5'-S-(3-propionic acid)-5'-deoxy-9-(1'-β-D-ribofuranosyl)adenine | 38716-45-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: 5'-S-(3-propionic acid)-5'-deoxy-9-(1'-β-D-ribofuranosyl)adenine
• 英文别名: S-carboxymethyl-5’-thioadenosine；3-adenosin-5'-ylsulfanyl-propionic acid；<5'-S-Adenosyl>-3-thiopropionsaeure；5'-S-adenosylthiopropionicacid；3-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-tetrahydrofuran-2-yl]methylsulfanyl]propanoic acid；3-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methylsulfanyl]propanoic acid
• CAS: 38716-45-9
• 化学式: C₁₃H₁₇N₅O₅S
• 分子量: 355.374
• InChiKey: JXYJDRSYWXIEQE-ZRFIDHNTSA-N

物化性质

• 沸点：
  761.2±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.88±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.8
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  182
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-S-(3-propionic acid)-5'-deoxy-9-(1'-β-D-ribofuranosyl)adenine 在 N-羟基丁二酰亚胺 、 甲酸 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  [EN] S-ADENOSYL-L-CYSTEINE ANALOGUES AS COFACTORS FOR METHYLTRANSFERASES
  [FR] ANALOGUES DE S-ADÉNOSYL-L-CYSTÉINE UTILISÉS EN TANT QUE COFACTEURS DE MÉTHYLTRANSFÉRASES

  摘要：

  揭示了用于甲基转移酶的辅因子类似物。这些化合物由式（I）表示，其中R1为COOH或COO-；X为携带一个或多个负电荷的有机或无机阴离子；Y和Y'为H，或者是烷基；R2为NH2，NHBoc或H；Z为S或Se。R包括碳-碳双键，碳-氧双键，碳-硫双键，碳-氮双键，碳-碳三键，碳-氮三键，位于硫鎓中心的β位的芳香烃环或杂环系统，不饱和的碳-碳键，或者是碳-杂原子键，其中杂原子是O，N，S。

  公开号：

  WO2016030546A1
• 作为产物：
  描述：

  腺苷 在 吡啶 、 氯化亚砜 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 5'-S-(3-propionic acid)-5'-deoxy-9-(1'-β-D-ribofuranosyl)adenine
  参考文献：
  名称：

  组蛋白甲基转移酶DOT1L含腺苷抑制剂的合成及构效关系研究

  摘要：

  组蛋白 3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 已被发现是具有 MLL（混合谱系白血病）基因易位的急性白血病的药物靶点。总共设计和合成了 55 种含腺苷的化合物，其中鉴定了几种有效的 DOT1L 抑制剂，K i值低至 0.5 nM。与其他三种组蛋白甲基转移酶相比，这些化合物还显示出高选择性（> 4500 倍）。讨论了这些化合物对 DOT1L 的抑制活性的构效关系 (SAR)。强效 DOT1L 抑制剂对 MLL 易位白血病细胞系 MV4;11 和 THP1 的增殖具有选择性活性，EC 504–11 μM 的值。等温滴定量热研究表明，两种代表性抑制剂以高亲和力与 DOT1L:核小体复合物结合，仅与酶辅因子 SAM（S-腺苷-1-甲硫氨酸）竞争，而不与底物核小体竞争。

  DOI：

  10.1021/jm300917h

文献信息

• Synthesis and antimicrobial activity of some novel nucleoside analogues of adenosine and 1,3-dideazaadenosine
  作者：Richa Srivastava、Anudita Bhargava、Ramendra K. Singh

