(2S,3R,E)-2-aminonon-4-ene-1,3-diol | 850499-59-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氮化合物
• 英文名称: (2S,3R,E)-2-aminonon-4-ene-1,3-diol
• 英文别名: (E,2S,3R)-2-aminonon-4-ene-1,3-diol
• CAS: 850499-59-1
• 化学式: C₉H₁₉NO₂
• 分子量: 173.255
• InChiKey: FWCFYFMVSACKKJ-VFPASMGPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  12
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  66.5
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S,3R,E)-2-aminonon-4-ene-1,3-diol 、 辛酰氯 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 生成 N-((2S,3R,E)-1,3-dihydroxynon-4-en-2-yl)octanamide
  参考文献：
  名称：

  Exploring Leishmania major Inositol Phosphorylceramide Synthase (LmjIPCS): Insights into the ceramide binding domain

  摘要：

  本文描述了一组神经酰胺类似物的合成，这些类似物探讨了酰基链的疏水性、羟基化的程度和性质。它们已被用于检测寄生原生动物酶LmjIPCS。这些研究表明，尽管C-3羟基团对酶的代谢转化不是必需的，但它提供了增强的亲和力。鉴于该酶的膜结合性质，需要一个长（C13）碳氢神经酰胺尾部以实现高亲和力和代谢转化。虽然N-酰基链也对亲和力有所贡献，但缺乏酰胺键连接的类似物在酶和细胞基础测试中作为竞争性抑制剂发挥了作用。针对这一观察结果，我们提出了一个理论模型。

  DOI：

  10.1039/c0ob00871k
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl ((2S,3R,E)-1,3-dihydroxynon-4-en-2-yl)carbamate 在 三氟乙酸 、 碳酸氢钠 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 以54%的产率得到(2S,3R,E)-2-aminonon-4-ene-1,3-diol
  参考文献：
  名称：

  Exploring Leishmania major Inositol Phosphorylceramide Synthase (LmjIPCS): Insights into the ceramide binding domain

  摘要：

  本文描述了一组神经酰胺类似物的合成，这些类似物探讨了酰基链的疏水性、羟基化的程度和性质。它们已被用于检测寄生原生动物酶LmjIPCS。这些研究表明，尽管C-3羟基团对酶的代谢转化不是必需的，但它提供了增强的亲和力。鉴于该酶的膜结合性质，需要一个长（C13）碳氢神经酰胺尾部以实现高亲和力和代谢转化。虽然N-酰基链也对亲和力有所贡献，但缺乏酰胺键连接的类似物在酶和细胞基础测试中作为竞争性抑制剂发挥了作用。针对这一观察结果，我们提出了一个理论模型。

  DOI：

  10.1039/c0ob00871k

文献信息

• CERAMIDE DERIVATIVE AND GOLGI APPARATUS-LABELING FLUORESCENT PROBE USING SAME
  申请人：Nishida Atsushi

  公开号：US20140329266A1

  公开（公告）日：2014-11-06

  A measure for selective fluorescent labeling of the Golgi apparatus, which has low cytotoxicity and excellent intracellular stability, is provided. According to the present invention, provided are a ceramide derivative represented by the following Chemical formula 1: in the formula, R 1 is an alkyl group having 1 to 12 carbon atoms, R 2 is an alkyl group having 1 to 20 carbon atoms, and n is an integer of 1 to 20, and a Golgi apparatus-labeling fluorescent probe using the same.
• Compositions and Methods for Conjugating Oligonucleotides
  申请人：Agilent Technologies, Inc.

  公开号：US20150133631A1

  公开（公告）日：2015-05-14

  An oligonucleotide derivative having the structure of formula (A) and methods for preparing the oligonucleotide derivative are disclosed. wherein R 3 is a first oligonucleotide; R 1 is selected from the group consisting of alkyl, cycloalkyl, aryl, heterocyclyl, heteroaryl, a polyethylene glycol, a peptide, a protein, a polysaccharide, and a second oligonucleotide; R 2 is a linker or a direct bond; Z 1 is NR 4 , S, or O, and Z 2 is NR 4 or S, wherein R 4 is selected from H, alkyl, aryl, heterocyclyl, or heteroaryl. A method includes: synthesizing an oligonucleotide derivative comprising an amino or thiol group; and reacting a 3,4-dialkoxycyclobutene-1,2-dione with the oligonucleotide derivative to produce an oligonucleotide-squarate mono-conjugate.
• US9207232B2
  申请人：——

  公开号：US9207232B2

  公开（公告）日：2015-12-08
• US9512163B2
  申请人：——

  公开号：US9512163B2

  公开（公告）日：2016-12-06