5-hexyn-1-yl (2-cyanoethyl) (N,N-diisopropyl) phosphoramidite | 1048985-37-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氮化合物
• 英文名称: 5-hexyn-1-yl (2-cyanoethyl) (N,N-diisopropyl) phosphoramidite
• 英文别名: 2-Cyanoethyl hex-5-yn-1-yl diisopropylphosphoramidite；3-[[di(propan-2-yl)amino]-hex-5-ynoxyphosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 1048985-37-0
• 化学式: C₁₅H₂₇N₂O₂P
• 分子量: 298.365
• InChiKey: IFNKHZIJWLUIHZ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.8
• 拓扑面积：
  45.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  甲醇 、 5-hexyn-1-yl (2-cyanoethyl) (N,N-diisopropyl) phosphoramidite 在 5-ethylthio-1H-tetrazole 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 5-hexyn-1-yl (2-cyanoethyl) methyl phosphite
  参考文献：
  名称：

  PHOSPHOROAMIDATE ESTERS, AND USE AND SYNTHESIS THEREOF

  摘要：

  本发明公开了在多核苷酸测序技术中有用的磷酰胺酯和相关的核苷酸类似物，以及用于制备这些化合物的合成方法。这些化合物包括核苷酸磷酰胺类似物，在α-磷酸上进行修饰，以便连接各种应用特定的取代基，如连结分子等。

  公开号：

  US20160145292A1
• 作为产物：
  描述：

  5-己炔-1-醇 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.25h， 以86%的产率得到5-hexyn-1-yl (2-cyanoethyl) (N,N-diisopropyl) phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  硫醇反应性前荧光团标记：用于监测细胞摄取的前荧光标记寡核苷酸的合成。

  摘要：

  前荧光标记的寡核苷酸是经典的荧光标记寡核苷酸的潜在替代工具，可用于监测细胞摄取。在这里，我们报告设计和合成的硫醇响应前荧光团标记的寡核苷酸，以及其对试管和活细胞中谷胱甘肽的荧光响应。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2020.127222

文献信息

• 化合物、蛍光標識導入剤、及び蛍光標識導入方法
  申请人：学校法人神奈川大学

  公开号：JP2019196349A

  公开（公告）日：2019-11-14

  【課題】細胞外では蛍光を示さない一方で、細胞に取り込まれると蛍光を発する蛍光標識をもつ化合物、及びそのような蛍光標識を導入するための蛍光標識導入剤を提供すること。【解決手段】下記一般式（１）で表す化合物を使用する。下記一般式（１）中、Ａは、細胞膜を通して細胞内へ取り込まれ得る生体物質又はその誘導体の構造を含む１価の基であり、ＦＬは、蛍光発光を示しかつ窒素原子を有する環状骨格をもつ蛍光ユニットであり、Ｌは、ＡとＦＬとを結合する２価の基であり、Ｘは、単結合又は−Ｃ（＝Ｏ）Ｏ−であり、波線で表す結合は、ＦＬに含まれる上記窒素原子への結合であり、Ａｒは、パラ位又はオルト位に結合を有する２価の芳香環であり、Ｒは、ニトロ基又は−Ｓ−Ｓ−Ｒ１であり、Ｒ１は、一価の基であり、ｎは、１〜３の整数である。【選択図】なし

  提供具有在细胞外不显示荧光，但在细胞内摄取后会发出荧光的荧光标记化合物，以及用于引入此类荧光标记的荧光标记引入剂。采用以下通用式（1）所表示的化合物。在通用式（1）中，A表示包含能够通过细胞膜摄取到细胞内的生物物质或其衍生物结构的一价基团，FL表示具有发出荧光并含有氮原子的环状骨架的荧光单元，L表示连接A和FL的二价基团，X表示单键或者-C（=O）O-，虚线表示连接到FL中上述氮原子的结合，Ar表示在对位或邻位上具有结合的二价芳香环，R表示硝基或者-S-S-R1，R1表示一价基团，n为1~3的整数。【选择图】无
• Synthesis of Biotinylated c-di-Gmp And c-di-Amp using Click Conjugation
  作者：Barbara L. Gaffney、Nicholas D. Stebbins、Roger A. Jones

  DOI：10.1080/15257770.2012.748196

  日期：2013.1

  The biotinylated c-di-GMP and c-di-AMP conjugates 10a/b were synthesized by a straightforward set of procedures from standard, commercially available phosphoramidites. Their availability should allow isolation and characterization of new protein and RNA receptors for these key bacterial signaling molecules.

  生物素化的 c-di-GMP 和 c-di-AMP 缀合物10a/b是通过一组简单的程序从标准的市售亚磷酰胺合成的。它们的可用性应该允许分离和表征这些关键细菌信号分子的新蛋白质和 RNA 受体。
• PROBE INVERSION PROCESS FOR IN SITU SYNTHESIZED PROBE ARRAYS
  申请人：Centrillion Technology Holdings Corporation

  公开号：EP3133171A1

  公开（公告）日：2017-02-22

  The present disclosure relates to processes for inverting oligonucleotide probes in an in situ synthesized array. These processes can be used to reverse the orientation of probes with respect to the substrate from 3'-bound to 5'-bound. These processes can also be used to reduce or eliminate the presence of truncated probe sequences from an in situ synthesized array.

  本公开涉及将原位合成阵列中的寡核苷酸探针反转的过程。这些工艺可用于将探针相对于底物的方向从 3'-结合反转为 5'-结合。这些过程还可用于减少或消除原位合成阵列中存在的截短探针序列。
• Phosphoroamidate esters, and use and synthesis thereof
  申请人：Stratos Genomics, Inc.

  公开号：US10301345B2

  公开（公告）日：2019-05-28

  Phosphoramidate esters and related nucleotide analogs useful in polynucleotide sequencing techniques, and synthetic methods for preparing those compounds, are disclosed, including compounds having the following structure: wherein R1, R2, R3 and R4 are as defined herein. These compounds include nucleotide phosphoramidates analogs that are modified on the alpha-phosphate to enable attachment of a variety of application-specific substituents such as tether molecules

  本发明公开了用于多核苷酸测序技术的磷酰胺酯和相关核苷酸类似物，以及制备这些化合物的合成方法，包括具有以下结构的化合物：其中 R1、R2、R3 和 R4 如本文所定义。 这些化合物包括核苷酸磷酰胺类似物，这些类似物在α-磷酸上进行了修饰，可以连接各种特定应用的取代基，如系链分子。
• Monoliths with attached recognition compounds, arrays thereof and uses thereof
  申请人：DICE Molecules SV LLC

  公开号：US10358641B2

  公开（公告）日：2019-07-23

  Provided herein are monoliths with attached recognition compounds which selectively bind ligands, methods of preparing such monoliths, arrays thereof and uses thereof. For example, monoliths provide herein can be used in columns and arrays thereof.

  本文提供了附有可选择性结合配体的识别化合物的单片、制备此类单片的方法、其阵列及其用途。例如，本文提供的单片可用于色谱柱及其阵列。