N-(9-((2R,3R,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl-13C)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl-2,3,4,5-13C4)-9H-purin-6-yl)benzamide | 238096-67-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-(9-((2R,3R,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl-13C)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl-2,3,4,5-13C4)-9H-purin-6-yl)benzamide
• CAS: 238096-67-8
• 化学式: C₄₄H₄₉N₅O₇Si
• 分子量: 792.933
• InChiKey: DAZIGOPASNJPCJ-XFAMHDNASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.75
• 重原子数：
  57.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  139.08
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 N-(9-((2R,3R,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl-13C)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl-2,3,4,5-13C4)-9H-purin-6-yl)benzamide 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 3.0h， 以85%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  序列特异性非均匀13 C 5标记RNA的第一个例子：具有13 C弛豫窗的29mer HIV-1 TAR RNA的合成

  摘要：

  完整的合成方案以及有关单体结构单元的1 H和13 C-NMR数据，这些单体用于固相合成13 C标记（99％原子的13 C）茎（27 A和43 G），凸起（24 C）和环（31 29聚体HIV-1 RNA TAR发夹U）区域从起始13 ç 6 - -葡萄糖被呈现。的复杂的NMR谱13 C标记的单体结构单元，由于各种的相互作用13 C和1已指定H个旋转。异核2D NMR已证明，通过化学合成在此处实现的HIV-1 TAR 29mer RNA的非均一标记提供了最佳的机会，可以进行完整的T 1和T 2弛豫测量（“ NMR弛豫窗口”）与统一标记的寡核苷酸RNA相比，由于13 C共振的最小重叠，所有四种策略性地将13 C标记的残基的糖碳的每种类型均以独特且前所未有的方式进行。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(99)00294-x
• 作为产物：
  描述：

  (3aR,5R,6S,6aR)-5-(hydroxymethyl-13C)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxol-6-yl-3a,5,6,6a-13C4 methanesulfonate 在 4-二甲氨基吡啶 、 sodium hydroxide 、 硫酸 、 sodium acetate 、 四氯化锡 作用下， 以 吡啶 、 水 、 甲苯 为溶剂， 生成 N-(9-((2R,3R,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl-13C)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl-2,3,4,5-13C4)-9H-purin-6-yl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  13 C标记单体的化学合成，用于固相和模板控制的DNA和RNA低聚物的酶促合成

  摘要：

  从[ 13 C 6 ]-葡萄糖1和相应的核碱基5a-e或6a-e（N 6-苯甲酰基-腺嘌呤，N 2-乙酰基-鸟嘌呤，N 4-苯甲酰基-胞嘧啶）开始制备13 C标记的核糖核苷（尿嘧啶和胸腺嘧啶）的总收率在47％至66％之间。它们随后转化为5'- O-二甲氧基三苯甲基保护的DNA-亚磷酰胺和5'- O-二甲氧基三苯甲基-2' - O-三烷基甲硅烷基保护的RNA-磷-酰胺，用于固相合成DNA-和RNA-低聚物，并转化为5' - Ø已经进行了用于模板控制的酶促合成（聚合酶-或逆转录酶反应）的-核糖核苷和-核糖核苷三磷酸。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)73458-7