₃N₄O₉P
• 分子量: 933.01
• InChiKey: SCELPIBFJFIGNV-VQUQQYROSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.4
• 重原子数：
  68
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  149
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-乙炔基芴-9-酮 在 N-甲基吗啉 、 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.5h， 生成 3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[2,4-dioxo-5-[2-(9-oxofluoren-2-yl)ethynyl]pyrimidin-1-yl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
  参考文献：
  名称：

  包含2-乙炔基芴酮标记的2'-脱氧尿苷单元的无猝灭剂线性信标系统

  摘要：

  在这项研究中，我们合成了含有2-乙炔基芴酮的脱氧尿苷衍生物U FO，并将其掺入到寡脱氧核苷酸（ODN）的中心位置，以尝试开发一种新型的无猝灭剂线性信标探针，并了解其功能化的作用。芴支架对荧光ODN的光物理性质的影响。在这里，我们描述了我们对U FO DNA探针的光物理研究及其在单核苷酸多态性分型中的应用。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2011.10.092

文献信息

• Quencher-free linear beacon systems containing 2-ethynylfluorenone-labeled 2′-deoxyuridine units
  作者：Jin Ho Ryu、Ju Young Heo、Eun-Kyoung Bang、Gil Tae Hwang、Byeang Hyean Kim

  DOI：10.1016/j.tet.2011.10.092

  日期：2012.1

  In this study we synthesized the 2-ethynylfluorenone-containing deoxyuridine derivative UFO and incorporated it at the central positions of oligodeoxynucleotides (ODNs) in an attempt to develop a new type of quencher-free linear beacon probe and to understand the effect of functionalization of the fluorene scaffold on the photophysical properties of the fluorescent ODNs. Herein, we describe our photophysical

  在这项研究中，我们合成了含有2-乙炔基芴酮的脱氧尿苷衍生物U FO，并将其掺入到寡脱氧核苷酸（ODN）的中心位置，以尝试开发一种新型的无猝灭剂线性信标探针，并了解其功能化的作用。芴支架对荧光ODN的光物理性质的影响。在这里，我们描述了我们对U FO DNA探针的光物理研究及其在单核苷酸多态性分型中的应用。