5'-S-acetyl-N⁶-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',5'-dideoxy-5'-thioadenosine | 172161-66-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 2 '，5'-二脱氧核苷
• 英文名称: 5'-S-acetyl-N⁶-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',5'-dideoxy-5'-thioadenosine
• 英文别名: S-[[(2S,3S,5R)-5-(6-benzamidopurin-9-yl)-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyoxolan-2-yl]methyl] ethanethioate
• CAS: 172161-66-9
• 化学式: C₂₅H₃₃N₅O₄SSi
• 分子量: 527.72
• InChiKey: HYUOFOVYKXFJLA-XUVXKRRUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.04
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-S-acetyl-N⁶-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',5'-dideoxy-5'-thioadenosine 在 甲醇 、 sodium hydroxide 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 5'-S-acetyl-3'-O-methylene-5'-deoxy-5'-thiothymidylyl-(3'->5')-N⁶-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',5'-dideoxy-5'-thioadenosine
  参考文献：
  名称：

  A versatile approach to the synthesis of oligonucleotide analogs containing neutral 5<i>'</i>-thioformacetal internucleoside linkages

  摘要：

  DOI：

  10.1139/cjc-77-8-1410
• 作为产物：
  描述：

  N-苯甲酰基-2’-脱氧腺苷 在 咪唑 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 22.0h， 生成 5'-S-acetyl-N⁶-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',5'-dideoxy-5'-thioadenosine
  参考文献：
  名称：

  A versatile approach to the synthesis of oligonucleotide analogs containing neutral 5<i>'</i>-thioformacetal internucleoside linkages

  摘要：

  DOI：

  10.1139/cjc-77-8-1410

文献信息

• A versatile approach to the synthesis of dinucleotide analogs containing neutral 5′-thioformacetal internucleoside linkages
  作者：Yves Ducharme、Kimberly A. Harrison

  DOI：10.1016/00404-0399(50)1393-v

  日期：1995.9

  Activation of nucleoside donors 5 by sulfuryl chloride followed by the addition of 5′-thionucleoside acceptors 3 yields 5′-thioformacetal dinucleotide analogs 6 with in situ trapping of liberated methanesulfenyl chloride with cyclohexene. Purine as well as pyrimidine derivatives can be part of a coupling reaction as nucleoside donors or acceptors. The dimethoxytrityl protecting group is compatible

  通过硫酰氯活化核苷供体5，然后添加5'-硫代核苷受体3，得到5'-硫代甲醛缩醛二核苷酸类似物6，其用环己烯原位捕获释放的甲磺酰氯。嘌呤以及嘧啶衍生物可以作为核苷供体或受体参与偶联反应。二甲氧基三苯甲基保护基与本偶联方法相容，从而允许差动的3'，5'-末端保护以及随之而来的正交碱基保护。