9-<2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl>-2-dimethyleneamino-6-methoxyaminopurine 3'-(2-cyanoethyl N,N-di-isopropylphosphoramidite) | 136986-37-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 9-<2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl>-2-dimethyleneamino-6-methoxyaminopurine 3'-(2-cyanoethyl N,N-di-isopropylphosphoramidite)
• 英文别名: 9-[2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl]-2-dimethyleneamino-6-methoxyaminopurine 3'-(2-cyanoethyl N,N-di-isopropylphosphoramidite)
• CAS: 136986-37-3
• 化学式: C₄₄H₅₆N₉O₇P
• 分子量: 853.958
• InChiKey: FRRVVOTVTJCFMX-AYWNMRARSA-N

物化性质

• 沸点：
  881.1±75.0 °C(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.42
• 重原子数：
  61.0
• 可旋转键数：
  20.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  166.1
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-6-氯-9-(3,5-二-邻(对甲苯)-beta-d-2-脱氧呋喃核糖)嘌呤 在 吡啶 、 氨 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.5h， 生成 9-<2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl>-2-dimethyleneamino-6-methoxyaminopurine 3'-(2-cyanoethyl N,N-di-isopropylphosphoramidite)
  参考文献：
  名称：

  含有腺嘌呤-鸟嘌呤类似物的寡核苷酸的合成和双链体稳定性。

  摘要：

  已经合成了核苷N6-甲氧基-2'-脱氧腺苷（dZ）和2-氨基-9-（2-脱氧-β-呋喃呋喃糖基）-6-甲氧基氨基嘌呤（dK）并转化为5'-O-二甲氧基三苯甲基3' -（2-氰基乙基N，N-二异丙基亚磷酰胺）。这些单体已用于机器DNA合成中，以提供一组含有多达三个类似核苷酸的七核苷酸。熔解温度（Tm）表明，含有ZT和ZC碱基对的17-mer双链体的稳定性与包含KT和KC对的17-mer双链体的稳定性非常相似。它们不如相应的完全互补双链体稳定，但比包含错配对的双链体稳定。在dZ的情况下，这与在甲基亚砜中观察到的核苷的氨基亚氨基互变异构体比率约为1：4一致。

  DOI：

  10.1016/0008-6215(92)84156-m