N-(6-(bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)-5-(hydroxymethyl)hexyl)-5-(1,2-dithiolan-3-yl)pentanamide | 1610359-28-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-(6-(bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)-5-(hydroxymethyl)hexyl)-5-(1,2-dithiolan-3-yl)pentanamide
• 英文别名: N-[5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-6-hydroxyhexyl]-5-(dithiolan-3-yl)pentanamide
• CAS: 1610359-28-8
• 化学式: C₃₆H₄₇NO₅S₂
• 分子量: 637.905
• InChiKey: ZCQPAIXJBABGAU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.5
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(6-(bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)-5-(hydroxymethyl)hexyl)-5-(1,2-dithiolan-3-yl)pentanamide 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.0h， 以63%的产率得到6-(5-(1,2-dithiolan-3-yl)pentanamido)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)hexyl 2-cyanoethyl diisopropylphosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Dithiolane Based Thiol Modifier For Labeling and Stronger Immobilization of Bio-Molecules On Solid Surfaces

  摘要：

  巯基修饰的寡核苷酸在核酸化学领域有广泛的应用。单巯基基团生成的共轭物在高温、高盐浓度缓冲液和存在其他巯基的情况下不稳定。因此，有必要开发一种能够生成多个巯基基团的新型巯基修饰探针。本文描述了高效的工艺和化合物，包括二硫杂环磷酰胺衍生物和二硫杂环琥珀酰基支持体。我们的环状二硫化物巯基修饰的优点是多方面的：a)每个插入点引入两个巯基基团；b)它可以在寡核苷酸的任何所需位置引入；c)二硫杂环中链臂的对称分支性质允许进行干净的寡核苷酸合成，避免链臂的断裂和寡核苷酸链的损失。我们成功地制备了包含单个二硫杂环衍生物的20-mer寡核苷酸，在3'端，以及包含单个二硫杂环衍生物的21-mer寡核苷酸，在5'端或混合碱基序列的中间。这些寡核苷酸的HPLC和ESI MS分析表明它们的纯度和组成正确。

  公开号：

  US20140142253A1
• 作为产物：
  描述：

  6-amino-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)hexan-1-ol 、 Thioctic acid 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.5h， 以77%的产率得到N-(6-(bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)-5-(hydroxymethyl)hexyl)-5-(1,2-dithiolan-3-yl)pentanamide
  参考文献：
  名称：

  Dithiolane Based Thiol Modifier For Labeling and Stronger Immobilization of Bio-Molecules On Solid Surfaces

  摘要：

  巯基修饰的寡核苷酸在核酸化学领域有广泛的应用。单巯基基团生成的共轭物在高温、高盐浓度缓冲液和存在其他巯基的情况下不稳定。因此，有必要开发一种能够生成多个巯基基团的新型巯基修饰探针。本文描述了高效的工艺和化合物，包括二硫杂环磷酰胺衍生物和二硫杂环琥珀酰基支持体。我们的环状二硫化物巯基修饰的优点是多方面的：a)每个插入点引入两个巯基基团；b)它可以在寡核苷酸的任何所需位置引入；c)二硫杂环中链臂的对称分支性质允许进行干净的寡核苷酸合成，避免链臂的断裂和寡核苷酸链的损失。我们成功地制备了包含单个二硫杂环衍生物的20-mer寡核苷酸，在3'端，以及包含单个二硫杂环衍生物的21-mer寡核苷酸，在5'端或混合碱基序列的中间。这些寡核苷酸的HPLC和ESI MS分析表明它们的纯度和组成正确。

  公开号：

  US20140142253A1

文献信息

• US9441002B2
  申请人：——

  公开号：US9441002B2

  公开（公告）日：2016-09-13