inhibitors more challenging. We explored the solvent-exposed edge of the SAM adenosine moiety and systematically designed 42 analogs of adenosine carrying substituents at the C6-amino group (N6) of adenosine. We compare the inhibitory properties and binding affinity of these diverse compounds and present the crystal structures of CamA in complex with 14 of them in the presence of substrate DNA. The most
迫切需要针对内生孢子传播的艰难梭菌感染的抗毒剂。艰难梭菌特异性 DNA
腺嘌呤甲基转移酶 (C
AMA) 是有效孢子形成所必需的,并影响在结肠中的持久性。C
AMA 的活性位点是保守的,并且与数百种相关的S-
腺苷-L-甲
硫氨酸(S
AM) 依赖性甲基转移酶的活性位点非常相似,这使得选择性
抑制剂的设计更具挑战性。我们探索了 S
AM 腺苷部分的溶剂暴露边缘,并系统地设计了 42 个在
腺苷 C6
氨基 (N6) 上带有取代基的
腺苷类似物。我们比较了这些不同化合物的抑制特性和结合亲和力,并展示了在底物 DNA 存在下 C
AMA 与其中 14 种化合物形成复合物的晶体结构。这些
抑制剂中最有效的化合物39(IC 50 ∼ 0.4 μM 和K D ∼ 0.2 μM)对 C
AMA 具有选择性,对抗密切相关的细菌和哺乳动物 DNA 和 RNA
腺嘌呤甲基转移酶、蛋白质赖
氨酸和精
氨酸甲基转移酶以及人
腺苷受体。