(2R,3R,4S)-2-hydroxymethylpiperidine-3,4-diol | 156639-77-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 哌啶类
• 英文名称: (2R,3R,4S)-2-hydroxymethylpiperidine-3,4-diol
• 英文别名: (2R,4S)-2-(hydroxymethyl)piperidin-3,4-diol；D-4-epi-fagomine；3-epi-fagomine；3-epifagomine；D-3-epifagomine；(2R,3R,4S)-2-(hydroxymethyl)piperidine-3,4-diol
• CAS: 156639-77-9
• 化学式: C₆H₁₃NO₃
• 分子量: 147.174
• InChiKey: YZNNBIPIQWYLDM-NGJCXOISSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.4
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  72.7
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(adamantan-1-yl-methoxy)-1-bromo-pentane 、 (2R,3R,4S)-2-hydroxymethylpiperidine-3,4-diol 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 (2R,3R,4S)-1-(5-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-yl)methoxy)pentyl)-2-(hydroxymethyl)piperidine-3,4-diol
  参考文献：
  名称：

  基于荧光偏振活性的蛋白质谱分析法在人类非溶酶体葡萄糖基神经酰胺酶的有效，选择性抑制剂的发现中。

  摘要：

  人非溶酶体葡萄糖基神经酰胺酶（GBA2）是控制糖脂水平的几种酶之一，其活性与几种人类疾病状态相关。迫切需要设计或发现选择性的GBA2抑制剂作为化学工具和潜在的治疗剂。在这里，我们描述了基于荧光偏振活性的蛋白质谱分析（FluoPol-ABPP）测定法的发展，该测定法可从350多种亚氨基糖文库中快速鉴定GBA2抑制剂。基于FluoPol-ABPP筛选的线索生成聚焦库，并针对与其他葡糖神经酰胺代谢酶，葡糖神经酰胺合酶（GCS），溶酶体葡糖神经酰胺酶（GBA）和胞质保留β-葡糖苷酶GBA3的GBA2选择性偏移进行评估。我们的工作产生了有效的和选择性的GBA2抑制剂，

  DOI：

  10.1021/jacs.7b07352
• 作为产物：
  描述：

  (4aR,8aS)-2,2-dimethyl-4,4a,6,8a-tetrahydro[1,3]dioxino[5,4-b]pyridine-5-carboxylic acid tert-butyl ester 在 盐酸 、 oxone(R) 、 1,1,1-三氟丙酮 、 edetate disodium 、 三乙基硼氢化锂 、 碳酸氢钠 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙酸乙酯 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 (2R,3R,4S)-2-hydroxymethylpiperidine-3,4-diol
  参考文献：
  名称：

  部分脱氧脱氧野尻霉素衍生物作为葡糖神经酰胺合酶抑制剂的评估

  摘要：

  葡萄糖神经酰胺合酶 (GCS) 是一种已获批准的治疗戈谢病的药物靶点，被认为是对抗其他人类疾病（包括 2 型糖尿病）的有效靶点。临床药物N-丁基脱氧野尻霉素 (Zavesca) 被认为通过模拟其底物神经酰胺来抑制。在这项工作中，我们证明，与该模型中提出的相反，脱氧野尻霉素核心的 C2-羟基对于 GCS 抑制很重要。在这里，我们表明 C6-OH 似乎不那么重要，这可能为开发对其他糖加工酶（特别是作用于葡萄糖神经酰胺的水解酶）具有较低亲和力（与 Zavesca 相比）的 GCS 抑制剂制定指导方针。

  DOI：

  10.1021/ml200050s

文献信息

• Asymmetric Synthesis of the Four Possible Fagomine Isomers
  作者：Hiroki Takahata、Yasunori Banba、Hidekazu Ouchi、Hideo Nemoto、Atsushi Kato、Isao Adachi

  DOI：10.1021/jo034137u

  日期：2003.5.1

  The asymmetric synthesis of fagomine and its congeners 1-4 has been achieved by catalytic ring-closing metathesis (RCM). The synthesis involved the construction of the piperidene-type chiral building block 5 followed by dihydroxylation, starting from the d-serine-derived Garner aldehyde 6.

