sodium;4-[(2E)-2-[(2E)-2-[2-[4-(5-carboxypentylcarbamoyl)phenyl]-3-[(E)-2-[1,1-dimethyl-3-(4-sulfonatobutyl)benzo[e]indol-3-ium-2-yl]ethenyl]cyclohex-2-en-1-ylidene]ethylidene]-1,1-dimethylbenzo[e]indol-3-yl]butane-1-sulfonate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: sodium;4-[(2E)-2-[(2E)-2-[2-[4-(5-carboxypentylcarbamoyl)phenyl]-3-[(E)-2-[1,1-dimethyl-3-(4-sulfonatobutyl)benzo[e]indol-3-ium-2-yl]ethenyl]cyclohex-2-en-1-ylidene]ethylidene]-1,1-dimethylbenzo[e]indol-3-yl]butane-1-sulfonate
• 化学式: C₅₉H₆₆N₃O₉S₂*Na
• 分子量: 1048.31
• InChiKey: XFPBPQYMIBTYRU-UHFFFAOYSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.2
• 重原子数：
  74
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  204
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  sodium;4-[(2E)-2-[(2E)-2-[2-[4-(5-carboxypentylcarbamoyl)phenyl]-3-[(E)-2-[1,1-dimethyl-3-(4-sulfonatobutyl)benzo[e]indol-3-ium-2-yl]ethenyl]cyclohex-2-en-1-ylidene]ethylidene]-1,1-dimethylbenzo[e]indol-3-yl]butane-1-sulfonate 、 sodium;3-[2-[2-[2-(4-carboxyphenyl)-3-[2-[1,1-dimethyl-3-(3-sulfonatopropyl)benzo[e]indol-3-ium-2-yl]ethenyl]cyclohex-2-en-1-ylidene]ethylidene]-1,1-dimethylbenzo[e]indol-3-yl]propane-1-sulfonate 在 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 茴香硫醚 、 水 、 三氟乙酸 、 苯酚 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Fluorescent polymethine cyanine dyes

  摘要：

  该发明涵盖荧光青烯染料及使用此类染料的方法。特别地，该发明涵盖近红外聚甲烷青烯染料。

  公开号：

  US08344158B2
• 作为产物：
  描述：

  4-羧基苯硼酸 在 四(三苯基膦)钯 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 sodium;4-[(2E)-2-[(2E)-2-[2-[4-(5-carboxypentylcarbamoyl)phenyl]-3-[(E)-2-[1,1-dimethyl-3-(4-sulfonatobutyl)benzo[e]indol-3-ium-2-yl]ethenyl]cyclohex-2-en-1-ylidene]ethylidene]-1,1-dimethylbenzo[e]indol-3-yl]butane-1-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  Heptamethine Cyanine Dyes with a Robust C−C Bond at the Central Position of the Chromophore

  摘要：

  Novel, highly fluorescent, monofunctional, water-soluble heptamethine cyanine dyes containing a robust C-C bond at the central position of the near-infrared fluorophore system were prepared by the Suzuki-Miyaura method. The reaction proceeded efficiently to replace the meso-chlorine atom with a carboxy-functionalized aryl moiety and afforded the desired compounds in high yields. This methodology is particularly attractive due to its versatility and the utilization of environmentally friendly water as solvent. The new compounds possess excellent spectral properties and readily label bioactive molecules on solid support. The results demonstrate the potential of using the new compounds as fluorescent antennae for molecular imaging, spectroscopy, microscopy, and chemical or biological molecular recognition studies.

  DOI：

  10.1021/jo061284u