3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)methyl-5-fluoromethylbenzylazide | 1311299-03-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)methyl-5-fluoromethylbenzylazide
• 英文别名: 3-(4,4'-Dimethoxytrityloxy)methyl-5-fluoromethylbenzylazide；1-(azidomethyl)-3-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(fluoromethyl)benzene
• CAS: 1311299-03-2
• 化学式: C₃₀H₂₈FN₃O₃
• 分子量: 497.569
• InChiKey: HXVGROVWAXXIEU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.2
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  42
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)methyl-5-fluoromethylbenzylazide 、 水 、 三苯基膦 在 乙酸乙酯 、 氯化钠 、 Sodium sulfate-III 、 silica gel 、 甲醇 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 15.0h， 以EtOAc: MeOH=2:1) to isolate 3-(4,4′-dimethoxytrityloxy)methyl-5-fluoromethylbenzylamine (40) (234 mg, 100%) as a white opaque oil的产率得到3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)methyl-5-fluoromethylbenzylamine
  参考文献：
  名称：

  AROMATIC COMPOUND, MODIFICATION CARRIER THAT USES SAME AND IS USED FOR SYNTHESIZING AN OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, AND OLIGONUCLEOTIDE CONSTRUCT

  摘要：

  本发明提供了一种寡核苷酸衍生物，使得可以通过几个步骤轻松地合成在3'-端带有两个苯或吡啶结构的化学修饰寡核苷酸衍生物，还提供了作为制备修饰载体的前体的芳香化合物，以及使用相同的化学修饰在3'-端带有两个苯或吡啶结构的寡核苷酸衍生物和寡核苷酸构建物，具有良好的细胞膜渗透性和出色的核酸酶抵抗性。用于合成寡核苷酸衍生物的修饰载体包括一个单元和一个携带该单元的载体，直接或通过连接剂携带该单元，其中该单元由式（a）表示：其中，R1到R6各自独立地表示氢或不是氢的取代基；Z1和Z2各自独立地表示CH或氮；X表示氧或硫。

  公开号：

  US20120245341A1
• 作为产物：
  描述：

  3-azidomethyl-5-fluoromethylbenzylalcohol 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 、 N,N-二甲基甲酰胺 在 乙酸乙酯 、 氯化钠 、 Sodium sulfate-III 、 silica gel 、 正己烷 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 22.0h， 生成 3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)methyl-5-fluoromethylbenzylazide
  参考文献：
  名称：

  AROMATIC COMPOUND, MODIFICATION CARRIER THAT USES SAME AND IS USED FOR SYNTHESIZING AN OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, AND OLIGONUCLEOTIDE CONSTRUCT

  摘要：

  本发明提供了一种寡核苷酸衍生物，使得可以通过几个步骤轻松地合成在3'-端带有两个苯或吡啶结构的化学修饰寡核苷酸衍生物，还提供了作为制备修饰载体的前体的芳香化合物，以及使用相同的化学修饰在3'-端带有两个苯或吡啶结构的寡核苷酸衍生物和寡核苷酸构建物，具有良好的细胞膜渗透性和出色的核酸酶抵抗性。用于合成寡核苷酸衍生物的修饰载体包括一个单元和一个携带该单元的载体，直接或通过连接剂携带该单元，其中该单元由式（a）表示：其中，R1到R6各自独立地表示氢或不是氢的取代基；Z1和Z2各自独立地表示CH或氮；X表示氧或硫。

  公开号：

  US20120245341A1

文献信息

• Oligonucleotide derivative comprising an aromatic compound
  申请人：Kitade Yukio

  公开号：US08633304B2

  公开（公告）日：2014-01-21

  The present invention provides an oligonucleotide derivative that enables to easily synthesize an oligonucleotide derivative chemically modified at the 3′-end with two moieties each having a benzene or pyridine structure with a few steps, an aromatic compound serving as a precursor for preparing the modification carrier for synthesizing oligonucleotide derivative, and the oligonucleotide derivative and the oligonucleotide construct using the same, that is chemically modified at the 3′-end with two moieties each having a benzene or pyridine structure, and has good permeability through a cell membrane and excellent nuclease resistance. The modification carrier for synthesizing oligonucleotide derivative, comprising a unit and a carrier carrying the unit directly or via a linker, wherein the unit is represented by the formula (a): wherein, R1 to R6 each independently represent hydrogen or a substituent other than hydrogen; Z1 and Z2 each independently represent CH or nitrogen; and X represents oxygen or sulfur.

