9-(3-dimethoxytrityl-2-deoxy-3-D-ribofuranosyl)-hypoxanthine | 1401110-52-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 9-(3-dimethoxytrityl-2-deoxy-3-D-ribofuranosyl)-hypoxanthine
• 英文别名: 3'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyinosine；9-[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1H-purin-6-one
• CAS: 1401110-52-8
• 化学式: C₃₁H₃₀N₄O₆
• 分子量: 554.602
• InChiKey: VHGPSUHVMFNHMZ-OYUWMTPXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-(3-dimethoxytrityl-2-deoxy-3-D-ribofuranosyl)-hypoxanthine 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以57%的产率得到9-(5-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidito-3-dimethoxytrityl-2-deoxy-3-D-ribofuranosyl)-hypoxanthine
  参考文献：
  名称：

  FUNCTIONALIZED 3-ALKYNYL PYRAZOLOPYRIMIDINE ANALOGUES AS UNIVERSAL BASES AND METHODS OF USE

  摘要：

  提供了3-炔基肌苷类似物及其作为通用碱基的用途。这些肌苷类似物可以被合并到核酸引物和探针中。它们不会显著破坏核酸双链。因此，包含这些肌苷类似物的新型核酸引物和探针可以用于各种方法。这些类似物意外地作为通用碱基发挥良好作用。它们不仅比嘌呤对A、C、T和G稳定双链更多，而且在引物中被聚合酶识别，从而实现高效扩增。

  公开号：

  US20130261014A1
• 作为产物：
  描述：

  9-(5-(tert-butyldiphenylsilyl)-3-dimethoxytrityl-2-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-hypoxanthine 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 14.0h， 以75%的产率得到9-(3-dimethoxytrityl-2-deoxy-3-D-ribofuranosyl)-hypoxanthine
  参考文献：
  名称：

  FUNCTIONALIZED 3-ALKYNYL PYRAZOLOPYRIMIDINE ANALOGUES AS UNIVERSAL BASES AND METHODS OF USE

  摘要：

  提供了3-炔基肌苷类似物及其作为通用碱基的用途。这些肌苷类似物可以被合并到核酸引物和探针中。它们不会显著破坏核酸双链。因此，包含这些肌苷类似物的新型核酸引物和探针可以用于各种方法。这些类似物意外地作为通用碱基发挥良好作用。它们不仅比嘌呤对A、C、T和G稳定双链更多，而且在引物中被聚合酶识别，从而实现高效扩增。

  公开号：

  US20130261014A1

文献信息

• FUNCTIONALIZED 3-ALKYNYL PYRAZOLOPYRIMIDINE ANALOGUES AS UNIVERSAL BASES AND METHODS OF USE
  申请人：Vorobiev Alexei

  公开号：US20130261014A1

  公开（公告）日：2013-10-03

  3-alkynyl inosine analogs and their uses as universal bases are provided. The inosine analogues can be incorporated into nucleic acid primers and probes. They do not significantly destabilize nucleic acid duplexes. As a result, the novel nucleic acid primers and probes incorporating the inosine analogues can be used in a variety of methods. The analogs function unexpectedly well as universal bases. Not only do they stabilize duplexes substantially more than hypoxanthine opposite A, C, T, and G but they are also recognized in primers by polymerases, allowing efficient amplification.

  提供了3-炔基肌苷类似物及其作为通用碱基的用途。这些肌苷类似物可以被合并到核酸引物和探针中。它们不会显著破坏核酸双链。因此，包含这些肌苷类似物的新型核酸引物和探针可以用于各种方法。这些类似物意外地作为通用碱基发挥良好作用。它们不仅比嘌呤对A、C、T和G稳定双链更多，而且在引物中被聚合酶识别，从而实现高效扩增。