5-((3aR,6S,6aS)-2-Oxo-hexahydro-thieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentanoic acid {4-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxymethyl-cyclohexyl}-amide | 194034-66-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5-((3aR,6S,6aS)-2-Oxo-hexahydro-thieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentanoic acid {4-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxymethyl-cyclohexyl}-amide
• CAS: 194034-66-7
• 化学式: C₃₉H₄₉N₃O₆S
• 分子量: 687.901
• InChiKey: PBHALZDFASPZEW-QMTUHRCOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.78
• 重原子数：
  49.0
• 可旋转键数：
  15.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.49
• 拓扑面积：
  118.15
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 、 5-((3aR,6S,6aS)-2-Oxo-hexahydro-thieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentanoic acid {4-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxymethyl-cyclohexyl}-amide 在 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以74%的产率得到Diisopropyl-phosphoramidous acid 1-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-[5-((3aR,6S,6aS)-2-oxo-hexahydro-thieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentanoylamino]-cyclohexylmethyl ester 2-cyano-ethyl ester
  参考文献：
  名称：

  Novel non-nucleosidic phosphoramidites for oligonucleotide modification and labeling

  摘要：

  A series of novel labeled phosphoramidites and CPG supports 1a-f with a new non-nucleosidic backbone based upon cyclohexyl-4-amino-1,1-dimethanol have been synthesized. These reagents have been used to label oligonucleotides with biotin and fluorescein at the 5'-, the 3'-, and internal positions. (C) 1997 Elsevier Science Ltd.

  DOI：

  10.1016/s0960-894x(97)00278-3
• 作为产物：
  描述：

  1,1-bis(benzoyloxymethyl)-3-cyclohexene 在 sodium tetrahydroborate 、 TEA 、 三氟化硼乙醚 、 氨基磺酸 、 sodium methylate 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 5-((3aR,6S,6aS)-2-Oxo-hexahydro-thieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentanoic acid {4-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxymethyl-cyclohexyl}-amide
  参考文献：
  名称：

  Novel non-nucleosidic phosphoramidites for oligonucleotide modification and labeling

  摘要：

  A series of novel labeled phosphoramidites and CPG supports 1a-f with a new non-nucleosidic backbone based upon cyclohexyl-4-amino-1,1-dimethanol have been synthesized. These reagents have been used to label oligonucleotides with biotin and fluorescein at the 5'-, the 3'-, and internal positions. (C) 1997 Elsevier Science Ltd.

  DOI：

  10.1016/s0960-894x(97)00278-3