[(2R,3S,5R)-2-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[2-(2-methylpropanoylamino)-6-oxo-1H-purin-9-yl]oxolan-3-yl]oxy-(2-cyanoethoxy)-oxidophosphaniumyl]oxymethyl]-5-[2-(2-methylpropanoylamino)-6-oxo-1H-purin-9-yl]oxolan-3-yl] acetate | 627866-69-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: [(2R,3S,5R)-2-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[2-(2-methylpropanoylamino)-6-oxo-1H-purin-9-yl]oxolan-3-yl]oxy-(2-cyanoethoxy)-oxidophosphaniumyl]oxymethyl]-5-[2-(2-methylpropanoylamino)-6-oxo-1H-purin-9-yl]oxolan-3-yl] acetate
• CAS: 627866-69-7
• 化学式: C₅₄H₆₀N₁₁O₁₅P
• 分子量: 1134.11
• InChiKey: FWUBUPIBCPNWJR-SWARDYEYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  81
• 可旋转键数：
  24
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  324
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  20

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2R,3S,5R)-2-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[2-(2-methylpropanoylamino)-6-oxo-1H-purin-9-yl]oxolan-3-yl]oxy-(2-cyanoethoxy)-oxidophosphaniumyl]oxymethyl]-5-[2-(2-methylpropanoylamino)-6-oxo-1H-purin-9-yl]oxolan-3-yl] acetate 在 吡啶 、 二氯乙酸 、 ammonium hydroxide 、 碘 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 2'-脱氧鸟苷酰-(5'-3')-2'-脱氧-5'-鸟苷酸
  参考文献：
  名称：

  核酸模型2'-脱氧鸟苷基（5'-> 3'）-2'-脱氧-5'-鸟苷酸d（pGpG）3-和相关鸟嘌呤衍生物的酸碱性质。

  摘要：

  二核苷酸d（pGpG）是一种常用的DNA模型，用于研究DNA与金属离子之间的各种相互作用，但其酸碱性质尚未详细描述。在这项研究中，对H4 [d（pGpG）] +的六个去质子化反应进行了定量。估计了从末端P（O）（OH）2基团释放出第一质子的酸度常数（pKa = 0.65），以及一个（N7）H +位点（pKa = 2.4）的酸度常数。其余四个去质子化反应的酸度常数是通过在水溶液（25摄氏度； I = 0.1 M，NaNO3）中通过电位pH滴定法测量的：第二个（N7）H +，P（O）的去质子化的pKa值2（OH）-，两个（N1）H位分别为2.98、6.56、9.54和10.11。基于这些结果，我们显示了如何估算尚未研究的相关系统的酸度常数，例如 pGpG，它参与轮状病毒RNA聚合酶的起始步骤。简要指出了我们的研究结果与核酸的相关性。

  DOI：

  10.1039/b517904a
• 作为产物：
  描述：

  3'-O-acetyl-N2-isobutyryl-2'-deoxyguanosine 在 吡啶 、 四氮唑 、 碘 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 生成 [(2R,3S,5R)-2-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[2-(2-methylpropanoylamino)-6-oxo-1H-purin-9-yl]oxolan-3-yl]oxy-(2-cyanoethoxy)-oxidophosphaniumyl]oxymethyl]-5-[2-(2-methylpropanoylamino)-6-oxo-1H-purin-9-yl]oxolan-3-yl] acetate
  参考文献：
  名称：

  核酸模型2'-脱氧鸟苷基（5'-> 3'）-2'-脱氧-5'-鸟苷酸d（pGpG）3-和相关鸟嘌呤衍生物的酸碱性质。

  摘要：

  二核苷酸d（pGpG）是一种常用的DNA模型，用于研究DNA与金属离子之间的各种相互作用，但其酸碱性质尚未详细描述。在这项研究中，对H4 [d（pGpG）] +的六个去质子化反应进行了定量。估计了从末端P（O）（OH）2基团释放出第一质子的酸度常数（pKa = 0.65），以及一个（N7）H +位点（pKa = 2.4）的酸度常数。其余四个去质子化反应的酸度常数是通过在水溶液（25摄氏度； I = 0.1 M，NaNO3）中通过电位pH滴定法测量的：第二个（N7）H +，P（O）的去质子化的pKa值2（OH）-，两个（N1）H位分别为2.98、6.56、9.54和10.11。基于这些结果，我们显示了如何估算尚未研究的相关系统的酸度常数，例如 pGpG，它参与轮状病毒RNA聚合酶的起始步骤。简要指出了我们的研究结果与核酸的相关性。

  DOI：

  10.1039/b517904a