5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[2-(dimethylamino)-2-oxoethyl]-5-methyluridine | 304442-50-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[2-(dimethylamino)-2-oxoethyl]-5-methyluridine
• CAS: 304442-50-0
• 化学式: C₃₅H₃₉N₃O₉
• 分子量: 645.709
• InChiKey: YPJJUDFNCLUBNA-CSEBVFCESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  47.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.34
• 拓扑面积：
  141.55
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  丁二酸酐 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[2-(dimethylamino)-2-oxoethyl]-5-methyluridine 在 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 以96%的产率得到Succinic acid mono-[(2R,3R,4R,5R)-2-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-dimethylcarbamoylmethoxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-3-yl] ester
  参考文献：
  名称：

  2'-O- [2-（氨基）-2-氧代乙基]寡核苷酸。

  摘要：

  [结构：见正文]具有新颖修饰的寡核苷酸，2'-O- [2-（氨基）-2-氧代乙基]（2'-O-NAc），2'-O- [2-（甲基氨基）-2-氧代乙基]（2'-O-NMAc），2'-O- [2-（二甲基氨基）-2-氧代乙基]（2'-O-DMAc）和2'-O- [2-[[2-（已经合成了[二甲基氨基）乙基]氨基] -2-氧代乙基]（2'-O-DMAEAc）。这些修饰的寡核苷酸显示出对互补RNA（而非DNA）的高结合亲和力，并在t（1/2）> 24 h时大大增强了寡核苷酸的核酸酶稳定性。

  DOI：

  10.1021/ol027131k
• 作为产物：
  描述：

  N3-benzyloxymethyl-2'-O-(2-methoxy-2-oxoethyl)-5-methyluridine 在 palladium on activated charcoal 4-二甲氨基吡啶 、 氢气 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 甲醇 为溶剂， 20.0 ℃ 、206.85 kPa 条件下， 反应 48.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[2-(dimethylamino)-2-oxoethyl]-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  2'-O- [2-（氨基）-2-氧代乙基]寡核苷酸。

  摘要：

  [结构：见正文]具有新颖修饰的寡核苷酸，2'-O- [2-（氨基）-2-氧代乙基]（2'-O-NAc），2'-O- [2-（甲基氨基）-2-氧代乙基]（2'-O-NMAc），2'-O- [2-（二甲基氨基）-2-氧代乙基]（2'-O-DMAc）和2'-O- [2-[[2-（已经合成了[二甲基氨基）乙基]氨基] -2-氧代乙基]（2'-O-DMAEAc）。这些修饰的寡核苷酸显示出对互补RNA（而非DNA）的高结合亲和力，并在t（1/2）> 24 h时大大增强了寡核苷酸的核酸酶稳定性。

  DOI：

  10.1021/ol027131k