2-[6,7,7,19,19,20-Hexamethyl-9,17-bis(sulfomethyl)-2-oxa-20-aza-6-azoniapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,8,10,12,15,17,21-nonaen-13-yl]benzoate | 1200336-33-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 新黄酮类化合物
• 英文名称: 2-[6,7,7,19,19,20-Hexamethyl-9,17-bis(sulfomethyl)-2-oxa-20-aza-6-azoniapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,8,10,12,15,17,21-nonaen-13-yl]benzoate
• 英文别名: 2-[6,7,7,19,19,20-hexamethyl-9,17-bis(sulfomethyl)-2-oxa-20-aza-6-azoniapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,8,10,12,15,17,21-nonaen-13-yl]benzoate
• CAS: 1200336-33-9
• 化学式: C₃₄H₃₄N₂O₉S₂
• 分子量: 678.784
• InChiKey: WNZNDKPRTMCQAD-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  181
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-[6,7,7,19,19,20-Hexamethyl-9,17-bis(sulfomethyl)-2-oxa-20-aza-6-azoniapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,8,10,12,15,17,21-nonaen-13-yl]benzoate 在 光气 、 四(三苯基膦)钯 、 对甲苯磺酸 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲酸 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 9.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  掩蔽的5种主要颜色的若丹明染料通过2-重氮-1-茚满酮笼型的光解揭示：合成，光物理和光学显微镜应用

  摘要：

  合成了五种基本颜色的笼状若丹明染料（Rhodamines NN），并用作亚衍射和常规光学显微镜中的“隐藏”标记。用2-重氮基-1-二氢茚酮基团这些掩蔽的荧光团可被不可逆光活化，或者通过与UV-或紫光（单光子过程）辐照，或通过暴露于强烈的红色光（λ ~750纳米;双光子模式）。所有染料都具有一个很小的2-重氮酮笼罩基团，该基团被并入带有重碳原子（C-3）和螺-9 H-氧杂蒽片段的2-重氮-1-茚满酮残基中。最初它们是非着色（淡黄色），非荧光，并且在吸收λ = 330-350纳米（摩尔消光系数（ε）≈10 4 中号-1 厘米-1）带的边缘延伸到大约λ = 440 nm。未老化衍生物的吸收带和发射带在很宽的范围内可调（分别为λ = 511–633和525–653 nm）。未掩蔽染料高度着色和荧光（ε = 3-8×10 4 中号-1 厘米-1和荧光量子产率（φ在未结合状态，并在甲醇）= 40-85

  DOI：

  10.1002/chem.201403316
• 作为产物：
  描述：

  在 硫酸 作用下， 以76%的产率得到2-[6,7,7,19,19,20-Hexamethyl-9,17-bis(sulfomethyl)-2-oxa-20-aza-6-azoniapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,8,10,12,15,17,21-nonaen-13-yl]benzoate
  参考文献：
  名称：

  罗丹明螺酰胺用于多色单分子开关荧光纳米显微镜

  摘要：

  描述了新罗丹明螺酰胺的设计，合成和评估。这些分子基于荧光单个分子的随机转换而在光学纳米技术中具有应用。新标记可用于各种对象的（共）定位研究，并且它们的（相互）位置和形状可以几十纳米的精度确定。由于若丹明螺环酰胺上存在各种官能团，因此实现了多色染色，良好的光活化，大量发射的光子以及与氨基或硫醇基团的选择性化学结合。刚性化的磺化x吨片段与六元环N，N'融合-双（2,2,2-三氟乙基）基团以及额外的双键和磺酸基团与简单的脂肪族螺酰胺残基的结合提供了多色性质，并提高了若丹明螺酰胺在光活化和生物共轭反应中的性能。将光开关组件的两个基本部分（开关和荧光（报告）基团）组合在一个化学实体中，使这种方法对于进一步开发具有吸引力。介绍了一系列罗丹明螺酰胺及其最相关特性的表征，这些特性可用作荧光探针在单分子转换和定位显微镜中的应用。

