(2S,4R)-1-(6-aminohexanoyl)-4-hydroxy-2-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)pyrrolidine | 851912-61-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: (2S,4R)-1-(6-aminohexanoyl)-4-hydroxy-2-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)pyrrolidine
• 英文别名: (2s,4r)-1-(6-Aminohexanoyl)-4-hydroxy-2-(4,4'-dimethoxytrityloxymethyl)pyrrolidine；6-amino-1-[(2S,4R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxypyrrolidin-1-yl]hexan-1-one
• CAS: 851912-61-3
• 化学式: C₃₂H₄₀N₂O₅
• 分子量: 532.68
• InChiKey: AFHXNNNARYVJGM-WUFINQPMSA-N

物化性质

• 沸点：
  694.3±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.164±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  94.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S,4R)-1-(6-aminohexanoyl)-4-hydroxy-2-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)pyrrolidine 在 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 benzyl N-[(2S)-1-[[6-[[6-[(2S,4R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxypyrrolidin-1-yl]-6-oxohexyl]amino]-6-oxohexyl]amino]-1-oxo-6-(phenylmethoxycarbonylamino)hexan-2-yl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  CARBOHYDRATE CONJUGATES AS DELIVERY AGENTS FOR OLIGONUCLEOTIDES

  摘要：

  本发明提供了包含至少一个式(I)的亚单位的iRNA试剂： 其中： A和B分别独立于每次出现O、N(RN)或S； X和Y分别独立于每次出现H、OH、一个羟基保护基团、一个磷酸基团、一个磷酸二酯基团、一个活化磷酸基团、一个活化亚磷酸基团、一个磷酰胺基团、一个固相支持、-P(Z')(Z″)O-核苷、-P(Z')(Z″)O-寡核苷酸、一个脂质、一个PEG、一个类固醇、一个亲脂物质、一个聚合物、-P(Z')(Z″)O-连接子-OP(Z′″)(Z″″)O-寡核苷酸、一个核苷酸、一个寡核苷酸、-P(Z')(Z″)-式(I)、-P(Z')(Z″)-或-连接子-R； R是LG、-连接子-LG，或具有下面所示结构： LG独立于每次出现的是一种碳水化合物，例如，单糖、双糖、三糖、四糖、寡糖、多糖； RN独立于每次出现的是H、甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或苄基； Z'、Z″、Z′″和Z″″分别独立于每次出现的是O或S。

  公开号：

  US20160051691A1
• 作为产物：
  描述：

  6-(N-三氟乙酰基)氨基己酸 在 potassium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 生成 (2S,4R)-1-(6-aminohexanoyl)-4-hydroxy-2-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)pyrrolidine
  参考文献：
  名称：

  [EN] CONJUGATED ANTISENSE COMPOUNDS AND THEIR USE
  [FR] COMPOSÉS ANTISENS CONJUGUÉS ET LEUR UTILISATION

  摘要：

  本文提供了具有共轭基团的寡聚化合物。在某些实施例中，这些寡聚化合物与N-乙酰半乳糖结合。

  公开号：

  WO2014179620A1

文献信息

• Phosphoramidite reagents and solid-phase supports based on hydroxyprolinol for the synthesis of modified oligonucleotides
  作者：M. Yu. Tatulchenkov、I. A. Prokhorenko、M. V. Kvach、M. E. Navakouski、I. A. Stepanova、N. V. Pilchenko、S. V. Gontarev、O. L. Sharko、V. A. Korshun、V. V. Shmanai

  DOI：10.1134/s1068162017040148

  日期：2017.7

  The synthesis of phosphoramidite reagents and solid-phase supports based on hydroxyprolinol for the introduction of the residues of biotin, lipoic acid, amino groups, and terminal acetylene groups at different positions of the oligonucleotide chain has been described. The efficiency of the reagents and supports has been confirmed by the synthesis of the corresponding modified oligonucleotides.

