3-(6-((2,5-Dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-1,1-dimethyl-2-(3-(1,1,3-trimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[e]indol-2-ylidene)prop-1-en-1-yl)-1H-benzo[e]indol-3-ium

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: 3-(6-((2,5-Dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-1,1-dimethyl-2-(3-(1,1,3-trimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[e]indol-2-ylidene)prop-1-en-1-yl)-1H-benzo[e]indol-3-ium
• 英文别名: (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 6-[(2Z)-1,1-dimethyl-2-[(E)-3-(1,1,3-trimethylbenzo[e]indol-3-ium-2-yl)prop-2-enylidene]benzo[e]indol-3-yl]hexanoate
• 化学式: C₄₂H₄₄N₃O₄
• 分子量: 654.829
• InChiKey: MLTQHYXPKJXNSU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.1
• 重原子数：
  49
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  69.9
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(6-((2,5-Dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-1,1-dimethyl-2-(3-(1,1,3-trimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[e]indol-2-ylidene)prop-1-en-1-yl)-1H-benzo[e]indol-3-ium 、 2-[2-(2-Aminoethoxy)propan-2-yloxy]ethanol 在 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以15 mg的产率得到
  参考文献：
  名称：

  酸敏感连接单元的合成及其在DNA测序中的用 途

  摘要：

  本发明公开了一种酸敏感连接单元的合成及其在DNA测序中的用途。该酸敏感连接单元，结构式为：其中R为NH2或N3，m为0～44中任一整数，n为0～44中任一整数；R1，R2均为脂肪族烷基，或R1，R2均为芳香族衍生物，或R1为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R2为脂肪族烷基或氢；或R2为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R1为脂肪族烷基或氢，或R1、R2构成环己基、环戊基或环丁基。该酸敏感连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。该类可逆终端可用于DNA测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。

  公开号：

  CN104292117B