16-dihydrovirginiamycin M₁ | 89104-77-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 大环内酯内酰胺
• 英文名称: 16-dihydrovirginiamycin M₁
• 英文别名: 16S-dihydrovirginiamycin M₁；(16S)-16-deoxo-16-hydroxypristinamycin IIA；(10R,11R,12E,17E,19E,21S,23S)-21,23-dihydroxy-11,19-dimethyl-10-propan-2-yl-9,26-dioxa-3,15,28-triazatricyclo[23.2.1.03,7]octacosa-1(27),6,12,17,19,25(28)-hexaene-2,8,14-trione
• CAS: 89104-77-8
• 化学式: C₂₈H₃₇N₃O₇
• 分子量: 527.618
• InChiKey: POYSSLVLYAFLLJ-NJGWNZBQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  142
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  16-dihydrovirginiamycin M₁ 在 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 24.0h， 以31%的产率得到(12E,17E,19E)-(10R,11R,23R)-23-Hydroxy-10-isopropyl-11,19-dimethyl-9,26-dioxa-3,15,28-triaza-tricyclo[23.2.1.0^3,7]octacosa-1(27),6,12,17,19,25(28)-hexaene-2,8,14,21-tetraone
  参考文献：
  名称：

  Preparation of 14,36-didehydro pristinamycins IIs

  摘要：

  The first successful preparation of 14,36-didehydro pristinamycins IIA and IIB is reported via different strategies. (C) 2003 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(03)00341-7
• 作为产物：
  描述：

  达福普丁甲磺酸 在 sodium tetrahydroborate 作用下， 以 四氢呋喃 、 aq. phosphate buffer 、 乙醇 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 16-dihydrovirginiamycin M₁
  参考文献：
  名称：

  链霉素 A 衍生物作为线粒体翻译抑制剂抑制胶质母细胞瘤干细胞生长

  摘要：

  胶质母细胞瘤治疗的新治疗策略，尤其是处理肿瘤的胶质母细胞瘤干细胞 (GSC) 成分，是一项紧迫的医疗需求。最近，线粒体翻译抑制已被证明会影响 GSC 的生长、克隆形成和自我更新能力，因此成为一个有吸引力的治疗靶点。抑制线粒体核糖体功能的链阳菌素 B 和 A 抗生素奎奴普丁/达福普汀 (Q/D) 的组合在体外更有效地影响 GSC比护理替莫唑胺的标准。在这里，基于 Q/D 结合线粒体核糖体的冷冻电镜结构的对接计算已被用于开发一系列链阳霉素 A 衍生物。我们从达福普汀和维吉尼亚霉素 M1 支架开始获得了 22 个新的和已知的分子。进行结构-活性关系细化以评估这些化合物单独或与奎奴普汀组合抑制 GSC 生长和抑制线粒体翻译的能力。最后，定量超高效液相色谱-质谱法使我们能够评估其中一些衍生物的细胞渗透。其中，达福普汀和维吉尼亚霉素M1的氟衍生物(16 R )-1e和(16 R )-2e，分别，flopristin

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2022.114979

文献信息

• Purification and Characterization of Virginiamycin M ₁ Reductase from <i>Streptomyces virginiae</i>
  作者：Naoyoshi Suzuki、Chang-Kwon Lee、Takuya Nihira、Yasuhiro Yamada

  DOI：10.1128/aac.42.11.2985

  日期：1998.11

  Virginiamycin M ₁ (VM ₁ ), produced by Streptomyces virginiae , is a polyunsaturated macrocyclic lactone antibiotic belonging to the virginiamycin A group. S. virginiae possesses an activity which stereospecifically reduces a 16-carbonyl group of VM ₁ , resulting in antibiotically inactive 16 R -dihydroVM ₁ . The corresponding VM ₁ reductase was purified to homogeneity from crude extracts of S. virginiae in five steps, with 5,650-fold purification and 23% overall yield. The N-terminal amino acid sequence was determined to be MAIKLVIA. The purified enzyme showed an apparent M _r of 73,000 by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis and an M _r of 280,000 by native molecular sieve high-performance liquid chromatography, indicating the tetrameric nature of the native enzyme. NADPH served as a coenzyme for the reduction, with a K _m value of 0.13 mM, but NADH did not support the reaction, even at a concentration of 5 mM, indicating the NADPH-specific nature of the enzyme. The K _m for VM ₁ was determined to be 1.5 mM in the presence of 2 mM NADPH. In the reverse reaction, only 16 R -dihydroVM ₁ , not the 16 S -epimer, served as a substrate, with a less than 0.1% overall reaction rate compared to that of the forward reaction, confirming that the VM ₁ reductase participates solely in VM ₁ inactivation in vivo.

