摘要:InterProScan是一种工具,用于将给定的蛋白质序列与InterPro成员数据库的蛋白质标志进行扫描,目前包括PROSITE、PRINTS、Pfam、ProDom和SMART。标志数据库的数量及其相关的扫描工具以及进一步的细化程序使问题变得复杂。InterProScan被设计为具有可扩展性和可扩展性的系统,具有稳健的内部架构。
可用性:基于Perl的InterProScan实现可从EBI ftp服务器(ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/unix/iprscan/)获取,基于SRS的InterProScan可根据请求提供。我们提供公共网络界面(http://www.ebi.ac.uk/interpro/scan.html)以及电子邮件提交服务器(interproscan@ebi.ac.uk)。
联系人:Evgueni.Zdobnov@EBI.ac.uk
* 应该向谁通讯。
摘要:InterProScan是一种工具,用于将给定的蛋白质序列与InterPro成员数据库的蛋白质标志进行扫描,目前包括PROSITE、PRINTS、Pfam、ProDom和SMART。标志数据库的数量及其相关的扫描工具以及进一步的细化程序使问题变得复杂。InterProScan被设计为具有可扩展性和可扩展性的系统,具有稳健的内部架构。
可用性:基于Perl的InterProScan实现可从EBI ftp服务器(ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/unix/iprscan/)获取,基于SRS的InterProScan可根据请求提供。我们提供公共网络界面(http://www.ebi.ac.uk/interpro/scan.html)以及电子邮件提交服务器(interproscan@ebi.ac.uk)。
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