N-(6-hydroxyhexyl)-1-oxo-3',6'-bis[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]spiro[2-benzofuran-3,9'-xanthene]-5-carboxamide | 1355330-38-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: N-(6-hydroxyhexyl)-1-oxo-3',6'-bis[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]spiro[2-benzofuran-3,9'-xanthene]-5-carboxamide
• CAS: 1355330-38-9
• 化学式: C₃₁H₂₅F₆N₃O₇
• 分子量: 665.546
• InChiKey: PKISLIZJVLHJIB-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  143
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  bis-(N,N-diisopropyl)-beta-cyanoethyl phosphordiamidite 、 N-(6-hydroxyhexyl)-1-oxo-3',6'-bis[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]spiro[2-benzofuran-3,9'-xanthene]-5-carboxamide 在 三氟乙酸吡啶 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Rhodamine lactone phosphoramidites and polymers

  摘要：

  本发明提供了罗丹明内酯磷酰胺酯和聚合物组成物、制备这些磷酰胺酯和聚合物组成物的方法以及使用这些磷酰胺酯和聚合物组成物标记寡核苷酸的方法。特别地，本发明提供了在合成寡核苷酸过程中标记寡核苷酸的3'-和5'-末端的组成物和方法。

  公开号：

  US20120016128A1
• 作为产物：
  描述：

  6-carboxyrhodamine 在 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 N-(6-hydroxyhexyl)-1-oxo-3',6'-bis[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]spiro[2-benzofuran-3,9'-xanthene]-5-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Rhodamine lactone phosphoramidites and polymers

  摘要：

  本发明提供了罗丹明内酯磷酰胺酯和聚合物组成物、制备这些磷酰胺酯和聚合物组成物的方法以及使用这些磷酰胺酯和聚合物组成物标记寡核苷酸的方法。特别地，本发明提供了在合成寡核苷酸过程中标记寡核苷酸的3'-和5'-末端的组成物和方法。

  公开号：

  US20120016128A1

文献信息

• Rhodamine lactone phosphoramidites and polymers
  申请人：Diwu Zhenjun

  公开号：US20120016128A1

  公开（公告）日：2012-01-19

  The present invention provides rhodamine lactone phosphoramidites and polymer compositions, methods for making these phosphoramidites and polymer compositions, and methods for using these phosphoramidites and polymer compositions for labeling oligonucleotides. In particular, the present invention provides compositions and methods for labeling the 3′- and 5′-end of oligonucleotides during synthesis of the oligonucleotides.

  本发明提供了罗丹明内酯磷酰胺酯和聚合物组成物、制备这些磷酰胺酯和聚合物组成物的方法以及使用这些磷酰胺酯和聚合物组成物标记寡核苷酸的方法。特别地，本发明提供了在合成寡核苷酸过程中标记寡核苷酸的3'-和5'-末端的组成物和方法。