  由 Streptomyces virginiae 生产的多不饱和大环内酯类抗生素，属于维吉纳霉素 A 组，其中维吉纳霉素 M₁（VM₁）是一种。 S. virginiae 具有一种活性，可以立体特异性地还原 VM₁ 的 16-羰基，从而形成抗生素不活性的 16R-二氢 VM₁。从 S. virginiae 的粗提物中，经过五个步骤纯化得到相应的 VM₁ 还原酶，纯度为 5,650 倍，总收率为 23%。其 N-末端氨基酸序列为 MAIKLVIA。纯化的酶在十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳中表现出明显的分子量为 73,000，并且在天然分子筛高效液相色谱中表现出分子量为 280,000，表明天然酶的四聚体性质。NADPH 作为还原的辅酶，其 K_m 值为 0.13 mM，但是即使在 5 mM 的浓度下，NADH 也不能支持反应，表明该酶具有 NADPH 特异性。在 2 mM NADPH 存在下，VM₁ 的 K_m 值为 1.5 mM。在反向反应中，只有 16R-二氢 VM₁ 而不是 16S-表异构体作为底物，其反应速率仅相当于正向反应的不到 0.1%，从而确认 VM₁ 还原酶仅参与 VM₁ 在体内的失活。

• Lee, Chang-Kwon; Minami, Masashi; Sakuda, Shohei, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 1996, vol. 40, # 3, p. 595 - 601
  作者：Lee, Chang-Kwon、Minami, Masashi、Sakuda, Shohei、Nihira, Takuya、Yamada, Yasuhiro

  DOI：——

  日期：——
• [EN] NEW THERAPY FOR THE TREATMENT OF TUMORS<br/>[FR] NOUVELLE THÉRAPIE POUR LE TRAITEMENT DE TUMEURS
  申请人：UNIV DEGLI STUDI DI TRENTO

  公开号：WO2021239667A1

  公开（公告）日：2021-12-02

  Compound of formula (I) or pharmaceutically acceptable stereoisomers and/or salts thereof, alone or in combination with quinupristin or pharmaceutically acceptable salts thereof, for use in the treatment of tumors, formula (I).
• Preparation of 14,36-didehydro pristinamycins IIs
  作者：Baptiste Ronan、Eric Bacqué、Jean-Claude Barrière、Serge Sablé

  DOI：10.1016/s0040-4020(03)00341-7

  日期：2003.4

  The first successful preparation of 14,36-didehydro pristinamycins IIA and IIB is reported via different strategies. (C) 2003 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• Streptogramin A derivatives as mitochondrial translation inhibitors to suppress glioblastoma stem cell growth
  作者：Denise Sighel、Giulia Battistini、Emanuele Filiberto Rosatti、Jacopo Vigna、Matteo Pavan、Romina Belli、Daniele Peroni、Federica Alessandrini、Sara Longhi、Michael Pancher、Joanna Rorbach、Stefano Moro、Alessandro Quattrone、Ines Mancini

  DOI：10.1016/j.ejmech.2022.114979

  日期：2023.1

  the cell penetration of some of these derivatives. Among all, the fluorine derivatives of dalfopristin and virginiamycin M1, (16R)-1e and (16R)-2e, respectively, and flopristin resulted in being more potent than the corresponding lead compounds and penetrating to a greater extent into the cells. We, therefore, propose these three compounds for further evaluation in vivo as antineoplastic agents.

  胶质母细胞瘤治疗的新治疗策略，尤其是处理肿瘤的胶质母细胞瘤干细胞 (GSC) 成分，是一项紧迫的医疗需求。最近，线粒体翻译抑制已被证明会影响 GSC 的生长、克隆形成和自我更新能力，因此成为一个有吸引力的治疗靶点。抑制线粒体核糖体功能的链阳菌素 B 和 A 抗生素奎奴普丁/达福普汀 (Q/D) 的组合在体外更有效地影响 GSC比护理替莫唑胺的标准。在这里，基于 Q/D 结合线粒体核糖体的冷冻电镜结构的对接计算已被用于开发一系列链阳霉素 A 衍生物。我们从达福普汀和维吉尼亚霉素 M1 支架开始获得了 22 个新的和已知的分子。进行结构-活性关系细化以评估这些化合物单独或与奎奴普汀组合抑制 GSC 生长和抑制线粒体翻译的能力。最后，定量超高效液相色谱-质谱法使我们能够评估其中一些衍生物的细胞渗透。其中，达福普汀和维吉尼亚霉素M1的氟衍生物(16 R )-1e和(16 R )-2e，分别，flopristin