tert-butyl ((2S,3R,E)-1-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl)carbamate | 221455-36-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机金属化合物 - 有机类金属化合物
• 英文名称: tert-butyl ((2S,3R,E)-1-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl)carbamate
• 英文别名: tert-butyl N-[(E,2S,3R)-1-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl]carbamate
• CAS: 221455-36-3
• 化学式: C₂₉H₅₉NO₄Si
• 分子量: 513.877
• InChiKey: IAGCVTPNIVGSLD-AMGHMTOGSA-N

物化性质

• 沸点：
  566.7±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  0.928±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.52
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.9
• 拓扑面积：
  67.8
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl ((2S,3R,E)-1-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl)carbamate 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.5h， 以99%的产率得到D-鞘氨醇
  参考文献：
  名称：

  N-Metallocenoylsphingosines as targeted ceramidase inhibitors: Syntheses and antitumoral effects

  摘要：

  Three N-metallocenoylsphingosines with variance in the central metal (Fe, Co, Ru), the charge (neutral or cationic), and the arene ligands (Cp-2, Cp*Ph) were synthesized from serine and metallocene carboxylic acids as substrate-analogous inhibitors of human acid ceramidase (AC). Their inhibitory potential was examined using the recombinant full length ASAH1 enzyme, expressed and secreted from High Five insect cells, and the fluorescent substrate Rbm14-12. All complexes inhibited AC, most strongly so ruthenium(II) complex 13a. Some antitumoral effects of the complexes, such as the interference with the microtubular and F-actin cytoskeleton of cancer cells, were correlated to their AC-inhibition, whereas others, e.g. their cytotoxicity and their induction of caspase-3/-7 activity in cancer cells, were not. All complexes accumulated preferentially in the lysosomes of cancer cells like their target AC, arrested the cells in G1 phase of the cell cycle, and displayed cytotoxicity with mostly single-digit micromolar IC50 values while inducing cancer cell apoptosis.

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2020.103703
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl (4S,1'R)-4-(1'-hydroxy-2'-hexadecynyl)-2,2-dimethyl-3-oxazolidinecarboxylate 在 咪唑 、 甲醇 、 对甲苯磺酸 、 红铝 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 19.0h， 生成 tert-butyl ((2S,3R,E)-1-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  N-AS-triggered SPMs are direct regulators of microglia in a model of Alzheimer’s disease

  摘要：

  摘要：鞘氨醇激酶1（SphK1）是一种依赖乙酰辅酶A的乙酰转移酶，在阿尔茨海默病（AD）模型中作用于神经元中的环氧合酶2（COX2）。然而，这种活性的机制尚未被探索。在这里，我们展示了N-乙酰鞘氨醇（N-AS）首先通过乙酰辅酶A和鞘氨醇由SphK1生成。然后，N-AS乙酰化COX2的丝氨酸565（S565），而N-AS乙酰化的COX2诱导特异性促解决介质（SPMs）的产生。在AD小鼠模型中，微胶质细胞显示N-AS生成减少，导致乙酰-S565 COX2和SPM的产生减少。N-AS处理增加了AD小鼠微胶质细胞中乙酰化的COX2和N-AS触发的SPM，导致神经炎症的解决，微胶质细胞吞噬作用增加，记忆力改善。综上所述，这些结果确定了N-AS在AD微胶质细胞功能障碍中的作用。

  DOI：

  10.1038/s41467-020-16080-4

文献信息

• A Concise and Scalable Synthesis of High Enantiopurity (−)-<scp>d</scp>-<i>erythro</i>-Sphingosine Using Peptidyl Thiol Ester−Boronic Acid Cross-Coupling
  作者：Hao Yang、Lanny S. Liebeskind

  DOI：10.1021/ol070991m

  日期：2007.8.1

  A short and efficient synthesis of high enantiopurity (-)-D-erythro-sphingosine has been achieved in 71% yield over 6 steps from N-Boc-L-serine. The key steps are high yield, racemization-free, palladium-catalyzed, copper(I)-mediated coupling of the thiophenyl ester of N-Boc-O-TBS L-serine with E-1-pentadecenyl boronic acid and the highly diastereoselective reduction of the resulting peptidyl ketone

  从N-Boc-L-丝氨酸经过6步纯化，已完成了简短高效的高对映体纯度（-）-D-赤型-鞘氨醇的合成，收率达71％。关键步骤是高产率，无消旋，钯催化的N-Boc-O-TBS L-丝氨酸的硫代苯基酯与E-1-戊烯基硼酸的铜（I）介导偶联和高度非对映选择性还原LiAl（Ot-Bu）3 H制得的肽基酮。通过使用这种简洁的方法，可以大规模，高对映体和非对映体纯度（ee> 99％，最高可达99％）制备（-）-D-赤型-鞘氨醇。
• Versatile Synthetic Method for Sphingolipids and Functionalized Sphingosine Derivatives via Olefin Cross Metathesis
  作者：Tetsuya Yamamoto、Hiroko Hasegawa、Toshikazu Hakogi、Shigeo Katsumura

