Structural basis for potent inhibition of d-amino acid oxidase by thiophene carboxylic acids
作者:Yusuke Kato、Niyada Hin、Nobuo Maita、Ajit G. Thomas、Sumire Kurosawa、Camilo Rojas、Kazuko Yorita、Barbara S. Slusher、Kiyoshi Fukui、Takashi Tsukamoto
DOI:10.1016/j.ejmech.2018.09.040
日期:2018.11
thiophene-2-carboxylic acids and thiophene-3-carboxylic acids were identified as a new class of DAO inhibitors. Structure-activity relationship (SAR) studies revealed that small substituents are well-tolerated on the thiophene ring of both the 2-carboxylic acid and 3-carboxylic acid scaffolds. Crystal structures of human DAO in complex with potent thiophene carboxylic acids revealed that Tyr224 was
一系列噻吩-2-羧酸和噻吩-3-羧酸被确定为一类新的 DAO 抑制剂。构效关系(SAR)研究表明,2-羧酸和3-羧酸支架的噻吩环上的小取代基具有良好的耐受性。人 DAO 与强效噻吩羧酸复合物的晶体结构表明,Tyr224 与抑制剂的噻吩环紧密堆叠,导致其他 DAO 抑制剂观察到的二级口袋消失。复合物的分子动力学模拟表明,无论 Tyr224 在模拟的初始状态下是否堆叠,Tyr224 都更喜欢堆叠构象。MM/GBSA 表明 Tyr244 和基于噻吩的抑制剂之间存在显着的疏水相互作用。此外,活性位点通过广泛的氢键网络紧密封闭,其中包括堆叠构象中来自 Tyr224 的氢键网络。在噻吩环中引入大的支化侧链显着降低了效力。这些结果与其他 DAO 抑制剂形成鲜明对比,其他 DAO 抑制剂可以通过由于 Tyr224 重新定位而延伸至二级口袋的分支侧链来获得效力。这些见解对于未来利用新型支架优化 DAO 抑制剂的努力尤其重要。