1-[2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl]-4-fluoro-2-methylindole | 1354699-93-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-[2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl]-4-fluoro-2-methylindole
• CAS: 1354699-93-6
• 化学式: C₃₅H₃₄FNO₅
• 分子量: 567.657
• InChiKey: ABGYKTWCSGDQRK-LBFZIJHGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.76
• 重原子数：
  42.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  62.08
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl]-4-fluoro-2-methylindole 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 1.0h， 以100%的产率得到1-[2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-(N,N-diisopropyl-β-cyanoethylphosphoramidyl)-β-D-ribofuranosyl]-4-fluoro-2-methylindole
  参考文献：
  名称：

  8-oxoG 非极性类似物的惊人修复活性暴露特征的碱基切除修复糖基化酶的识别和催化

  摘要：

  修复糖基化酶从 DNA 中定位和切除受损的碱基，在基因组保存和疾病预防中发挥核心作用。两个关键的糖基化酶 Fpg 和 hOGG1 的作用是从 DNA 中去除诱变的氧化碱基 8-oxoG (OG)。为了研究构象偏好、离去基团能力、酶基氢键和核碱基形状对这些糖基化酶损伤识别的相对贡献，一系列四个取代的吲哚核苷，基于亲本 OG 非极性等排体 2Cl-4F-吲哚，在与 C 配对的 30 个碱基对双链体的背景下，作为这些酶的可能直接底物进行了测试。令人惊讶的是，单周转实验表明，Fpg 催化的两种非极性类似物的碱基去除活性优于天然 OG 底物。还发现 hOGG1 糖基化酶可催化去除三种非极性类似物，但效率远低于去除 OG。值得注意的是，完全耐受 hOGG1 催化切除的类似物在 OG 的 NH7 位置有一个氯取代基，这意味着在催化中识别该位置的重要性。hOGG1 和 Fpg 都保留了对含有非极性等排体的双链体的高亲和力。这些研究表明，Fpg

  DOI：

  10.1021/ja208510m
• 作为产物：
  描述：

  2-甲基-4-氟吲哚 在 吡啶 、 sodium methylate 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.83h， 生成 1-[2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl]-4-fluoro-2-methylindole
  参考文献：
  名称：

  8-oxoG 非极性类似物的惊人修复活性暴露特征的碱基切除修复糖基化酶的识别和催化

  摘要：

  修复糖基化酶从 DNA 中定位和切除受损的碱基，在基因组保存和疾病预防中发挥核心作用。两个关键的糖基化酶 Fpg 和 hOGG1 的作用是从 DNA 中去除诱变的氧化碱基 8-oxoG (OG)。为了研究构象偏好、离去基团能力、酶基氢键和核碱基形状对这些糖基化酶损伤识别的相对贡献，一系列四个取代的吲哚核苷，基于亲本 OG 非极性等排体 2Cl-4F-吲哚，在与 C 配对的 30 个碱基对双链体的背景下，作为这些酶的可能直接底物进行了测试。令人惊讶的是，单周转实验表明，Fpg 催化的两种非极性类似物的碱基去除活性优于天然 OG 底物。还发现 hOGG1 糖基化酶可催化去除三种非极性类似物，但效率远低于去除 OG。值得注意的是，完全耐受 hOGG1 催化切除的类似物在 OG 的 NH7 位置有一个氯取代基，这意味着在催化中识别该位置的重要性。hOGG1 和 Fpg 都保留了对含有非极性等排体的双链体的高亲和力。这些研究表明，Fpg

  DOI：

  10.1021/ja208510m