5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-t-butyldimethylsilyl-[(1',2',3',4',5'-13C5)-(5-2H)]-uridine | 389143-50-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-t-butyldimethylsilyl-[(1',2',3',4',5'-13C5)-(5-2H)]-uridine
• 英文别名: 1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy](113C)methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-hydroxy(2,3,4,5-13C4)oxolan-2-yl]-5-deuteriopyrimidine-2,4-dione
• CAS: 389143-50-4
• 化学式: C₃₆H₄₄N₂O₈Si
• 分子量: 666.777
• InChiKey: KVHQIELPHWJPSY-UPEZGVEGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.21
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-t-butyldimethylsilyl-[(1',2',3',4',5'-13C5)-(5-2H)]-uridine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以76%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-t-butyldimethylsilyl-[(1',2',3',4',5'-13C5)-(5-2H)]-uridine 3'-O-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidite)
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of multiply labelled ribonucleosides for sequence-specific labelling of oligo-RNA

  摘要：

  本文描述了核糖核苷酸块与2H、13C和15N的复合标记，用于序列特异性标记的RNA的固体支持合成。标记被引入核糖环（13C）、嘧啶核苷酸的C5位（2H）和外环氨基（15N），并作为多重探针，用于通过高分辨率多核核磁共振光谱研究生理上重要的RNA折叠的各种物理化学后果。版权所有 © 2001 John Wiley & Sons, Ltd.

  DOI：

  10.1002/jlcr.503
• 作为产物：
  描述：

  <1',2',3',4',5'-13C5>-uridine 在 吡啶 、 重水 、 potassium carbonate 、 silver nitrate 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 58.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-t-butyldimethylsilyl-[(1',2',3',4',5'-13C5)-(5-2H)]-uridine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of multiply labelled ribonucleosides for sequence-specific labelling of oligo-RNA

  摘要：

  本文描述了核糖核苷酸块与2H、13C和15N的复合标记，用于序列特异性标记的RNA的固体支持合成。标记被引入核糖环（13C）、嘧啶核苷酸的C5位（2H）和外环氨基（15N），并作为多重探针，用于通过高分辨率多核核磁共振光谱研究生理上重要的RNA折叠的各种物理化学后果。版权所有 © 2001 John Wiley & Sons, Ltd.

  DOI：

  10.1002/jlcr.503

文献信息

• Synthesis of multiply labelled ribonucleosides for sequence-specific labelling of oligo-RNA
  作者：Jan Milecki、Andras Földesi、Artur Fischer、Ryszard W. Adamiak、Jyoti Chattopadhyaya

  DOI：10.1002/jlcr.503

  日期：2001.10.15

  The synthesis of ribonucleotide blocks multiply labelled with 2H, 13C and 15N for solid support synthesis of sequence specifically labelled RNA is described. Labels were introduced in the ribose ring (13C), C5 position of pyrimidine nucleobases (2H) and exocyclic amino groups (15N) and serve as multiple probes for studying the various physicochemical consequences of physiologically important RNA folding by high-resolution multi-nuclear NMR spectroscopy. Copyright © 2001 John Wiley & Sons, Ltd.

  本文描述了核糖核苷酸块与2H、13C和15N的复合标记，用于序列特异性标记的RNA的固体支持合成。标记被引入核糖环（13C）、嘧啶核苷酸的C5位（2H）和外环氨基（15N），并作为多重探针，用于通过高分辨率多核核磁共振光谱研究生理上重要的RNA折叠的各种物理化学后果。版权所有 © 2001 John Wiley & Sons, Ltd.