5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-(benzoyl)-2'-deoxy-8-(pent-4-enylsulfanyl)adenosine | 316129-44-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-(benzoyl)-2'-deoxy-8-(pent-4-enylsulfanyl)adenosine
• 英文别名: N-[9-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-8-pent-4-enylsulfanylpurin-6-yl]benzamide
• CAS: 316129-44-9
• 化学式: C₄₃H₄₃N₅O₆S
• 分子量: 757.91
• InChiKey: SKLKAHCNDPVLIB-HKIDPNTFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.81
• 重原子数：
  55.0
• 可旋转键数：
  16.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  129.85
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-(benzoyl)-2'-deoxy-8-(pent-4-enylsulfanyl)adenosine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.5h， 以87%的产率得到N-[9-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-8-pent-4-enylsulfanylpurin-6-yl]benzamide
  参考文献：
  名称：

  Fluorescent Labelling of Oligodeoxyribonucleotides by the Oxyamino-Aldehyde Coupling Reaction

  摘要：

  We describe the reaction of oligonucleotides containing an aldehydic group at the 5'-end or inside the sequence with an oxyamino label. The reaction was found to be highly selective and represents an efficient method for derivatization of oligonucleotides.

  DOI：

  10.1080/15257770008033852
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧腺苷 在 吡啶 、 sodium hydrogensulfide 、 溴 、 sodium acetate 、 potassium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 15.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-(benzoyl)-2'-deoxy-8-(pent-4-enylsulfanyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  Fluorescent Labelling of Oligodeoxyribonucleotides by the Oxyamino-Aldehyde Coupling Reaction

  摘要：

  We describe the reaction of oligonucleotides containing an aldehydic group at the 5'-end or inside the sequence with an oxyamino label. The reaction was found to be highly selective and represents an efficient method for derivatization of oligonucleotides.

  DOI：

  10.1080/15257770008033852