  DOI：10.1016/j.bmcl.2007.09.028

  日期：2007.11

  A number of nucleoside analogues have been synthesized and evaluated for their antibacterial and antifungal activities against Staphylococcus aureus, Group D Streptococcus, Pseudomonas aeruginosa, Proteus spp., Salmonella spp., Aspergillus fumigates, Penicillium marneffei, Candida albicans, Cryptococcus neoformans, and Mucor spp. The compounds 1, 4, and 6 emerged as potent antibacterial agents with MIC values of 0.75, 0.38, and 0.19 mu M, respectively, against group D Streptococcus. Further, the results suggest that the molecules 4, 6, and 7 would be potent antifungal agents as they show substantial degree of inhibition toward the growth of pathogenic fungi with MICs of 0.75, 0.38, and 0.38 mu M, respectively. (C) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Synthesis and Structure–Activity Relationship Investigation of Adenosine-Containing Inhibitors of Histone Methyltransferase DOT1L
  作者：Justin L. Anglin、Lisheng Deng、Yuan Yao、Guobin Cai、Zhen Liu、Hong Jiang、Gang Cheng、Pinhong Chen、Shuo Dong、Yongcheng Song

  DOI：10.1021/jm300917h

  日期：2012.9.27

  Histone3-lysine79 (H3K79) methyltransferase DOT1L has been found to be a drug target for acute leukemia with MLL (mixed lineage leukemia) gene translocations. A total of 55 adenosine-containing compounds were designed and synthesized, among which several potent DOT1L inhibitors were identified with Ki values as low as 0.5 nM. These compounds also show high selectivity (>4500-fold) over three other histone methyltransferases

  组蛋白 3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 已被发现是具有 MLL（混合谱系白血病）基因易位的急性白血病的药物靶点。总共设计和合成了 55 种含腺苷的化合物，其中鉴定了几种有效的 DOT1L 抑制剂，K i值低至 0.5 nM。与其他三种组蛋白甲基转移酶相比，这些化合物还显示出高选择性（> 4500 倍）。讨论了这些化合物对 DOT1L 的抑制活性的构效关系 (SAR)。强效 DOT1L 抑制剂对 MLL 易位白血病细胞系 MV4;11 和 THP1 的增殖具有选择性活性，EC 504–11 μM 的值。等温滴定量热研究表明，两种代表性抑制剂以高亲和力与 DOT1L:核小体复合物结合，仅与酶辅因子 SAM（S-腺苷-1-甲硫氨酸）竞争，而不与底物核小体竞争。
• [EN] S-ADENOSYL-L-CYSTEINE ANALOGUES AS COFACTORS FOR METHYLTRANSFERASES<br/>[FR] ANALOGUES DE S-ADÉNOSYL-L-CYSTÉINE UTILISÉS EN TANT QUE COFACTEURS DE MÉTHYLTRANSFÉRASES
  申请人：UNIV LEUVEN KATH

  公开号：WO2016030546A1

  公开（公告）日：2016-03-03

  Cofactor analogues for methyltransferases are disclosed. The compounds are represented by formula (I) wherein R1 is COOH or COO-; X is an organic or inorganic anion carrying one or more negative charges; Y and Y' are H, or an alkyl; R2 is NH2, NHBoc, or H; and Z is S or Se. R comprises a carbon-carbon double bond, carbon-oxygen double bond, carbon-sulfur double bond, carbon-nitrogen double bond, a carbon-carbon triple bond, carbon-nitrogen triple bond, an aromatic carbocyclic or heterocyclic system in β-position to the sulfonium center, unsaturated c-c bond, or c-heteroatom bond where the heteroatom is O, N, S.

  揭示了用于甲基转移酶的辅因子类似物。这些化合物由式（I）表示，其中R1为COOH或COO-；X为携带一个或多个负电荷的有机或无机阴离子；Y和Y'为H，或者是烷基；R2为NH2，NHBoc或H；Z为S或Se。R包括碳-碳双键，碳-氧双键，碳-硫双键，碳-氮双键，碳-碳三键，碳-氮三键，位于硫鎓中心的β位的芳香烃环或杂环系统，不饱和的碳-碳键，或者是碳-杂原子键，其中杂原子是O，N，S。