  DOI：

  10.1002/chem.200901333

文献信息

• New GM1 Ganglioside Derivatives for Selective Single and Double Labelling of the Natural Glycosphingolipid Skeleton
  作者：Svetlana M. Polyakova、Vladimir N. Belov、Sergey F. Yan、Christian Eggeling、Christian Ringemann、Günter Schwarzmann、Armin de Meijere、Stefan W. Hell

  DOI：10.1002/ejoc.200900645

  日期：2009.10

  Selective single and double labelling of the natural ganglioside GM1 enables one to introduce various markers into different parts of the glycosphingolipid molecule without changing the natural skeleton. To that end, N-Fmoc-2amino-, N-Fmoc-18-amino- and S-(ethoxythiocarbonyl)-18mercaptostearic acids have been prepared and coupled with the primary amino group in the sphingosine part of lyso-GM1 and

  天然神经节苷脂 GM1 的选择性单标记和双标记使人们能够在不改变天然骨架的情况下将各种标记引入鞘糖脂分子的不同部分。为此，制备了 N-Fmoc-2amino-、N-Fmoc-18-amino-和 S-(ethoxythiocarbonyl)-18mercaptostearic 酸，并与 lyso-GM1 和 deAc-deAcyl 鞘氨醇部分的伯氨基偶联-GM1 神经节苷脂。这些偶联反应的产物——结构单元 16a、16b、16c、26 和 27——可用于合成具有一个或两个荧光染料部分或其他各种标记的 GM1 衍生物。
• STAINING AGENT FOR STAINING TISSUE, PRODUCTION METHOD FOR STAINING AGENT FOR STAINING TISSUE AND TISSUE STAINING KIT INCLUDING STAINING AGENT FOR STAINING TISSUE
  申请人：Konica Minolta, Inc.

  公开号：US20180128719A1

  公开（公告）日：2018-05-10

  An object of the present invention is to provide: a staining agent for tissue staining which has an improved fluorescence signal evaluation accuracy; and a tissue staining kit comprising the staining agent. The staining agent for tissue staining contains, as a staining component, dye-resin particles comprising thermosetting resin particles and a fluorescent dye immobilized on the resin particles, wherein the resin particles contains a substituent having an electric charge opposite to that of the fluorescent dye and forms an ionic bond or a covalent bond with the fluorescent dye, and the dye-resin particles have a particle size variation coefficient of 15% or less.
• US9903797B2
  申请人：——

  公开号：US9903797B2

  公开（公告）日：2018-02-27
• US9951085B2
  申请人：——

  公开号：US9951085B2

  公开（公告）日：2018-04-24
• Rhodamine Spiroamides for Multicolor Single-Molecule Switching Fluorescent Nanoscopy
  作者：Vladimir N. Belov、Mariano L. Bossi、Jonas Fölling、Vadim P. Boyarskiy、Stefan W. Hell

  DOI：10.1002/chem.200901333

  日期：2009.10.19

  good photoactivation, a large number of emitted photons, and selective chemical binding with amino or thiol groups were achieved due to the presence of various functional groups on the rhodamine spiroamides. Rigidized sulfonated xanthene fragment fused with six‐membered rings, N,N′‐bis(2,2,2‐trifluoroethyl) groups, and a combination of additional double bonds and sulfonic acid groups with simple aliphatic

  描述了新罗丹明螺酰胺的设计，合成和评估。这些分子基于荧光单个分子的随机转换而在光学纳米技术中具有应用。新标记可用于各种对象的（共）定位研究，并且它们的（相互）位置和形状可以几十纳米的精度确定。由于若丹明螺环酰胺上存在各种官能团，因此实现了多色染色，良好的光活化，大量发射的光子以及与氨基或硫醇基团的选择性化学结合。刚性化的磺化x吨片段与六元环N，N'融合-双（2,2,2-三氟乙基）基团以及额外的双键和磺酸基团与简单的脂肪族螺酰胺残基的结合提供了多色性质，并提高了若丹明螺酰胺在光活化和生物共轭反应中的性能。将光开关组件的两个基本部分（开关和荧光（报告）基团）组合在一个化学实体中，使这种方法对于进一步开发具有吸引力。介绍了一系列罗丹明螺酰胺及其最相关特性的表征，这些特性可用作荧光探针在单分子转换和定位显微镜中的应用。