N-(2-mercaptoethyl)-5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide | 99938-68-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 英文名称: N-(2-mercaptoethyl)-5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide
• 英文别名: Biotin-Cysteamine；5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-(2-sulfanylethyl)pentanamide
• CAS: 99938-68-8
• 化学式: C₁₂H₂₁N₃O₂S₂
• 分子量: 303.45
• InChiKey: LXWINLMLFGLKCY-QXEWZRGKSA-N

物化性质

• 沸点：
  645.6±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.208±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  96.5
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(2-mercaptoethyl)-5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide 在 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  用于表面上配体识别的双功能自旋标签。

  摘要：

  原位监测生物分子识别，尤其是在表面，仍然是一项重大的技术挑战。用氮氧化物自旋标记的生物分子的电子顺磁共振（EPR）可以提供对这些过程的独特敏感和选择性见解，但是需要新的自旋标记策略。报道了具有两个具有正交反应性的连接点的溴丙烯醛自旋标记（BASL）的合成和研究。甘露糖和生物素配体通过自旋标记偶联到羧基官能化的金纳米颗粒水溶液的第一个例子。获得自旋标记的配体在溶液中游离并附着在纳米颗粒上的EPR光谱。标记被甘露糖结合凝集素，Con A和生物素结合蛋白抗生物素蛋白过氧化物酶识别。

  DOI：

  10.1002/anie.201703929
• 作为产物：
  描述：

  (+)生物素-N-琥珀酰亚胺基酯 在 DL-dithiothreitol 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 N-(2-mercaptoethyl)-5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide
  参考文献：
  名称：

  醛介导的生物共轭作用，通过原位产生的乙叉。

  摘要：

  已经为体外和细胞应用开发了一种技术上简单的快速，高产和位点选择性生物缀合方法。该方法涉及在生理条件下通过4-硝基苯酚催化生成马来酰亚胺基，然后与附加醛的生物分子进行维蒂希反应。

  DOI：

  10.1039/c9cc07443k

文献信息

• Site-Selective Thiolation of (Multi)halogenated Heteroarenes
  作者：Frederik Sandfort、Tobias Knecht、Tobias Pinkert、Constantin G. Daniliuc、Frank Glorius

  DOI：10.1021/jacs.0c01630

  日期：2020.4.15

  complementing established methodologies such as nucleophilic aromatic substitution or palladium-catalyzed coupling reactions. Experimental and computational studies suggest a radical chain mechanism with the key step being a homolytic aromatic substitution of the heteroaryl halide by an electrophilic thiyl radical, highlighting an underdeveloped reactivity mode of these radicals.

  报告了各种药物相关的富电子杂芳烃与硫醇的位点选择性硫醇化的一般和简单策略。这种温和而可靠的光催化协议能够在（多）卤化底物的最富电子位置进行 CS 耦合，补充已建立的方法，如亲核芳香取代或钯催化的耦合反应。实验和计算研究表明了一种自由基链机制，其关键步骤是杂芳基卤化物被亲电硫基自由基的均裂芳族取代，突出了这些自由基的不发达反应模式。
• Intracellular Delivery of Functional Proteins and Native Drugs by Cell-Penetrating Poly(disulfide)s
  作者：Jiaqi Fu、Changmin Yu、Lin Li、Shao Q. Yao

  DOI：10.1021/jacs.5b08130

  日期：2015.9.23

  discovery. We report herein the development of novel methods for intracellular delivery of functional proteins (including antibodies) and native small-molecule drugs by making use of cell-penetrating poly(disulfide)s (CPDs). CPDs were recently shown to be rapidly taken up by mammalian cells in endocytosis-independent pathways, but their applications for delivery of proteins and native small-molecule

