[9-[2-[6-Aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-(2-amino-2-oxoethyl)amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]carbamoyl]phenyl]-6-[ethyl(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)amino]xanthen-3-ylidene]-ethyl-(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)azanium;chloride | 1441383-71-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: [9-[2-[6-Aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-(2-amino-2-oxoethyl)amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]carbamoyl]phenyl]-6-[ethyl(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)amino]xanthen-3-ylidene]-ethyl-(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)azanium;chloride
• CAS: 1441383-71-6
• 化学式: C₈₈H₁₂₆F₂₆N₁₅O₈*Cl
• 分子量: 2051.48
• InChiKey: NADVFCANVZDSEJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  12.27
• 重原子数：
  138
• 可旋转键数：
  67
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  337
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  42

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  [9-(2-Carboxyphenyl)-6-[ethyl(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)amino]xanthen-3-ylidene]-ethyl-(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)azanium;chloride 、 2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)(6-((tert-butoxycarbonyl)-amino)hexyl)amino)acetic acid 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 、 哌啶 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.5h， 以4.09 mg的产率得到[9-[2-[6-Aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-(2-amino-2-oxoethyl)amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]carbamoyl]phenyl]-6-[ethyl(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)amino]xanthen-3-ylidene]-ethyl-(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)azanium;chloride
  参考文献：
  名称：

  罗丹明F：一种用于生物缀合的新型氟马尾染料†

  摘要：

  含氟马尾辫如多氟化烷基残基（CH 2）m（CF 2）n CF 3的引入导致一类新型的基于若丹明的明亮荧光染料。这些染料将经常使用的若丹明染料的出色光物理性质与“轻”氟分子的独特特征相结合。这些特征之一是利用氟固相萃取（F-SPE）分离物质的可能性，这是基于氟化合物之间的特定分子间相互作用。因此，用这些新染料标记的分子不仅可以进行荧光实验，而且还可以轻松纯化（通过所谓的FluoroFlash列）使用前。染料与细胞穿透类肽结合（聚阳离子寡聚（N取代）甘氨酸）放在坚固的支架上。在研究它们的光物理和生物学特性之前，先用F-SPE纯化它们。

  DOI：

  10.1039/c3ob40267c