6-Dimethylamino-naphthalene-2-carboxylic acid (2-{9-{(2R,4S,5R)-5-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-6-[2-(4-nitro-phenyl)-ethoxy]-9H-purin-2-ylamino}-ethyl)-amide | 872419-13-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 6-Dimethylamino-naphthalene-2-carboxylic acid (2-{9-{(2R,4S,5R)-5-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-6-[2-(4-nitro-phenyl)-ethoxy]-9H-purin-2-ylamino}-ethyl)-amide
• CAS: 872419-13-1
• 化学式: C₅₄H₅₄N₈O₉
• 分子量: 959.071
• InChiKey: CFYDVENJVZXFNF-OFHDNNAJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.09
• 重原子数：
  71.0
• 可旋转键数：
  20.0
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  197.49
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  15.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-Dimethylamino-naphthalene-2-carboxylic acid (2-{9-{(2R,4S,5R)-5-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-6-[2-(4-nitro-phenyl)-ethoxy]-9H-purin-2-ylamino}-ethyl)-amide 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 Diisopropyl-phosphoramidous acid (2R,3S,5R)-2-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-5-{2-{2-[(6-dimethylamino-naphthalene-2-carbonyl)-amino]-ethylamino}-6-[2-(4-nitro-phenyl)-ethoxy]-purin-9-yl}-tetrahydro-furan-3-yl ester 2-cyano-ethyl ester
  参考文献：
  名称：

  Monitoring of Microenvironmental Changes in the Major and Minor Grooves of DNA by Dan-Modified Oligonucleotides

  摘要：

  We describe the synthesis of new environmentally sensitive fluorescence probes to elucidate DNA structures. DNA oligonucleotides containing fluorophore dan (6-(dimethylamino)-2-acylnaphthalene)-modified dC or dG were able to monitor the microenvironmental changes in both the major and minor grooves of DNA with a B- to A-DNA conformational transition and RNA hybridization.

  DOI：

  10.1021/ol052473m
• 作为产物：
  描述：

  6-甲氧基-2-萘甲酸 在 吡啶 、 盐酸 、 N,N-二甲基丙烯基脲 、 氯化亚砜 、 氢氟酸 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 41.0h， 生成 6-Dimethylamino-naphthalene-2-carboxylic acid (2-{9-{(2R,4S,5R)-5-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-6-[2-(4-nitro-phenyl)-ethoxy]-9H-purin-2-ylamino}-ethyl)-amide
  参考文献：
  名称：

  Monitoring of Microenvironmental Changes in the Major and Minor Grooves of DNA by Dan-Modified Oligonucleotides

  摘要：

  We describe the synthesis of new environmentally sensitive fluorescence probes to elucidate DNA structures. DNA oligonucleotides containing fluorophore dan (6-(dimethylamino)-2-acylnaphthalene)-modified dC or dG were able to monitor the microenvironmental changes in both the major and minor grooves of DNA with a B- to A-DNA conformational transition and RNA hybridization.

  DOI：

  10.1021/ol052473m