3'-O-acetyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[[(triisopropylsilyl)oxy]methyl]uridine | 661471-84-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3'-O-acetyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[[(triisopropylsilyl)oxy]methyl]uridine
• 英文别名: [(2R,3R,4R,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-[tri(propan-2-yl)silyloxymethoxy]oxolan-3-yl] acetate
• CAS: 661471-84-7
• 化学式: C₄₂H₅₄N₂O₁₀Si
• 分子量: 774.984
• InChiKey: KPGAPVMARRJRFH-BAYOHDFESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.93
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-acetyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[[(triisopropylsilyl)oxy]methyl]uridine 在 4-二甲氨基吡啶 、 二甲基十二/十四烷基叔胺 、 三乙胺 、 甲胺 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.75h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N⁴-[(S)-1-(2-nitrophenyl)ethyl]-2'-O-[[(triisopropylsilyl)oxy]methyl]cytidine 3'-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidite)
  参考文献：
  名称：

  通过结合笼状核苷酸来调节RNA三级折叠。

  摘要：

  DOI：

  10.1002/anie.200502928
• 作为产物：
  描述：

  乙酸酐 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[[(triisopropylsilyl)oxy]methyl]uridine 在 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 1.0h， 以96%的产率得到3'-O-acetyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[[(triisopropylsilyl)oxy]methyl]uridine
  参考文献：
  名称：

  甲基化核糖核苷（ m 1 G ， m 2 G ， m 2 2 G ， m 1 I ， m 3 U ， m 4 C ， m 6 ）2'- O -[（三异丙基甲硅烷基）氧基]甲 基亚 磷 酰胺的合成 A ， m 6 2 A ）用于自动 RNA 固相合成

  摘要：

   描述了八种甲基化核糖核苷亚磷酰胺的直接合成。这些构建块允许天然存在的核苷1-甲基鸟（掺入 米 1 ģ ）， Ñ 2 -methylguanosine（ 米 2 ģ ）， Ñ 2， Ñ 2 -dimethylguanosine（ 米 2 2 G ^ ），1- methylinosine（ 米 1 I ），3-甲基尿苷（ m 3 U ）， N 4-甲基胞苷（ m 4 C ）， N 6-甲基腺苷（ m 6 A ）和 N 6， N 6-二甲基腺苷（ m 6 2 A ）通过自动 RNA 固相合成形成寡核糖核苷酸 。在所有情况下，构件的核糖2'-羟基均被最近引入的[（三异丙基甲硅烷基）氧基]甲基（ TOM ）掩盖 。

  DOI：

  10.1007/s00706-003-0592-1

文献信息

• Efficient photoactivation of a Diels-Alderase ribozyme
  作者：Alexander Nierth、Marco Singer、Andres Jäschke

  DOI：10.1039/c0cc03162c

  日期：——

  Here we report the first example of a photoactivatable ribozyme which catalyzes a bimolecular reaction of two small organic molecules with multiple turnover, under control of a photo-cleavable protecting group by exploiting the structural significance of a single hydrogen bond.

  我们在此报道了首个光活化核酶的实例，它能够催化两个小有机分子间的双分子反应，并实现多轮转换，该过程受控于一个光可裂解的保护基团，这是通过利用单个氢键的结构重要性实现的。