Synthesis, Structure, and Photochemistry of Exceptionally Stable Synthetic DNA Hairpins with Stilbene Diether Linkers
作者:Frederick D. Lewis、Yansheng Wu、Xiaoyang Liu
DOI:10.1021/ja026941o
日期:2002.10.1
The structure and properties of 18 hairpin-forming bis(oligonucleotide) conjugates possessing stilbene diether linkers are reported. Conjugates possessing bis(2-hydroxyethyl)stilbene 4,4'-diether linkers form the most stable DNA hairpins reported to date. Hairpins with as few as two T:A base pairs or four noncanonical G:G base pairs are stable at room temperature. Increasing the length of the hydroxyalkyl
报告了具有二苯乙烯二醚接头的 18 种形成发夹的双(寡核苷酸)缀合物的结构和性质。具有双(2-羟乙基)二苯乙烯 4,4'-二醚接头的结合物形成了迄今为止报道的最稳定的 DNA 发夹。具有少至两个 T:A 碱基对或四个非规范 G:G 碱基对的发夹在室温下是稳定的。增加羟烷基的长度导致发夹热稳定性降低。在对圆二色光谱的研究基础上,所有被研究的发夹均采用 B-DNA 结构,除了一个发夹具有短的 poly(G:C) 茎形成 Z-DNA 结构。二苯乙烯二醚接头的强荧光及其反式顺式光异构化在具有相邻 T:A 和 G:C 碱基对的发夹中完全淬灭。淬火归因于电子转移机制,其中单线态芪作为电子供体,T 或 C 作为电子受体。相比之下,在变性发夹和具有相邻 G:G 碱基对的发夹中,二苯乙烯二醚接头进行有效的光异构化。