摘要:
在小分子-RNA相互作用的研究中,合成了一系列具有氨基烷氧基取代基的x吨酮和噻吨酮衍生物作为荧光指示剂,用于位移测定。通过荧光滴定和置换分析,相对于2,7-双(2-氨基乙氧基)蒽酮(X2S),通过对RNA二级结构中环区改善的结合选择性,研究了这些分子的RNA结合特性。使用了11链节的双链RNA和模仿HIV-1 mRNA的Rev反应元件(RRE)RNA茎环IIB的发夹RNA。具有更长氨基烷基取代基的X2S衍生物对双链RNA的亲和力高于亲本分子。在X2S的氨基乙氧基部分上引入甲基可有效调节对RNA二级结构的选择性。C1'位置的甲基取代抑制了与环区域的结合。氨基氮原子上的两个甲基取代导致与双链区域的亲和力降低了40%。对于噻吨酮衍生物,也观察到甲基取代对氨基氮原子的影响。然而,滴定实验表明,噻吨酮衍生物比x吨酮衍生物具有更显着的多重结合RNA的趋势。根据对双链和环区域的亲和力计算出的选择性指数表