  DOI：10.1021/ol062258l

  日期：2006.11.1

  and versatile method for the synthesis of various sphingolipids, such as sphingomyelin, ceramide, sphingosine, sphingosine 1-phosphate, and functionalized sphingosine derivatives, was established by two types of combinations of the olefin cross metathesis reaction. One reaction was between the same olefin part and appropriate amino alcohols, which were prepared starting from N-Boc-L-serine, and the other

  通过烯烃交叉复分解反应的两种组合，建立了一种高效且通用的合成各种鞘脂的方法，如鞘磷脂，神经酰胺，鞘氨醇，1-磷酸鞘氨醇和功能化鞘氨醇衍生物。一个反应是在相同的烯烃部分与合适的氨基醇之间，它们从N-Boc-L-丝氨酸开始制备，另一个反应在合适的烯烃与相同的氨基醇之间。[反应：请参见文字]。
• Design and Synthesis of Sphingomyelin-Cholesterol Conjugates and Their Formation of Ordered Membranes
  作者：Nobuaki Matsumori、Norio Tanada、Kohei Nozu、Hiroki Okazaki、Tohru Oishi、Michio Murata

  DOI：10.1002/chem.201100849

  日期：2011.7.25

  synthesized SM–Chol conjugates with functionally designed linker portions to restrain Chol mobility and examined their formation of ordered membranes by a detergent insolubility assay, fluorescence anisotropy experiments, and fluorescence‐quenching assay. In all of the tests, membranes prepared from the conjugates showed properties of ordered domains comparable to a SM–Chol (1:1) membrane. To gain insight

  脂质筏是漂浮在脂质双层海洋中的富含胆固醇（Chol）的微区。尽管人们认为Chol优先与鞘磷脂（如鞘磷脂（SM））相互作用，而不是与甘油磷脂相互作用，但主要由于脂质分子的高迁移率和分子间相互作用较弱，因此尚未确定特异性相互作用的起源。在这项研究中，我们合成了具有功能设计的连接子部分的SM–Chol共轭物，以抑制Chol的迁移，并通过去污剂不溶性测定，荧光各向异性实验和荧光猝灭测定检查了它们的有序膜的形成。在所有测试中，由结合物制备的膜均显示出与SM–Chol（1：1）膜相当的有序结构域特性。为了深入了解由共轭物组成的双层结构，我们用64个分子的共轭物进行了分子动力学模拟，这表明共轭物通过在连接子部分弯曲而形成稳定的双层结构，并且大多数情况下会重现氢键之间的氢键。 SM和Chol部分。这些结果暗示在SM和Chol之间在有序域中的分子识别本质上是由共轭分子再现的，因此证明这些共轭分子可以潜在地用
• Design, synthesis of ceramide 1-phosphate analogs and their affinity for cytosolic phospholipase A2 as evidenced by surface plasmon resonance
  作者：Tomokazu Yasuda、Daiki Ueura、Madoka Nakagomi、Shinya Hanashima、J. Peter Slotte、Michio Murata

  DOI：10.1016/j.bmcl.2024.129792

  日期：2024.7

  Ceramide 1-phosphate (C1P) is a lipid mediator that specifically binds and activates cytosolic phospholipase Aα (cPLAα). To elucidate the structure–activity relationship of the affinity of C1P for cPLAα in lipid environments, we prepared a series of C1P analogs containing structural modifications in the hydrophilic parts and subjected them to surface plasmon resonance (SPR). The results suggested the

  神经酰胺 1-磷酸 (C1P) 是一种脂质介质，可特异性结合并激活胞质磷脂酶 Aα (cPLAα)。为了阐明脂质环境中 C1P 对 cPLAα 亲和力的构效关系，我们制备了一系列亲水部分含有结构修饰的 C1P 类似物，并对它们进行表面等离子共振 (SPR)。结果表明，C1P 结构中的酰胺基、3-OH 基和磷酸基上存在 cPLAα 的特异性结合位点。特别是，二氢-C1P 对 cPLAα 表现出增强的亲和力，表明 3-羟基的氢键能力对于与 cPLAα 的相互作用很重要。这项研究有助于了解 C1P 的特定结构部分对原子水平上与 cPLAα 相互作用的影响，并可能有助于设计调节 cPLAα 激活的药物。
• Novel Raman-tagged sphingomyelin that closely mimics original raft-forming behavior
  作者：Jin Cui、Shigeru Matsuoka、Masanao Kinoshita、Nobuaki Matsumori、Fuminori Sato、Michio Murata、Jun Ando、Hiroyuki Yamakoshi、Kosuke Dodo、Mikiko Sodeoka

  DOI：10.1016/j.bmc.2015.05.014

  日期：2015.7

  Three Raman probes of sphingomyelin (SM) were synthesized and evaluated for their applicability to imaging experiments. One probe containing a hydroxymethyl-1,3-butadiyne moiety in the polar head group showed strong scattering. The solid-state H-2 NMR spectra of this probe in oriented bilayer membrane revealed excellent compatibility with natural SM in phase behavior since the probe undergoes phase separation to form raft-like liquid ordered (L-o) domains in the raft-mimicking mixed bilayers. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.