  通过催化闭环复分解（RCM）已经实现了fagomine及其同类物1-4的不对称合成。合成涉及从d-丝氨酸衍生的Garner醛6开始，构建哌啶型手性结构单元5，然后进行二羟基化反应。
• Asymmetric synthesis of 1-deoxynojirimycin and its congeners from a common chiral building block
  作者：Hiroki Takahata、Yasunori Banba、Mayumi Sasatani、Hideo Nemoto、Atsushi Kato、Isao Adachi

  DOI：10.1016/j.tet.2004.06.112

  日期：2004.9

  A new, promising chiral building block 9 for the synthesis of 1-deoxy-4,5-trans-oriented azasugars such as 1-deoxynojirimycin (1) was prepared in only four steps from the Garner aldehyde 10 using catalytic ring-closing metathesis (RCM) for the construction of the piperidine ring. In practical test, the first synthesis of all four isomers (1 and 6-8) of trans-4,5-orientated 1-deoxyiminosugars using

  使用催化闭环易位反应，从Garner醛10仅四步制备了一种新的，很有前途的手性构建体9，用于合成1-deoxy-4,5-反式氮杂糖如1-deoxynojirimycin（1）。RCM）用于哌啶环的构建。在实际的测试中，所有四种异构体（第一合成1和6 - 8）的反式-4,5-取向使用1- deoxyiminosugars 9作为共同的手性结构单元证实。
• N-containing sugars fromMorus alba and their glycosidase inhibitory activities
  作者：Naoki Asano、Kengo Oseki、Emiko Tomioka、Haruhisa Kizu、Katsuhiko Matsui

  DOI：10.1016/0008-6215(94)84060-1

  日期：1994.6

  The reexamination of N-containing sugars from the roots of Morus alba by improved purification procedures led to the isolation of eighteen N-containing sugars, including seven that were isolated from the leaves of Morus bombycis. These N-containing sugars are 1-deoxynojirimycin (1), N-methyl-1-deoxynojirimycin (2), fagomine (3), 3-epi-fagomine (4), 1,4-dideoxy-1,4-imino-D-arabinitol (5), 1,4-dideoxy-1

  通过改进的纯化程序从白桑的根中重新检测含N的糖，导致分离出18种含N的糖，其中包括7种从桑树叶片中分离得到的糖。这些含N的糖是1-deoxynojirimycin（1），N-甲基-1-deoxynojirimycin（2），fagomine（3），3-ep-fagomine（4），1,4-dideoxy-1,4-imino- D-阿拉伯糖醇（5），1,4-二甲氧基-1,4-亚氨基-D-核糖醇（6），花椰菜素B2（1 alpha，2 beta，3 alpha，4 beta-tetrahydroxy-nor-tropane，7）， calystegin C1（1 alpha，2 beta，3 alpha，4 beta，6 alpha-pentahydroxy-nor-tropane，8），1,4-dideoxy-1,4-imino-（2-O-beta-D-Dydropyranosyl） -D-
• Asymmetric synthesis of fagomine and its congeners
  作者：Yasunori Banba、Chiemi Abe、Hideo Nemoto、Atsushi Kato、Isao Adachi、Hiroki Takahata

  DOI：10.1016/s0957-4166(01)00136-7

  日期：2001.4

  The total synthesis of fagomine and its congeners 1-3 has been achieved starting from D-serine-derived Garner aldehyde 5 by catalytic ring-closing metathesis (RCM) for the construction of the piperidine ring followed by dihydroxylation. (C) 2001 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• A Fluorescence Polarization Activity-Based Protein Profiling Assay in the Discovery of Potent, Selective Inhibitors for Human Nonlysosomal Glucosylceramidase
  作者：Daniël Lahav、Bing Liu、Richard J. B. H. N. van den Berg、Adrianus M. C. H. van den Nieuwendijk、Tom Wennekes、Amar T. Ghisaidoobe、Imogen Breen、Maria J. Ferraz、Chi-Lin Kuo、Liang Wu、Paul P. Geurink、Huib Ovaa、Gijsbert A. van der Marel、Mario van der Stelt、Rolf G. Boot、Gideon J. Davies、Johannes M. F. G. Aerts、Herman S. Overkleeft

  DOI：10.1021/jacs.7b07352

  日期：2017.10.11

  assessed on GBA2 selectivity offset against the other glucosylceramide metabolizing enzymes, glucosylceramide synthase (GCS), lysosomal glucosylceramidase (GBA), and the cytosolic retaining β-glucosidase, GBA3. Our work, yielding potent and selective GBA2 inhibitors, also provides a roadmap for the development of high-throughput assays for identifying retaining glycosidase inhibitors by FluoPol-ABPP

  人非溶酶体葡萄糖基神经酰胺酶（GBA2）是控制糖脂水平的几种酶之一，其活性与几种人类疾病状态相关。迫切需要设计或发现选择性的GBA2抑制剂作为化学工具和潜在的治疗剂。在这里，我们描述了基于荧光偏振活性的蛋白质谱分析（FluoPol-ABPP）测定法的发展，该测定法可从350多种亚氨基糖文库中快速鉴定GBA2抑制剂。基于FluoPol-ABPP筛选的线索生成聚焦库，并针对与其他葡糖神经酰胺代谢酶，葡糖神经酰胺合酶（GCS），溶酶体葡糖神经酰胺酶（GBA）和胞质保留β-葡糖苷酶GBA3的GBA2选择性偏移进行评估。我们的工作产生了有效的和选择性的GBA2抑制剂，