N⁴-benzoyl-O^3'_,O5'-bis-(4,4'-dimethoxy-trityl)-2'-deoxy-cytidine | 107744-25-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N⁴-benzoyl-O^3'_,O5'-bis-(4,4'-dimethoxy-trityl)-2'-deoxy-cytidine
• 英文别名: N⁴-benzoyl-3',5'-O-bis(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine；N-benzoyl-3',5'-O-bis--desoxycytidin；N-[1-[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 107744-25-2
• 化学式: C₅₈H₅₃N₃O₉
• 分子量: 936.074
• InChiKey: PKUNJXXTPWLQAH-UZXRPXTDSA-N

物化性质

• 密度：
  1.21±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.4
• 重原子数：
  70
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 、 N-苯甲酰-2'-脱氧胞苷 在 碳酸氢钠 作用下， 以 吡啶 、 水 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 N4-苯甲酰基-5′-O-(4,4′-二甲氧基三苯基)-2′-脱氧胞苷 、 N⁴-benzoyl-O^3'_,O5'-bis-(4,4'-dimethoxy-trityl)-2'-deoxy-cytidine 、 N-苯甲酰基-3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧胞啶
  参考文献：
  名称：

  Method for purifying protected 2'-deoxycytidines and hydrated crystals thereof

  摘要：

  一种受保护的2'-脱氧胞苷通过从含有受保护的2'-脱氧胞苷和水的溶液中沉淀代表通式（3）的受保护的2'-脱氧胞苷的水合晶形式来纯化，并通过回收受保护的2'-脱氧胞苷来制备：其中R1代表4-甲氧三苯甲基、4,4'-二甲氧三苯甲基或三苯甲基基团；B1代表具有受保护氨基的胞嘧啶基团。特别地，通式（3）所代表的化合物是由式（4）所代表的受保护的2'-脱氧胞苷：2这种2'-脱氧胞苷用作反义DNA的原材料。

  公开号：

  US20030229223A1

文献信息

• Method for purifying protected 2'-deoxycytidines
  申请人：MITSUI CHEMICALS, INC.

  公开号：EP1369424A1

  公开（公告）日：2003-12-10

  A protected 2'-deoxycytidine is purified by precipitating the protected 2'-deoxycytidine represented by general formula (3) in the form of a hydrated crystal from a solution containing the protected 2'-deoxycytidine and water, and by recovering the protected 2'-deoxycytidine: wherein R1 represents a 4-methoxytrityl, 4, 4'-dimethoxytrityl, or triphenylmethyl group; and B1 represents a cytosine group having a protected amino group. The compound represented by general formula (3) may be, in particular, a protected 2'-deoxycytidine represented by formula (4): The 2'-deoxycytidine is used as a raw material for antisense DNA.

  从含有受保护的 2'-脱氧胞苷和水的溶液中沉淀通式 (3) 所代表的水合晶体形式的受保护的 2'-脱氧胞苷，并回收受保护的 2'-脱氧胞苷，从而纯化受保护的 2'-脱氧胞苷： 其中 R1 代表 4-甲氧基三苯甲基、4，4'-二甲氧基三苯甲基或三苯甲基基团；B1 代表具有受保护氨基的胞嘧啶基团。通式（3）代表的化合物尤其可以是由式（4）代表的受保护的 2'-脱氧胞苷： 2'-脱氧胞苷可用作反义 DNA 的原料。