  将生物活性化合物有效递送到细胞中是药物发现的主要挑战。我们在此报告了利用细胞穿透性聚（二硫化物）（CPD）在细胞内递送功能性蛋白质（包括抗体）和天然小分子药物的新方法的发展。CPDs 最近被证明在不依赖于内吞作用的途径中被哺乳动物细胞迅速吸收，但它们在递送蛋白质和天然小分子药物方面的应用尚未得到证实。借助我们新开发的 CPD 辅助方法，使用预先合成的 CPD 在水性条件下分两步在几分钟内快速和“生物正交”装载货物。得到的 CPD-货物结合物立即用于后续的细胞递送研究。凭借这些方法的多功能性和灵活性，我们进一步表明它们可用于以最少的化学和遗传操作立即交付各种功能性货物。这些 CPD 及其载货偶联物的最小细胞毒性进一步突出了这种新的细胞转导方法相对于其他现有策略的独特优势，并确保我们的整个传递协议与后续的活细胞实验和生物学研究兼容。
• Reduction with tris(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP) enables the use of an S-sulphonate protecting group for thiol-mediated bioconjugation
  作者：Barbara Maret、Thomas Regnier、Jean-Christophe Rossi、Laurent Garrelly、Laurent Vial、Robert Pascal

  DOI：10.1039/c3ra47407k

  日期：——

  Herein, we demonstrate the effectiveness of the water-friendly S-sulphonate group as an alternative to traditional thiol protecting groups for subsequent deprotection–bioconjugation reactions, under conditions that are compatible with the use of biochemical samples.

  在此，我们展示了水亲和性S-磺酸酯基团作为传统硫醇保护基团的有效替代品，适用于后续的去保护-生物偶联反应，并且与生化样品的使用条件相兼容。
• Chemically Induced Vinylphosphonothiolate Electrophiles for Thiol–Thiol Bioconjugations
  作者：Alice L. Baumann、Sergej Schwagerus、Kevin Broi、Kristin Kemnitz-Hassanin、Christian E. Stieger、Nils Trieloff、Peter Schmieder、Christian P. R. Hackenberger

  DOI：10.1021/jacs.0c03426

  日期：2020.5.20

  on cysteine side chains within peptides and proteins. In addition to labeling the monoclonal antibody trastuzumab with excellent cysteine-selectivity, we applied our protocol for the site-specific conjugation of two proteins with unique cysteine residues yielding a non-hydrolyzable phosphonothiolate-linked diubiquitin and an ubiquitin-α-synuclein conjugate. The latter was recognized as a substrate in

  在此，我们介绍了乙烯基膦酰硫醇盐作为一类新的半胱氨酸选择性亲电试剂，用于蛋白质标记和稳定蛋白质-蛋白质缀合物的形成。我们开发了一种直接的合成路线，将亲核硫醇转化为亲电的、硫醇选择性的乙烯基膦硫醇：在该协议中，中间形成的二硫化物可以在酸性条件下化学选择性地用乙烯基膦取代，以产生所需的乙烯基膦硫醇。值得注意的是，该反应序列能够直接在肽和蛋白质内的半胱氨酸侧链上安装乙烯基硫代磷酸酯亲电试剂。除了以优异的半胱氨酸选择性标记单克隆抗体曲妥珠单抗外，我们将我们的方案应用于具有独特半胱氨酸残基的两种蛋白质的位点特异性偶联，产生不可水解的硫代膦酸酯连接的双泛素和泛素-α-突触核蛋白偶联物。后者在随后的酶促泛素化反应中被识别为底物。
• Polymer control of ligand display on gold nanoparticles for multimodal switchable cell targeting
  作者：Francesca Mastrotto、Paolo Caliceti、Vincenzo Amendola、Sara Bersani、Johannes Pall Magnusson、Moreno Meneghetti、Giuseppe Mantovani、Cameron Alexander、Stefano Salmaso

  DOI：10.1039/c1cc12654g

  日期：——

  The function of cell-specific ligands on gold nanoparticles can be selectively gated by the action of co-grafted thermosensitive polymers. Below the LCST the responsive chain-extended polymers prevent cell-surface receptors from accessing the affinity ligands while above the LCST, the polymers collapse exposing the ligands and allowing binding to receptors, which in turn promotes cell internalisation.

  金纳米粒子上的细胞特异性配体的功能可以通过共接枝热敏聚合物的作用选择性地门控。低于 LCST 时，响应性扩链聚合物会阻止细胞表面受体接触亲和配体，而高于 LCST 时，聚合物会塌陷，暴露配体并允许与受体结合，从而促进细胞内化。