  本发明提供了一种寡核苷酸衍生物，使得可以通过几个步骤轻松地合成化学修饰了两个苯或吡啶结构的基团的寡核苷酸衍生物，还提供了一种用于制备修饰载体以合成寡核苷酸衍生物的前体芳香化合物，以及使用相同的化学修饰了两个苯或吡啶结构的基团的寡核苷酸衍生物和寡核苷酸构建物，具有良好的细胞膜渗透性和优异的核酸酶抵抗性。用于合成寡核苷酸衍生物的修饰载体包括一个单元和一个携带该单元的载体，直接或通过连接剂携带该单元，其中该单元由式（a）表示：其中，R1到R6各自独立地表示氢或不是氢的取代基；Z1和Z2各自独立地表示CH或氮；X表示氧或硫。
• AROMATIC COMPOUND, MODIFICATION CARRIER THAT USES SAME AND IS USED FOR SYNTHESIZING AN OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, AND OLIGONUCLEOTIDE CONSTRUCT
  申请人：Gifu University

  公开号：EP2511260B1

  公开（公告）日：2015-07-29
• US8633304B2
  申请人：——

  公开号：US8633304B2

  公开（公告）日：2014-01-21
• [EN] AROMATIC COMPOUND, MODIFICATION CARRIER THAT USES SAME AND IS USED FOR SYNTHESIZING AN OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, AND OLIGONUCLEOTIDE CONSTRUCT<br/>[FR] COMPOSÉ AROMATIQUE, VECTEUR DE MODIFICATION QUI UTILISE CELUI-CI ET EST UTILISÉ POUR SYNTHÉTISER UN DÉRIVÉ D'OLIGONUCLÉOTIDE, DÉRIVÉ D'OLIGONUCLÉOTIDE, ET CONSTRUCTION D'OLIGONUCLÉOTIDE
  申请人：UNIV GIFU

  公开号：WO2011071078A1

  公开（公告）日：2011-06-16

  【課題】３´ 末端にベンゼン骨格及びピリジン骨格のうち２つの骨格が化学修飾されたオリゴヌクレオチド誘導体を容易に合成することが可能であり、しかも少ない工程数で容易に合成することができるオリゴヌクレオチド誘導体、及び、そのオリゴヌクレオチド誘導体合成用修飾担体を調製するための前駆体となる芳香族化合物を提供する。また、３´ 末端ダングリングエンドにベンゼン骨格及びピリジン骨格のうち２つの骨格が化学修飾されたオリゴヌクレオチド誘導体であって、細胞膜への透過性が良好で、優れたヌクレアーゼ耐性を有するオリゴヌクレオチド誘導体及びオリゴヌクレオチド構築物を提供する。 【解決手段】下記構造式（ａ）で示されるユニットがリンカーを介して担体に化学修飾されていることを特徴とするオリゴヌクレオチド誘導体合成用修飾担体（ただし、式中のＲ１～Ｒ６はそれぞれ独立して水素又は水素以外の置換基を示す。また、式中Ｚ１及びＺ２はそれぞれ独立してＣＨ又は窒素を示し、Ｘは酸素又はイオウを示す）。
• AROMATIC COMPOUND, MODIFICATION CARRIER THAT USES SAME AND IS USED FOR SYNTHESIZING AN OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, AND OLIGONUCLEOTIDE CONSTRUCT
  申请人：Kitade Yukio

  公开号：US20120245341A1

  公开（公告）日：2012-09-27

  The present invention provides an oligonucleotide derivative that enables to easily synthesize an oligonucleotide derivative chemically modified at the 3′-end with two moieties each having a benzene or pyridine structure with a few steps, an aromatic compound serving as a precursor for preparing the modification carrier for synthesizing oligonucleotide derivative, and the oligonucleotide derivative and the oligonucleotide construct using the same, that is chemically modified at the 3′-end with two moieties each having a benzene or pyridine structure, and has good permeability through a cell membrane and excellent nuclease resistance. The modification carrier for synthesizing oligonucleotide derivative, comprising a unit and a carrier carrying the unit directly or via a linker, wherein the unit is represented by the formula (a): wherein, R 1 to R 6 each independently represent hydrogen or a substituent other than hydrogen; Z 1 and Z 2 each independently represent CH or nitrogen; and X represents oxygen or sulfur.

  本发明提供了一种寡核苷酸衍生物，使得可以通过几个步骤轻松地合成在3'-端带有两个苯或吡啶结构的化学修饰寡核苷酸衍生物，还提供了作为制备修饰载体的前体的芳香化合物，以及使用相同的化学修饰在3'-端带有两个苯或吡啶结构的寡核苷酸衍生物和寡核苷酸构建物，具有良好的细胞膜渗透性和出色的核酸酶抵抗性。用于合成寡核苷酸衍生物的修饰载体包括一个单元和一个携带该单元的载体，直接或通过连接剂携带该单元，其中该单元由式（a）表示：其中，R1到R6各自独立地表示氢或不是氢的取代基；Z1和Z2各自独立地表示CH或氮；X表示氧或硫。