perfluorophenyl (R)-4-((3R,5R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-3-hydroxy-10,13-dimethylhexadecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl)pentanoate | 208402-68-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 类固醇和类固醇衍生物
• 英文名称: perfluorophenyl (R)-4-((3R,5R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-3-hydroxy-10,13-dimethylhexadecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl)pentanoate
• 英文别名: 3α-(hydroxy)-5β-cholanic acid pentafluorophenyl ester；(2,3,4,5,6-pentafluorophenyl) (4R)-4-[(3R,5R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-3-hydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoate
• CAS: 208402-68-0
• 化学式: C₃₀H₃₉F₅O₃
• 分子量: 542.63
• InChiKey: BNEPVZYEBIGGTM-JVDSNBJFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.72
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.77
• 拓扑面积：
  46.53
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  3.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  perfluorophenyl (R)-4-((3R,5R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-3-hydroxy-10,13-dimethylhexadecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl)pentanoate 在 吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 45.0h， 生成 3α-(carboxyaminopropan-3-ol)-5β-cholanic acid oleylamide
  参考文献：
  名称：

  Carrier-free cellular uptake and the gene-silencing activity of the lipophilic siRNAs is strongly affected by the length of the linker between siRNA and lipophilic group

  摘要：

  通过与分子结合，这些分子可以通过自然运输机制进入细胞，从而增强siRNA的细胞摄取。在此，我们研究了通过不同长度的亚甲基连接子将疏水性残基（胆固醇、石胆酸、油醇和石胆酸油胺）连接到正义链的5′端，制备的耐核酸酶的抗MDR1 siRNA的无载体细胞摄取。我们开发了一种方便的H-磷酸盐和磷酰胺方法的组合，用于合成siRNA的5′-疏水性偶联物。发现当在微摩尔浓度范围内使用时，疏水性siRNA能够有效地渗透到HEK293、HepG2细胞和KB-8-5癌细胞中。摄取效率取决于疏水性部分类型、部分与siRNA之间的连接子长度以及细胞类型。在所有测试的偶联物中，含有6到10个碳原子的连接子连接的胆固醇化siRNA显示出最佳的摄取和基因沉默特性：连接子缩短会降低siRNA偶联物的细胞摄取效率，而连接子延长有助于摄取，但会延迟基因沉默效应并降低沉默效率。

  DOI：

  10.1093/nar/gkr1002
• 作为产物：
  描述：

  五氟苯酚 、 石胆酸 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 20.5h， 生成 perfluorophenyl (R)-4-((3R,5R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-3-hydroxy-10,13-dimethylhexadecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl)pentanoate
  参考文献：
  名称：

  Carrier-free cellular uptake and the gene-silencing activity of the lipophilic siRNAs is strongly affected by the length of the linker between siRNA and lipophilic group

  摘要：

  通过与分子结合，这些分子可以通过自然运输机制进入细胞，从而增强siRNA的细胞摄取。在此，我们研究了通过不同长度的亚甲基连接子将疏水性残基（胆固醇、石胆酸、油醇和石胆酸油胺）连接到正义链的5′端，制备的耐核酸酶的抗MDR1 siRNA的无载体细胞摄取。我们开发了一种方便的H-磷酸盐和磷酰胺方法的组合，用于合成siRNA的5′-疏水性偶联物。发现当在微摩尔浓度范围内使用时，疏水性siRNA能够有效地渗透到HEK293、HepG2细胞和KB-8-5癌细胞中。摄取效率取决于疏水性部分类型、部分与siRNA之间的连接子长度以及细胞类型。在所有测试的偶联物中，含有6到10个碳原子的连接子连接的胆固醇化siRNA显示出最佳的摄取和基因沉默特性：连接子缩短会降低siRNA偶联物的细胞摄取效率，而连接子延长有助于摄取，但会延迟基因沉默效应并降低沉默效率。

  DOI：

  10.1093/nar/gkr1002

文献信息

• [EN] NOVEL TETRAGALNAC AND PEPTIDE CONTAINING CONJUGATES AND METHODS FOR DELIVERY OF OLIGONUCLEOTIDES<br/>[FR] NOUVEAUX CONJUGUÉS CONTENANT TÉTRAGALNAC ET PEPTIDE ET PROCÉDÉS POUR L'ADMINISTRATION D'OLIGONUCLÉOTIDES
  申请人：MERCK SHARP & DOHME

  公开号：WO2013166155A1

  公开（公告）日：2013-11-07

  Disclosed herein is a modular composition comprising 1) an oligonucleotide; 2) one or more tetraGalNAc ligands of Formula (I), which may be the same or different; optionally, 3) one or more linkers, which may be the same or different; 4) one or more peptides independently selected from Table 3, which may be the same or different; and optionally, 5) one or more targeting ligands, solubilizing agents, pharmacokinetics enhancing agents, lipids, and/or masking agents.

  本文揭示了一种模块化组合物，包括1）寡核苷酸；2）一个或多个符合式(I)的四聚GalNAc配体，可以相同也可以不同；可选地，3）一个或多个连接剂，可以相同也可以不同；4）从表3中独立选择的一个或多个肽，可以相同也可以不同；以及可选地，5）一个或多个靶向配体、增溶剂、药代动力学增强剂、脂质和/或掩蔽剂。