  已经描述了基于羟基脯氨醇的亚磷酰胺试剂和固相载体的合成，用于在寡核苷酸链的不同位置引入生物素、硫辛酸、氨基和末端乙炔基团的残基。试剂和支持物的效率已通过相应修饰寡核苷酸的合成得到证实。
• Site specific delivery of nucleic acids by combining targeting ligands with endosomolytic components
  申请人：Tekmira Pharmaceuticals Corporation

  公开号：US09345780B2

  公开（公告）日：2016-05-24

  The invention relates to compositions and methods for site-specific delivery of nucleic acids by combining them with targeting ligands and endosomolytic components.

  这项发明涉及将核酸与靶向配体和内体溶解组分结合，用于特定位点递送核酸的组合物和方法。
• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR ENHANCED INTESTINAL ABSORPTION OF CONJUGATED OLIGOMERIC COMPOUNDS<br/>[FR] COMPOSITIONS ET MÉTHODES ASSURANT UNE MEILLEURE ABSORPTION INTESTINALE DE COMPOSÉS OLIGOMÈRES CONJUGUÉS
  申请人：ISIS PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2015188194A1

  公开（公告）日：2015-12-10

  Provided herein are compositions and methods for non-parenteral delivery of conjugated oligomeric compounds. In certain embodiments, compositions and methods are provided for oral delivery of conjugated oligomeric compounds. In certain embodiments, the oligomeric compounds are conjugated to one or more N-acetylgalactosamines or N-acetylgalactosamine analogues.

  本文提供了用于非肠内递送共轭寡聚化合物的组合物和方法。在某些实施方式中，提供了用于口服递送共轭寡聚化合物的组合物和方法。在某些实施方式中，这些寡聚化合物与一个或多个N-乙酰半乳糖胺或N-乙酰半乳糖胺类似物共轭。
• Non-Nucleoside Building Blocks for Copper-Assisted and Copper-Free Click Chemistry for the Efficient Synthesis of RNA Conjugates
  作者：K. N. Jayaprakash、Chang Geng Peng、David Butler、Jos P. Varghese、Martin A. Maier、Kallanthottathil G. Rajeev、Muthiah Manoharan

  DOI：10.1021/ol102205j

  日期：2010.12.3

  Novel non-nucleoside alkyne monomers compatible with oligonucleotide synthesis were designed, synthesized, and efficiently incorporated into RNA and RNA analogues during solid-phase synthesis. These modifications allowed site-specific conjugation of ligands to the RNA oligonucleotides through copper-assisted (CuAAC) and copper-free strain-promoted azide−alkyne cycloaddition (SPAAC) reactions. The SPAAC

  设计，合成与寡核苷酸合成相容的新型非核苷炔烃单体，并在固相合成过程中将其有效地掺入RNA和RNA类似物中。这些修饰允许配体通过铜辅助（CuAAC）和无铜应变促进的叠氮化物-炔烃环加成（SPAAC）反应与RNA寡核苷酸进行位点特异性缀合。环辛炔-寡核苷酸与各种叠氮基官能化配体在溶液相和固相上的SPAAC点击反应是有效和定量的，并且在温和的反应条件下发生。SPAAC反应提供了一种合成方法，用于合成未被铜离子污染的寡核苷酸-配体结合物。
• CHEMICAL MODIFICATIONS OF MONOMERS AND OLIGONUCLEOTIDES WITH CYCLOADDITION
  申请人：Manoharan Muthiah

  公开号：US20120035115A1

  公开（公告）日：2012-02-09

  The invention features compounds of formula I or II: In one embodiment, the invention relates compounds and processes for conjugating ligand to oligonucleotide. The invention further relates to methods for treating various disorders and diseases such as viral infections, bacterial infections, parasitic infections, cancers, allergies, autoimmune diseases, immunodeficiencies and immunosuppression.

  该发明涉及公式I或II的化合物：在一种实施方式中，该发明涉及化合物和用于将配体与寡核苷酸结合的过程。该发明进一步涉及治疗各种疾病和疾病的方法，例如病毒感染、细菌感染、寄生虫感染、癌症、过敏、自身免疫疾病、免疫缺陷和免疫抑制。