| 956092-69-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• CAS: 956092-69-6
• 化学式: C₂₇H₂₈F₃NO₅
• 分子量: 503.518
• InChiKey: FUAQFZJLTGSAEF-UUOWRZLLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.44
• 重原子数：
  36.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  77.02
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  在 ammonium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 72.0h， 以86%的产率得到4,4'-dimethoxytrityl-L-threoninol
  参考文献：
  名称：

  菲啶作为人工 DNA 碱基：两种替代无环 2'-脱氧核糖替代物的比较

  摘要：

  (S)-1-Amino-2,3-propanediol 和 (2S,3S)-2-amino-1,3-butanediol 已被用作 2'-脱氧核糖苷的两种不同的无环替代物，以合成掺入乙锭的菲啶鎓发色团作为人工 DNA 碱基。连接到两个替代无环接头的一种具有代表性的双链体菲啶的光学特性的比较没有表现出显着差异。

  DOI：

  10.1055/s-2007-984899
• 作为产物：
  描述：

  N-[(2S,3S)-1,3-dihydroxybutan-2-yl]-2,2,2-trifluoroacetamide 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 吡啶 作用下， 反应 48.0h， 以65%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  菲啶作为人工 DNA 碱基：两种替代无环 2'-脱氧核糖替代物的比较

  摘要：

  (S)-1-Amino-2,3-propanediol 和 (2S,3S)-2-amino-1,3-butanediol 已被用作 2'-脱氧核糖苷的两种不同的无环替代物，以合成掺入乙锭的菲啶鎓发色团作为人工 DNA 碱基。连接到两个替代无环接头的一种具有代表性的双链体菲啶的光学特性的比较没有表现出显着差异。

  DOI：

  10.1055/s-2007-984899

文献信息

• pH-Dependent Switching of Base Pairs Using Artificial Nucleobases with Carboxyl Groups
  作者：Tanasak Kaewsomboon、Shuhei Nishizawa、Takashi Kanamori、Hideya Yuasa、Akihiro Ohkubo

  DOI：10.1021/acs.joc.7b02828

  日期：2018.2.2

  this study, we report the synthesis of modified oligonucleotides consisting of benzoic acid or isophthalic acid residues as new nucleobases. As evaluated by UV thermal denaturation analysis at different pH conditions (5.0, 6.0, 7.0, and 8.0), these modified oligonucleotides exhibited pH-dependent recognition of natural nucleobases and one is first found to be capable of base pair switching in response

  在这项研究中，我们报告了由苯甲酸或间苯二甲酸残基组成的修饰寡核苷酸作为新的核碱基的合成。如通过在不同pH条件（5.0、6.0、7.0和8.0）下进行UV热变性分析所评估的，这些修饰的寡核苷酸表现出对天然核碱基的pH依赖性识别，并且首先发现一个能够响应于pH值进行碱基对转换改变。结合在d-苏氨酸骨架上的寡核苷酸中的间苯二甲酸残基可以优先与腺嘌呤结合，而与鸟嘌呤结合，以响应pH条件从pH 5到pH 7（或8）的变化，而双链体稳定性无明显差异。这些发现对于进一步开发基于pH响应的基于DNA的分子装置将是有价值的。
• Coherent Quenching of a Fluorophore for the Design of a Highly Sensitive In-Stem Molecular Beacon
  作者：Yuichi Hara、Taiga Fujii、Hiromu Kashida、Koji Sekiguchi、Xingguo Liang、Kosuke Niwa、Tomokazu Takase、Yasuko Yoshida、Hiroyuki Asanuma

  DOI：10.1002/anie.201001459

  日期：——

  Excitonic interaction was utilized to design a highly sensitive in‐stem molecular beacon (ISMB) in which both a fluorophore and a quencher on D‐threoninols are incorporated as a pseudo base pair (see scheme; optimized combination with Cy3 and modified Methyl Red). Minimization of the difference between λmax of the fluorophore and quencher maximized quenching efficiency.

  利用激子相互作用设计了一个高度敏感的系统内分子信标（ISMB），其中将D-苏氨酸上的荧光团和猝灭剂都作为假碱基对掺入（见方案；与Cy3和修饰的甲基红的优化组合）。之间的差的最小化λ最大荧光团的淬灭剂和最大化淬火效率。