5-(5,6-dimethoxybenzothiazol-2-yl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine | 1345706-61-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5-(5,6-dimethoxybenzothiazol-2-yl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-(5,6-dimethoxy-1,3-benzothiazol-2-yl)pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1345706-61-7
• 化学式: C₃₉H₃₇N₃O₉S
• 分子量: 723.803
• InChiKey: WBRPOINMKJXGOL-KZDQMGDASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.3
• 重原子数：
  52
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  166
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(5,6-dimethoxybenzothiazol-2-yl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine 在 吡啶 、 2-氯-1,3,2-苯并二氧磷杂环己烷-4-酮 、 水 、 溶剂黄146 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 3.99h， 生成 5-(5,6-dimethoxybenzothiazol-2-yl)-2'-deoxyuridine 5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  高度荧光的5-（5,6-二甲氧基苯并噻唑-2-基）-2'-脱氧尿苷5'-三磷酸酯作为DNA聚合酶的有效底物

  摘要：

  点燃火柴：使用引物延伸反应合成了荧光尿嘧啶类似物d bt UTP，并将其掺入引物/模板双链体中。我们发现d bt UTP专门掺入到与腺嘌呤相对的ODN中，并且模板中的d bt U在碱基配对模式中的作用与dT相同。

  DOI：

  10.1002/cbic.201100452
• 作为产物：
  描述：

  5,6-二甲氧基-1,3-苯并噻唑-2-胺 在 吡啶 、 1,4-dithio-D,L-threitol 、 双氧水 、 氧气 、 potassium hydroxide 、 scandium tris(trifluoromethanesulfonate) 作用下， 以 水 、 乙二醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 31.5h， 生成 5-(5,6-dimethoxybenzothiazol-2-yl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  5-（5,6-二甲氧基苯并噻唑-2-基）-2'-脱氧尿苷（dbtU）和含有dbtU的寡脱氧核糖核苷酸的荧光性质

  摘要：

  描述了11个含d bt U的5–（苯并噻唑-2-基）-2 -'-脱氧尿苷衍生物和寡脱氧核糖核苷酸（ODN）的光物理性质。比较了包含5'-X bt U-3'和5'- bt UY-3'的16种组合的ODN的荧光特性，发现d bt U是一种非常有前途的新荧光类似物，但对Dbt U的敏感性较低。它在DNA中的微环境。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201100818